102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1131 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1131  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  100 
 
 
279 aa  580  1.0000000000000001e-165  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000211663  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2006  8-oxoguanine DNA glycosylase  60.07 
 
 
283 aa  353  1e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000592743  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0653  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  40.74 
 
 
285 aa  211  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00629996  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0662  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  39.27 
 
 
286 aa  204  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1472  hypothetical protein  37.87 
 
 
299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.427011  hitchhiker  0.0000874821 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3329  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  37.32 
 
 
295 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00424191  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0552  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  34.94 
 
 
285 aa  178  7e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.729182  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2068  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  37.55 
 
 
295 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1540  HhH-GPD family protein  33.82 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000245501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1020  8-oxoguanine DNA glycosylase-like  34.41 
 
 
299 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0506  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  35.97 
 
 
297 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000424697  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0815  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  34.4 
 
 
306 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2279  8-oxoguanine DNA glycosylase, putative  33.67 
 
 
312 aa  158  9e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2577  putative 8-oxoguanine DNA glycosylase  33.67 
 
 
312 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1385  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  33.94 
 
 
300 aa  158  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.391091  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1065  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  36.5 
 
 
284 aa  156  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00474744  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2022  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  36.17 
 
 
272 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1087  HhH-GPD  29.1 
 
 
311 aa  126  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.626477  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35111  8-oxoguanine DNA glycosylase  31.58 
 
 
336 aa  126  4.0000000000000003e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1164  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  31.49 
 
 
312 aa  124  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.561807 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0823  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  31.53 
 
 
307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2444  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  31.53 
 
 
309 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.08 
 
 
293 aa  119  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.157692  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1980  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.7 
 
 
334 aa  119  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.145682 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06682  mitochondrial glycosylase/lyase (Eurofung)  28.17 
 
 
414 aa  112  8.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1517  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  30.98 
 
 
308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.0048672 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1405  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  27.55 
 
 
313 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273157 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1313  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  28.85 
 
 
312 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1017  HhH-GPD  30.85 
 
 
312 aa  107  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0765881  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1208  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  31.6 
 
 
312 aa  106  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2407  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  29.59 
 
 
302 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363205  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1267  HhH-GPD family protein  27.54 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318619  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4304  predicted protein  29.31 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02890  purine-specific oxidized base lesion DNA N-glycosylase, putative  27.32 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.17 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.66 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3870  DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  27.11 
 
 
517 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3944  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada  27.11 
 
 
517 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.445653  hitchhiker  0.00805865 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3856  DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  26.95 
 
 
496 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26438  hitchhiker  0.00733732 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3510  DNA-3-methyladenine glycosylase II  24.2 
 
 
303 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.043579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  23.7 
 
 
288 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.67 
 
 
270 aa  52.4  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3774  DNA-3-methyladenine glycosidase  24.2 
 
 
303 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.727577  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  29.08 
 
 
285 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3587  DNA-3-methyladenine glycosidase  25 
 
 
303 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.655108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3499  DNA-3-methyladenine glycosidase  25 
 
 
303 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.596222  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3871  DNA-3-methyladenine glycosidase  25 
 
 
303 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1457  DNA-3-methyladenine glycosidase  24.2 
 
 
303 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000180203 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3753  DNA-3-methyladenine glycosidase  25 
 
 
303 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000204691 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0522  HhH-GPD  23.21 
 
 
309 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.454329 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11344  Ada regulatory protein alkA  25.6 
 
 
496 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.334528  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  26.81 
 
 
215 aa  50.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3842  DNA-3-methyladenine glycosidase  24.2 
 
 
303 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.92 
 
 
236 aa  49.7  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3487  DNA-3-methyladenine glycosidase  24.42 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.604427  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  39.44 
 
 
218 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3585  DNA-3-methyladenine glycosidase II  28.9 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3755  AraC family transcriptional regulator  22.79 
 
 
489 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051726  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  46.67 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  30.37 
 
 
218 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  36.84 
 
 
219 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3790  DNA-3-methyladenine glycosidase  25 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1064  HhH-GPD family protein  22.99 
 
 
300 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7756  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 
564 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1101  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.45 
 
 
204 aa  47.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00131579  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42700  DNA-3-methyladenine glycosidase II  29.17 
 
 
297 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.34 
 
 
218 aa  47.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3357  transcriptional regulator Ada / DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  27.94 
 
 
486 aa  46.6  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  47.5 
 
 
278 aa  46.6  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0150  endonuclease III  29.35 
 
 
215 aa  46.2  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1195  putative EndoIII-related endonuclease  29.5 
 
 
228 aa  45.8  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.643643  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  31.25 
 
 
225 aa  45.4  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4322  alcohol dehydrogenase  23.35 
 
 
495 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0749959 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0819  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  28.78 
 
 
218 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.15 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  39.29 
 
 
219 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2923  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  23.5 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  28.47 
 
 
225 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1888  alcohol dehydrogenase  26.14 
 
 
292 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753852  normal  0.559526 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.41 
 
 
230 aa  43.9  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4286  HhH-GPD family protein  42.42 
 
 
224 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2419  AlkA domain protein  22.22 
 
 
302 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.839778  hitchhiker  0.00593166 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.21 
 
 
222 aa  43.9  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.169395 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10840  hypothetical base excision DNA repair protein (Eurofung)  44.44 
 
 
502 aa  43.5  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00957228  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2505  putative transcription regulator protein  24 
 
 
490 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0201165 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  35.05 
 
 
209 aa  43.5  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  30.6 
 
 
211 aa  43.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2937  endonuclease III  25.52 
 
 
281 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206628 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0044  Ada metal-binding domain-containing protein  29.21 
 
 
513 aa  43.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  36.84 
 
 
211 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0761  endonuclease III  25.35 
 
 
220 aa  42.7  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.169913  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  28.36 
 
 
224 aa  42.7  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0399  DNA-3-methyladenine glycosylase II (3-methyladenine-DNA glycosidase)  23.56 
 
 
287 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  25.87 
 
 
233 aa  42.7  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  33.8 
 
 
222 aa  42.7  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0197  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  34.67 
 
 
213 aa  42.7  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000114708  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.56 
 
 
222 aa  42.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0405  HhH-GPD family protein  25.17 
 
 
287 aa  42.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0121  HhH-GPD family protein  25.29 
 
 
333 aa  42.7  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000756832  normal  0.180452 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  23.7 
 
 
212 aa  42.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.377332 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>