More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1063 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  100 
 
 
478 aa  953    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  65.48 
 
 
479 aa  666    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  57.95 
 
 
476 aa  548  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  53.59 
 
 
483 aa  499  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  43.94 
 
 
524 aa  434  1e-120  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  44.17 
 
 
479 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  43.45 
 
 
481 aa  412  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  39.7 
 
 
466 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  43.94 
 
 
482 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  42.65 
 
 
483 aa  372  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  42.68 
 
 
477 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  39.67 
 
 
482 aa  365  1e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  40.54 
 
 
481 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0698  cation transporter  42.2 
 
 
505 aa  355  1e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  41.37 
 
 
481 aa  353  5e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  41.77 
 
 
482 aa  350  2e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  40.96 
 
 
481 aa  350  3e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  39.3 
 
 
485 aa  349  7e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  40.75 
 
 
481 aa  348  1e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  40.25 
 
 
494 aa  348  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2082  cation transporter  39.49 
 
 
514 aa  345  8.999999999999999e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  37.01 
 
 
510 aa  345  1e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  39.38 
 
 
485 aa  344  2e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  38.48 
 
 
483 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  39.38 
 
 
482 aa  342  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1208  cation transporter  40.04 
 
 
512 aa  340  4e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432956  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  41.72 
 
 
485 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  37.8 
 
 
480 aa  335  1e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  39.67 
 
 
483 aa  333  3e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  35.93 
 
 
491 aa  332  7.000000000000001e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  39.27 
 
 
498 aa  331  2e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  38.33 
 
 
485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  40.79 
 
 
486 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  39.26 
 
 
482 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  36.65 
 
 
479 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  38.95 
 
 
478 aa  324  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  38.17 
 
 
483 aa  323  4e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  37.81 
 
 
481 aa  322  9.999999999999999e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1876  cation transporter  37.43 
 
 
520 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  40.92 
 
 
484 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  40.33 
 
 
491 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  38.81 
 
 
483 aa  318  2e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  36.85 
 
 
485 aa  317  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  38.81 
 
 
485 aa  317  3e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  37.76 
 
 
483 aa  316  6e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  39.22 
 
 
483 aa  315  8e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  37.24 
 
 
485 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  36.91 
 
 
487 aa  311  1e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  36.16 
 
 
498 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  35.59 
 
 
480 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1412  cation transporter  36.72 
 
 
516 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  38.31 
 
 
484 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1184  cation transporter  37.7 
 
 
512 aa  306  6e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.543653  hitchhiker  0.000000321699 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1061  cation transporter  40.58 
 
 
494 aa  306  6e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316379  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  36.63 
 
 
488 aa  305  9.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  38.57 
 
 
488 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  36.51 
 
 
485 aa  304  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  38.22 
 
 
484 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  40.45 
 
 
483 aa  303  6.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  37.74 
 
 
484 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1185  cation transporter  34.01 
 
 
502 aa  301  1e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000630162 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2976  Trk system potassium uptake protein TrkH  39.67 
 
 
485 aa  302  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  38.33 
 
 
486 aa  301  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  36.31 
 
 
488 aa  300  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  37.9 
 
 
485 aa  300  4e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  37.88 
 
 
485 aa  300  4e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1730  cation transporter  35.62 
 
 
509 aa  300  4e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  35.64 
 
 
481 aa  299  6e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3898  potassium transporter  39.88 
 
 
483 aa  299  6e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000274395  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  36.76 
 
 
485 aa  299  7e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  36.31 
 
 
488 aa  299  9e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  36.46 
 
 
480 aa  298  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  37.98 
 
 
484 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0265  potassium transporter  38.45 
 
 
483 aa  297  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00329538  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0768  cation transporter  38.16 
 
 
473 aa  296  4e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.369941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4216  potassium transporter  39.55 
 
 
483 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000196268  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4265  potassium transporter  39.55 
 
 
483 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0305009  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4372  potassium transporter  39.55 
 
 
483 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170672  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4193  potassium transporter  39.55 
 
 
483 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000606727  normal  0.556467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4312  potassium transporter  39.55 
 
 
483 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0637309  normal  0.15299 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  37.09 
 
 
485 aa  296  7e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  34.8 
 
 
481 aa  296  7e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4230  potassium transporter  39.6 
 
 
483 aa  296  7e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000116067  normal  0.0142841 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  34.12 
 
 
484 aa  296  8e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  35.23 
 
 
481 aa  295  9e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  36.01 
 
 
485 aa  295  9e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4132  potassium uptake protein, TrkH family  39.39 
 
 
483 aa  295  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000031848  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  34.16 
 
 
485 aa  295  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4072  potassium transporter  39.39 
 
 
483 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258715  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4161  potassium transporter  39.39 
 
 
483 aa  295  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100489  decreased coverage  0.00000337879 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4319  potassium transporter  39.39 
 
 
483 aa  295  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000419761  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5288  potassium transporter  39.39 
 
 
483 aa  295  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000758223  normal  0.0471596 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4368  potassium transporter  39.39 
 
 
483 aa  295  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385721  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  35.83 
 
 
480 aa  295  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3744  potassium transporter  39.79 
 
 
483 aa  294  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000338344  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  36.31 
 
 
485 aa  295  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  34.12 
 
 
484 aa  294  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  36.79 
 
 
485 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  36.79 
 
 
485 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  36.79 
 
 
485 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>