25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1394 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1394  50S ribosomal protein L44e  100 
 
 		 92 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00510964  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1569  50S ribosomal protein L44e  76.09 
 
 		 92 aa  152  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2788  50S ribosomal protein L44e  55.91 
 
 		 93 aa  120  7e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0268055  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0418  50S ribosomal protein L44e  60.87 
 
 		 93 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258932  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2878  Ribosomal protein L44E  57.45 
 
 		 94 aa  117  7.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.362211 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1130  50S ribosomal protein L44e  58.7 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.888334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1301  50S ribosomal protein L44e  57.61 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0955  50S ribosomal protein L44e  55.43 
 
 		 92 aa  111  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.836007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1953  50S ribosomal protein L44e  55.43 
 
 		 92 aa  111  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.676794 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1011  50S ribosomal protein L44e  52.69 
 
 		 93 aa  110  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2500  Ribosomal protein L44E  53.76 
 
 		 93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0872  Ribosomal protein L44E  50.54 
 
 		 93 aa  102  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2049  50S ribosomal protein L44e  54.35 
 
 		 92 aa  100  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1011  50S ribosomal protein L44e  45.65 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0984  50S ribosomal protein L44e  45.74 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0962  50S ribosomal protein L44e  45.74 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0701  50S ribosomal protein L44e  43.01 
 
 		 94 aa  72  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.819978  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1697  50S ribosomal protein L44e  47.06 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1154  Ribosomal protein L44E  44.57 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1361  50S ribosomal protein L44e  38.71 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.170181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0644  50S ribosomal protein L44e  37.63 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000000450289  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2021  Ribosomal protein L44E  35.71 
 
 		 95 aa  50.4  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.157519  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1804  50S ribosomal protein L44e  34.69 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28038  Ribosomal protein L36a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  35.48 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.265485 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1579  50S ribosomal protein L44e  38.46 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>