More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1313 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  100 
 
 		 191 aa  392  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  54.05 
 
 		 209 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  43.26 
 
 		 213 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  41.54 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  41.79 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  39.35 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  40.69 
 
 		 198 aa  114  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  37.13 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  42.86 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  35.62 
 
 		 194 aa  110  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0658  GrpE protein  39.57 
 
 		 410 aa  110  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  39.42 
 
 		 181 aa  110  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  37.96 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  38.17 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  37.84 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  41.18 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  35.66 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  32.29 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  38.57 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  34.04 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  35.26 
 
 		 195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2014  GrpE protein  39.57 
 
 		 361 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  33.68 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  39.31 
 
 		 212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  37.04 
 
 		 260 aa  108  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  37.06 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  39.58 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  38.18 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  33.16 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  38.3 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  41.98 
 
 		 174 aa  108  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  39.26 
 
 		 189 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  40.6 
 
 		 198 aa  107  9.000000000000001e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  36.55 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  33.68 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  37.5 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  38.03 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  34.55 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  38.03 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0764  GrpE protein  35.84 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  37.96 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  35.33 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  34.55 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  34.55 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  34.55 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  34.55 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  34.55 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  34.55 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  38.81 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  34.55 
 
 		 197 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  38.82 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  34.55 
 
 		 196 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  34.62 
 
 		 282 aa  105  4e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  36.53 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  33.54 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  36.36 
 
 		 194 aa  105  6e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  39.86 
 
 		 205 aa  104  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  33.85 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  33.85 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  33.85 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  37.18 
 
 		 203 aa  104  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  35.95 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  35.06 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  33.68 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  33.68 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  36.59 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  32.29 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  35.9 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  38.73 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0564  GrpE protein  32.61 
 
 		 211 aa  102  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  32.29 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  39.58 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  32.29 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  36.54 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  35.47 
 
 		 197 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000190441  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  34 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  34 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  36.11 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  31.9 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  37.5 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  33.9 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  36.84 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 194 aa  101  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0752  GrpE protein  34.62 
 
 		 184 aa  101  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  0.250608 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1513  heat shock protein GrpE  32.73 
 
 		 200 aa  100  9e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  37.11 
 
 		 206 aa  100  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  35.71 
 
 		 223 aa  100  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  37.04 
 
 		 186 aa  100  9e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  40.29 
 
 		 172 aa  100  9e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  40.29 
 
 		 172 aa  100  9e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  36.5 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1456  heat shock protein GrpE  32.73 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.022256  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  34.05 
 
 		 248 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  33.81 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  36.54 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  35.06 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  35.42 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  36.54 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>