240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1501 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  100 
 
 		 888 aa  1778    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  31.93 
 
 		 891 aa  401  9.999999999999999e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  31.99 
 
 		 890 aa  394  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  32.35 
 
 		 895 aa  383  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  52.59 
 
 		 1074 aa  364  4e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  25.95 
 
 		 926 aa  281  4e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  54.63 
 
 		 902 aa  231  5e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  50.25 
 
 		 924 aa  212  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  23.89 
 
 		 891 aa  108  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  29.59 
 
 		 993 aa  103  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  31.84 
 
 		 994 aa  102  5e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  25.06 
 
 		 1019 aa  100  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  27.17 
 
 		 993 aa  100  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  27.92 
 
 		 993 aa  100  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  33.33 
 
 		 789 aa  80.9  0.00000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  28.98 
 
 		 955 aa  75.1  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  29.2 
 
 		 702 aa  72.4  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  28.5 
 
 		 1007 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  22.04 
 
 		 802 aa  70.9  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  22.84 
 
 		 859 aa  70.1  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  27.87 
 
 		 1016 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  23.56 
 
 		 812 aa  69.3  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  26.87 
 
 		 904 aa  65.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  26.92 
 
 		 1008 aa  65.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  28.31 
 
 		 784 aa  64.7  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  27.96 
 
 		 1007 aa  64.7  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  24.4 
 
 		 1057 aa  64.7  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  22.34 
 
 		 1011 aa  63.9  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  29.02 
 
 		 859 aa  63.9  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  29.1 
 
 		 693 aa  63.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  26.4 
 
 		 851 aa  63.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  35.24 
 
 		 864 aa  62  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  28.49 
 
 		 1003 aa  62  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  33.06 
 
 		 987 aa  61.6  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  27.83 
 
 		 700 aa  61.6  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  23.65 
 
 		 702 aa  61.6  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  33.06 
 
 		 987 aa  61.2  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  21.18 
 
 		 804 aa  60.8  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  25.42 
 
 		 1019 aa  60.1  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  36.26 
 
 		 918 aa  60.1  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  26.29 
 
 		 859 aa  59.7  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  26.7 
 
 		 1214 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  26.7 
 
 		 1214 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  23.83 
 
 		 1025 aa  58.5  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  34.95 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  26.14 
 
 		 824 aa  58.5  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  28.57 
 
 		 813 aa  57.8  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  26.97 
 
 		 953 aa  57.8  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  27.33 
 
 		 1022 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  27.94 
 
 		 1008 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  25.81 
 
 		 1023 aa  57.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  24.24 
 
 		 824 aa  57.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  27.94 
 
 		 1008 aa  57  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0859  exonuclease SbcC  24.57 
 
 		 950 aa  56.6  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  26.22 
 
 		 1031 aa  56.2  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  31.53 
 
 		 421 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  27.27 
 
 		 1061 aa  55.5  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  21.67 
 
 		 1021 aa  55.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  27.33 
 
 		 1022 aa  55.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  26.12 
 
 		 1114 aa  54.7  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  24.02 
 
 		 1214 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  36.14 
 
 		 814 aa  54.3  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 702 aa  53.9  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  32.89 
 
 		 912 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  26.29 
 
 		 1151 aa  53.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  28.25 
 
 		 1192 aa  53.5  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  34.21 
 
 		 514 aa  53.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  25.41 
 
 		 1103 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  40 
 
 		 551 aa  53.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  23.76 
 
 		 984 aa  53.5  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  29.2 
 
 		 371 aa  52.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  22.22 
 
 		 1023 aa  52.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 935 aa  52  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  25.31 
 
 		 906 aa  52.4  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  29.2 
 
 		 380 aa  51.6  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  26.35 
 
 		 1179 aa  51.2  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2553  SMC domain protein  25.24 
 
 		 829 aa  51.2  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  25.26 
 
 		 1170 aa  51.2  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  24.61 
 
 		 1214 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  22.86 
 
 		 870 aa  50.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  29.2 
 
 		 380 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  25.13 
 
 		 1167 aa  50.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  20.96 
 
 		 790 aa  50.8  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  29.2 
 
 		 380 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121144 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  24.32 
 
 		 961 aa  50.8  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  26.26 
 
 		 1153 aa  50.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 794 aa  50.4  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.305534 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1213  SMC domain-containing protein  24.52 
 
 		 806 aa  50.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00040  DNA replication and repair protein RecF  30.09 
 
 		 414 aa  50.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  25.81 
 
 		 1232 aa  50.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  25.91 
 
 		 1150 aa  49.7  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  30 
 
 		 483 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  25.26 
 
 		 1170 aa  50.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  25.59 
 
 		 1190 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  21.63 
 
 		 1049 aa  49.3  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  23.04 
 
 		 1009 aa  49.3  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  22.67 
 
 		 840 aa  49.3  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0018  SMC domain protein  29.85 
 
 		 862 aa  48.9  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0623828 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  21.26 
 
 		 1091 aa  48.9  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  21.19 
 
 		 1190 aa  48.9  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>