102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1528 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  100 
 
 		 269 aa  557  1e-158  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  54.65 
 
 		 269 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  34.22 
 
 		 268 aa  98.6  8e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  34.22 
 
 		 268 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  32.11 
 
 		 264 aa  96.3  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  33.69 
 
 		 268 aa  95.9  7e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  35.33 
 
 		 268 aa  92.8  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  28.33 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  31.21 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  25.31 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  29.66 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.77 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  29.88 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  28.51 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  26.77 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  25.3 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  31.13 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4546  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.9 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  30.52 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.82 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.07 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  26.64 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2851  xylose isomerase domain-containing protein  24.9 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.46 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  23.7 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1174  hydroxypyruvate isomerase  26.96 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.970176  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  29.39 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  29.83 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.53 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.83 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.41 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4472  Hydroxypyruvate isomerase  27.78 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0435966  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  29.19 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0126  hexulose-6-phosphate isomerase  28.1 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0146  hexulose-6-phosphate isomerase  28.1 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.82 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0995  xylose isomerase-like TIM barrel  22.18 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  26.18 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  29.24 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  26.71 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2030  xylose isomerase domain-containing protein  28.92 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.16 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  27.37 
 
 		 244 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  24.73 
 
 		 253 aa  53.9  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3010  xylose isomerase-like TIM barrel  28.91 
 
 		 281 aa  53.1  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1494  xylose isomerase domain-containing protein  26.46 
 
 		 269 aa  53.5  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  24.64 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  24.85 
 
 		 287 aa  53.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.14 
 
 		 243 aa  53.1  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3671  putative D-tagatose 3-epimerase  27.66 
 
 		 295 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3406  xylose isomerase domain-containing protein  27.66 
 
 		 295 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4012  xylose isomerase domain-containing protein  24.88 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.167546  normal  0.990546 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  24.15 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0341  xylose isomerase domain-containing protein  25.79 
 
 		 233 aa  50.1  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.850352  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2110  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.93 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517822  normal  0.355951 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  28.35 
 
 		 262 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  27.62 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  23.72 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  30.82 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0249  xylose isomerase domain-containing protein  31.39 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.273491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  28.8 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3048  hypothetical protein  26.88 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.127987  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3575  xylose isomerase domain-containing protein  27.06 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2411  xylose isomerase domain-containing protein  24.77 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.446483 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4027  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.57 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.383869  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0649  xylose isomerase domain-containing protein  28 
 
 		 304 aa  47  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000488201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2094  xylose isomerase domain-containing protein  26 
 
 		 291 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.225095 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3479  hydroxypyruvate isomerase  26.63 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  22.41 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  29.27 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0391  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.27 
 
 		 279 aa  46.6  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2461  xylose isomerase-like TIM barrel  24.24 
 
 		 305 aa  46.2  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.15 
 
 		 264 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859546  normal  0.0990251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1263  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.57 
 
 		 297 aa  45.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4299  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.08 
 
 		 275 aa  45.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.172805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.05 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0394614 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0325  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.39 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.105989  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0509  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.37 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.440598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  37.65 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31430  Xylose isomerase-like TIM barrel protein, probably inolved in myo-inositol catabolism  28.23 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.161007  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.58 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0967776 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  24.71 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3174  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.63 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3105  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.9 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  24.1 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2604  xylose isomerase domain-containing protein  24.54 
 
 		 271 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2394  xylose isomerase domain-containing protein  22.86 
 
 		 259 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14000  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.56 
 
 		 254 aa  43.5  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.50908  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3371  Hydroxypyruvate isomerase  23.62 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.55933  normal  0.171039 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0440  xylose isomerase-like TIM barrel  22.59 
 
 		 323 aa  43.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.292372  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4045  xylose isomerase domain-containing protein  22.41 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  29.61 
 
 		 264 aa  43.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2118  hydroxypyruvate isomerase  29.03 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266277 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0891  Hydroxypyruvate isomerase  32.97 
 
 		 156 aa  43.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.155506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3837  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.58 
 
 		 290 aa  43.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746736  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2929  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.27 
 
 		 327 aa  43.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.712071  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2503  hydroxypyruvate isomerase  27.56 
 
 		 264 aa  42.7  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02720  sugar phosphate isomerase/epimerase  26.78 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  27.74 
 
 		 278 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2599  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.42 
 
 		 282 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>