More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1250 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 361 aa  709    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  32.85 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  31.9 
 
 		 376 aa  176  8e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2479  MscS Mechanosensitive ion channel  28.49 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.827266 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  30.56 
 
 		 366 aa  169  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  30.46 
 
 		 359 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  30.7 
 
 		 369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  33.01 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  28.79 
 
 		 360 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  34.04 
 
 		 484 aa  155  7e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  30.57 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1300  MscS mechanosensitive ion channel  34.02 
 
 		 343 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.987941  hitchhiker  0.00895683 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2837  MscS Mechanosensitive ion channel  29.15 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.426677  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  28.9 
 
 		 362 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  28.34 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 381 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1210  MscS mechanosensitive ion channel  30.59 
 
 		 344 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  36.25 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  36.89 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  30.79 
 
 		 426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  32.41 
 
 		 685 aa  136  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  32.09 
 
 		 380 aa  132  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  35.79 
 
 		 636 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1267  MscS mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 351 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  35.79 
 
 		 636 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  26.71 
 
 		 348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  35.62 
 
 		 352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  31.78 
 
 		 354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  32.08 
 
 		 358 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  30.65 
 
 		 362 aa  126  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  33.5 
 
 		 378 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  34.92 
 
 		 637 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  31.82 
 
 		 806 aa  122  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  31.85 
 
 		 289 aa  122  9e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  38.17 
 
 		 299 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  32.81 
 
 		 864 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  31.47 
 
 		 348 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000167428  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  34.8 
 
 		 341 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  34.9 
 
 		 360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  33.51 
 
 		 784 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  34.9 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 560 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  29.95 
 
 		 400 aa  116  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  30.1 
 
 		 421 aa  116  7.999999999999999e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  30.81 
 
 		 1158 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  34.59 
 
 		 843 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  33.97 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  30.67 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  29.82 
 
 		 408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  26.53 
 
 		 467 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  33.01 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  34.38 
 
 		 359 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  26.07 
 
 		 338 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  26.79 
 
 		 388 aa  113  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  32.83 
 
 		 1115 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  33.33 
 
 		 1117 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  32.64 
 
 		 266 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  34.3 
 
 		 1110 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  34.24 
 
 		 840 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  32.32 
 
 		 1111 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  29.22 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  28.16 
 
 		 429 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  26.77 
 
 		 406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  32.1 
 
 		 538 aa  110  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  30.95 
 
 		 291 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05088  hypothetical protein  31.42 
 
 		 399 aa  109  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  34.15 
 
 		 753 aa  109  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  29.18 
 
 		 344 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  29.95 
 
 		 1117 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  27.57 
 
 		 662 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  36.26 
 
 		 1128 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  34.5 
 
 		 861 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  31.98 
 
 		 807 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  30.62 
 
 		 277 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  31.82 
 
 		 1110 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1419  mechanosensitive ion channel family protein  32.4 
 
 		 278 aa  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  33.62 
 
 		 540 aa  107  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0442  MscS Mechanosensitive ion channel  32.45 
 
 		 279 aa  107  5e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  31.51 
 
 		 1235 aa  106  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  31.79 
 
 		 1102 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  30.65 
 
 		 322 aa  107  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  31.79 
 
 		 1102 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  32.16 
 
 		 1118 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  32.16 
 
 		 1118 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  32.16 
 
 		 1118 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  32.16 
 
 		 1120 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  35.18 
 
 		 447 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07431  small mechanosensitive ion channel  29.86 
 
 		 343 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.1802 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  32.16 
 
 		 1120 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  33.33 
 
 		 1134 aa  106  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  35.71 
 
 		 877 aa  105  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  32.63 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  32.16 
 
 		 1120 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  33.7 
 
 		 531 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  28.63 
 
 		 981 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  32.16 
 
 		 1120 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  32.16 
 
 		 1120 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  30.08 
 
 		 1120 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  32.63 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  30.61 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>