47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1126 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1126  CRISPR-associated Cas4 family protein  100 
 
 
199 aa  410  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00956788  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0302  hypothetical protein  55.79 
 
 
199 aa  216  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00784243  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0918  CRISPR-associated protein Cas4  45.68 
 
 
162 aa  144  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000176613 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0126  CRISPR-associated protein Cas4  40.85 
 
 
171 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2004  CRISPR-associated protein Cas4  42.86 
 
 
165 aa  134  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0672  CRISPR-associated protein Cas4  43.37 
 
 
169 aa  131  7.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2660  CRISPR-associated protein Cas4  40.12 
 
 
185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0914  CRISPR-associated Cas4 family protein  39.18 
 
 
173 aa  125  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0131013  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1728  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.58 
 
 
177 aa  119  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0309  CRISPR-associated protein Cas4  36.9 
 
 
165 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2023  CRISPR-associated Cas4 family protein  38.18 
 
 
165 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.84369  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2298  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.42 
 
 
170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1083  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.33 
 
 
172 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1638  CRISPR-associated protein Cas4  31.84 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270939  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0447  CRISPR-associated protein Cas4  38.18 
 
 
166 aa  108  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2837  CRISPR-associated protein Cas4  27.37 
 
 
186 aa  107  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.679978  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0540  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.33 
 
 
168 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0976  CRISPR-associated protein Cas4  32.32 
 
 
177 aa  105  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2517  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  105  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1812  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.57 
 
 
178 aa  105  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233304  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1229  CRISPR-associated protein Cas4  37.65 
 
 
167 aa  103  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3932  CRISPR-associated protein Cas4  33.74 
 
 
169 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1187  CRISPR-associated protein Cas4  35.12 
 
 
169 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0941  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.13 
 
 
163 aa  102  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2429  CRISPR-associated protein Cas4  30.86 
 
 
165 aa  99  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2318  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.97 
 
 
165 aa  97.8  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4287  CRISPR-associated protein Cas4  30.95 
 
 
169 aa  95.9  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2015  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.5 
 
 
170 aa  95.5  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1020  CRISPR-associated protein Cas4  32.93 
 
 
161 aa  95.5  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000334057  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0902  CRISPR-associated protein Cas4  37.72 
 
 
163 aa  94.7  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.057649  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3328  CRISPR-associated protein Cas4  29.88 
 
 
189 aa  94  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0349  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.54 
 
 
158 aa  90.5  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1450  CRISPR-associated protein Cas4  29.55 
 
 
192 aa  89.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0266  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  29.19 
 
 
162 aa  86.7  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1878  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.12 
 
 
170 aa  85.1  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0620  CRISPR-associated protein Cas4  35.19 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0664  CRISPR-associated protein Cas4  34.52 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0807388  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3001  CRISPR-associated protein Cas4  32.73 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0454064  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1000  hypothetical protein  28.05 
 
 
172 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0936  CRISPR-associated protein Cas4  26.51 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1804  RecB family exonuclease  31.93 
 
 
162 aa  63.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1423  CRISPR-associated protein Cas4  28.4 
 
 
166 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.283584  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1022  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.43 
 
 
159 aa  63.2  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1289  CRISPR-associated protein Cas4  28.66 
 
 
165 aa  59.3  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1391  hypothetical protein  26.51 
 
 
171 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.268781  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0395  CRISPR-associated protein Cas4  31.34 
 
 
127 aa  49.7  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0424779  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0755  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.19 
 
 
178 aa  41.6  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.714771  normal  0.862744 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>