49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1330 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1313  S-adenosylmethionine synthetase  74.81 
 
 
398 aa  637    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1330  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
401 aa  825    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0754836  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1744  S-adenosylmethionine synthetase  58.85 
 
 
401 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.153739  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0726  S-adenosylmethionine synthetase  56.08 
 
 
399 aa  479  1e-134  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0318344  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1064  S-adenosylmethionine synthetase  56.82 
 
 
400 aa  480  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329658  normal  0.097531 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0923  S-adenosylmethionine synthetase  56.65 
 
 
400 aa  477  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.878507  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0838  S-adenosylmethionine synthetase  54.34 
 
 
400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.318063  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0490  S-adenosylmethionine synthetase  54.93 
 
 
405 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.706606  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2306  Methionine adenosyltransferase  56.5 
 
 
400 aa  461  1e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.01761  normal  0.685937 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3461  Methionine adenosyltransferase  55.61 
 
 
401 aa  459  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1394  S-adenosylmethionine synthetase  54.84 
 
 
400 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1669  Methionine adenosyltransferase  55.61 
 
 
401 aa  448  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0513  S-adenosylmethionine synthetase  56.25 
 
 
400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1293  Methionine adenosyltransferase  52.99 
 
 
398 aa  443  1e-123  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0691116  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0461  S-adenosylmethionine synthetase  51.72 
 
 
403 aa  422  1e-117  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1768  S-adenosylmethionine synthetase  52.33 
 
 
405 aa  419  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0913  S-adenosylmethionine synthetase  52.09 
 
 
405 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  0.830566 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1031  S-adenosylmethionine synthetase  52.09 
 
 
405 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0945  S-adenosylmethionine synthetase  51.84 
 
 
404 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.939841  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1180  Methionine adenosyltransferase  46.31 
 
 
404 aa  379  1e-104  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0497405  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2333  S-adenosylmethionine synthetase  46.52 
 
 
403 aa  372  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.030297  hitchhiker  0.00106095 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1975  S-adenosylmethionine synthetase  45.54 
 
 
402 aa  369  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0691  S-adenosylmethionine synthetase  44.55 
 
 
402 aa  363  3e-99  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.234507 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0231  S-adenosylmethionine synthetase  43.73 
 
 
405 aa  359  6e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00947715 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0865  S-adenosylmethionine synthetase  44.39 
 
 
408 aa  356  2.9999999999999997e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0737  S-adenosylmethionine synthetase  44.2 
 
 
406 aa  349  5e-95  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0136402  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2103  S-adenosylmethionine synthetase  44.06 
 
 
402 aa  345  8.999999999999999e-94  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0745  S-adenosylmethionine synthetase  47.55 
 
 
399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000257427  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0510  S-adenosylmethionine synthetase  42.82 
 
 
401 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0095  S-adenosylmethionine synthetase  45.43 
 
 
400 aa  320  3e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000589385  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0746  S-adenosylmethionine synthetase  41.71 
 
 
404 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0921  S-adenosylmethionine synthetase  40 
 
 
404 aa  311  1e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0689  S-adenosylmethionine synthetase  41.16 
 
 
460 aa  301  9e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.918413 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1822  S-adenosylmethionine synthetase  40.6 
 
 
404 aa  301  9e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2839  S-adenosylmethionine synthetase  40 
 
 
400 aa  298  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1862  S-adenosylmethionine synthetase  38.97 
 
 
410 aa  297  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.238805 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1448  S-adenosylmethionine synthetase  39.1 
 
 
403 aa  286  5e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2549  S-adenosylmethionine synthetase  39.95 
 
 
400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000819809  hitchhiker  0.00000000000000187217 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3284  S-adenosylmethionine synthetase  39.59 
 
 
401 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0918  S-adenosylmethionine synthetase  39.06 
 
 
400 aa  282  9e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0247995  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0965  S-adenosylmethionine synthetase  41.48 
 
 
401 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.795652 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6197  S-adenosylmethionine synthetase  43.38 
 
 
394 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0551  S-adenosylmethionine synthetase  38.29 
 
 
404 aa  276  5e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.919029  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0186  S-adenosylmethionine synthetase  37.03 
 
 
400 aa  276  6e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1403  S-adenosylmethionine synthetase  38.24 
 
 
364 aa  272  6e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1694  S-adenosylmethionine synthetase  39.18 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5306  S-adenosylmethionine synthetase  39.18 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1136  S-adenosylmethionine synthetase  30.2 
 
 
408 aa  164  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208994  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3663  S-adenosylmethionine synthetase-like protein  38.57 
 
 
96 aa  47  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0172337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>