More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1229 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 422 aa  859    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1462  glutamyl-tRNA reductase  62.29 
 
 		 449 aa  512  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0049  glutamyl-tRNA reductase  54.84 
 
 		 411 aa  449  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2132  glutamyl-tRNA reductase  40.05 
 
 		 447 aa  275  8e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0980  glutamyl-tRNA reductase  42.94 
 
 		 423 aa  265  1e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1728  glutamyl-tRNA reductase  39.8 
 
 		 425 aa  253  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  37.82 
 
 		 464 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0523  glutamyl-tRNA reductase  40.11 
 
 		 424 aa  248  1e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.467395  normal  0.599346 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  36.66 
 
 		 446 aa  247  4e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1612  glutamyl-tRNA reductase  36.74 
 
 		 447 aa  246  6e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.284753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3246  glutamyl-tRNA reductase  36.32 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1219  glutamyl-tRNA reductase  35.17 
 
 		 457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  34.99 
 
 		 441 aa  242  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0859  glutamyl-tRNA reductase  39.95 
 
 		 382 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146184  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1238  glutamyl-tRNA reductase  40.54 
 
 		 424 aa  240  4e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  39.41 
 
 		 464 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2825  glutamyl-tRNA reductase  38.01 
 
 		 438 aa  237  3e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2562  glutamyl-tRNA reductase  38 
 
 		 424 aa  236  6e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  39.4 
 
 		 382 aa  234  3e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0052  glutamyl-tRNA reductase  39.94 
 
 		 383 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0279425  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  35.41 
 
 		 441 aa  233  5e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1588  glutamyl-tRNA reductase  40.41 
 
 		 382 aa  230  4e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.082883  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  36.99 
 
 		 434 aa  229  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  36.06 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  40.06 
 
 		 379 aa  227  3e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  35.22 
 
 		 443 aa  226  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  34.46 
 
 		 438 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0510  glutamyl-tRNA reductase  30.83 
 
 		 421 aa  224  3e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  31.5 
 
 		 458 aa  223  4.9999999999999996e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  35 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  35.05 
 
 		 420 aa  219  8.999999999999998e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  35.1 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  35.29 
 
 		 436 aa  217  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  33.1 
 
 		 440 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 		 434 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  35.08 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  34.62 
 
 		 436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2065  glutamyl-tRNA reductase  34.96 
 
 		 431 aa  213  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  35.14 
 
 		 416 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  34.96 
 
 		 422 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  34.82 
 
 		 434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2283  glutamyl-tRNA reductase  35.64 
 
 		 424 aa  213  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0118  glutamyl-tRNA reductase  34.96 
 
 		 413 aa  213  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000526977  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  32.83 
 
 		 444 aa  212  9e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  32.49 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  32.22 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  32.49 
 
 		 444 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  32.49 
 
 		 444 aa  211  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  32.49 
 
 		 444 aa  210  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  32.49 
 
 		 444 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  32.49 
 
 		 444 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  33.87 
 
 		 465 aa  211  3e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2256  glutamyl-tRNA reductase  35.37 
 
 		 424 aa  210  4e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  38.12 
 
 		 398 aa  210  4e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  32.28 
 
 		 446 aa  209  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  32.55 
 
 		 420 aa  209  8e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  33 
 
 		 454 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  33.59 
 
 		 418 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  34.15 
 
 		 432 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  33.93 
 
 		 446 aa  207  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  34.21 
 
 		 432 aa  207  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  33.92 
 
 		 458 aa  207  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  32.58 
 
 		 418 aa  207  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  34.84 
 
 		 424 aa  206  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  34.42 
 
 		 418 aa  206  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  32.06 
 
 		 444 aa  206  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  32.46 
 
 		 451 aa  206  8e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  33.9 
 
 		 432 aa  206  8e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.79 
 
 		 423 aa  206  9e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  32.35 
 
 		 443 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  34.46 
 
 		 450 aa  205  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  34.32 
 
 		 434 aa  205  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  32.37 
 
 		 443 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  34.55 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  32.25 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  32.25 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  32.51 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  34.44 
 
 		 422 aa  203  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  35.01 
 
 		 425 aa  202  7e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  32.27 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  32.02 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  36.07 
 
 		 421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.92 
 
 		 419 aa  199  7e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  33.85 
 
 		 418 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  33.85 
 
 		 418 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  33.85 
 
 		 418 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  32.62 
 
 		 426 aa  199  9e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  33.85 
 
 		 418 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 416 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 416 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 416 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0722  glutamyl-tRNA reductase  33.82 
 
 		 427 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  33.58 
 
 		 431 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  33.83 
 
 		 416 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  32.78 
 
 		 443 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  33.08 
 
 		 421 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  33.68 
 
 		 418 aa  197  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  34.47 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  32.55 
 
 		 453 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  35.68 
 
 		 432 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>