More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1308 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  100 
 
 
406 aa  822  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  71 
 
 
407 aa  569  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  66.5 
 
 
408 aa  556  1e-157  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  57.91 
 
 
391 aa  461  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  52.16 
 
 
399 aa  405  1e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  48.7 
 
 
402 aa  365  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  48.72 
 
 
397 aa  365  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  49.74 
 
 
398 aa  349  5e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  47.44 
 
 
398 aa  347  3e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  44.44 
 
 
395 aa  311  2e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  40.69 
 
 
391 aa  276  7e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  39.7 
 
 
390 aa  270  4e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  39.55 
 
 
390 aa  268  1e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  38.94 
 
 
390 aa  267  3e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  39.55 
 
 
390 aa  265  1e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  35.34 
 
 
387 aa  202  1e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  32.42 
 
 
399 aa  199  8e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  35.91 
 
 
396 aa  183  5e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  36.29 
 
 
365 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  34.62 
 
 
402 aa  169  6e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  30.64 
 
 
416 aa  167  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  30.06 
 
 
386 aa  162  9e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  33.24 
 
 
396 aa  162  9e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  29.73 
 
 
385 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  29.7 
 
 
392 aa  150  5e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  30.43 
 
 
452 aa  148  2e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  31.27 
 
 
453 aa  147  4e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  29.33 
 
 
375 aa  147  5e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  27.92 
 
 
386 aa  146  5e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  31.05 
 
 
382 aa  140  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  27.42 
 
 
392 aa  140  4e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  28.25 
 
 
385 aa  140  6e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  30.81 
 
 
381 aa  138  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  28.65 
 
 
391 aa  136  6e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  32.23 
 
 
341 aa  135  2e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 
385 aa  130  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  30 
 
 
453 aa  130  3e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  26.48 
 
 
396 aa  127  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  7.99674e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 
453 aa  122  1e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  32.93 
 
 
363 aa  120  4e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  29.8 
 
 
458 aa  120  4e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  25.95 
 
 
384 aa  116  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  26.61 
 
 
453 aa  114  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  6.84168e-06 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  29.62 
 
 
348 aa  109  9e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 
360 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  31.37 
 
 
435 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  29.82 
 
 
418 aa  106  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 
409 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  27.25 
 
 
376 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  23.54 
 
 
410 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  30.95 
 
 
430 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  28.66 
 
 
425 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  29.62 
 
 
459 aa  100  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  26.89 
 
 
398 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  30.84 
 
 
457 aa  99.8  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1514  geranylgeranyl reductase  26.78 
 
 
485 aa  100  7e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00785047 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  29.33 
 
 
384 aa  100  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  30.97 
 
 
360 aa  99  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  29.04 
 
 
424 aa  99.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  30 
 
 
420 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  28.74 
 
 
423 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0881  geranylgeranyl reductase  27.16 
 
 
455 aa  97.8  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170951  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  27.81 
 
 
413 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  26.3 
 
 
376 aa  97.4  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0166  geranylgeranyl reductase  24.59 
 
 
453 aa  97.4  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  26.99 
 
 
398 aa  97.1  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 
432 aa  97.1  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  28.14 
 
 
423 aa  97.1  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  28.49 
 
 
423 aa  96.3  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  30.23 
 
 
362 aa  95.9  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  29.74 
 
 
445 aa  95.5  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  24.43 
 
 
414 aa  95.1  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  30.14 
 
 
426 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  28.96 
 
 
434 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  30.48 
 
 
411 aa  94.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  23.5 
 
 
378 aa  94.7  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  29.83 
 
 
434 aa  94  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  27.94 
 
 
388 aa  93.2  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 
429 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 
413 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 
430 aa  91.3  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  28.27 
 
 
389 aa  90.9  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  22.45 
 
 
410 aa  90.1  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  27.76 
 
 
406 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  26.97 
 
 
430 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  24.45 
 
 
405 aa  89.4  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  27.5 
 
 
375 aa  89.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  28.07 
 
 
385 aa  88.2  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  29.67 
 
 
369 aa  88.2  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0129  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 
436 aa  87.8  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3127  geranylgeranyl reductase  27.7 
 
 
458 aa  87.8  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.541663  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0513  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 
385 aa  87.4  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.349245  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  29.07 
 
 
398 aa  87  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  25.62 
 
 
385 aa  87  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  28.06 
 
 
406 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  27.3 
 
 
384 aa  86.7  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.25722e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  25.51 
 
 
431 aa  85.9  1e-15  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  23.86 
 
 
379 aa  85.9  1e-15  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  28.31 
 
 
394 aa  85.5  2e-15  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  28.31 
 
 
394 aa  85.5  2e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.571775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>