More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1015 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  100 
 
 		 310 aa  637    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  47.73 
 
 		 323 aa  298  6e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  44.41 
 
 		 300 aa  275  7e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  41.33 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  42 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  41.03 
 
 		 290 aa  248  9e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  39.67 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  39.74 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  39.34 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  39.71 
 
 		 344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  40.07 
 
 		 285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  39.55 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  39.71 
 
 		 288 aa  215  5.9999999999999996e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  38.08 
 
 		 294 aa  215  8e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  37.54 
 
 		 302 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  36.27 
 
 		 307 aa  212  7e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  37.38 
 
 		 310 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2423  periplasmic solute binding protein  38.33 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.890095  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  38.77 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2208  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  36.59 
 
 		 345 aa  209  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.353615  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  36.63 
 
 		 292 aa  209  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  36.04 
 
 		 300 aa  209  5e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  37.66 
 
 		 313 aa  208  9e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  36.52 
 
 		 335 aa  207  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  34.22 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  39.93 
 
 		 299 aa  202  6e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  33.22 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  32.47 
 
 		 282 aa  193  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  35.64 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  37.15 
 
 		 296 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0025  periplasmic solute binding protein  34.11 
 
 		 293 aa  189  7e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  36.14 
 
 		 302 aa  188  8e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1759  adhesion protein, putative  33.45 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0156  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  33 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0179  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  33.66 
 
 		 296 aa  172  5e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0138  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  33.33 
 
 		 296 aa  170  2e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  31.69 
 
 		 345 aa  164  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  35.38 
 
 		 296 aa  159  7e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  32.5 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0039  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  33.94 
 
 		 278 aa  155  9e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  28.81 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  31.08 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1731  periplasmic solute binding protein  41.81 
 
 		 469 aa  143  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  30.07 
 
 		 309 aa  142  9e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  32.63 
 
 		 298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  32.28 
 
 		 298 aa  139  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  33.1 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  27.94 
 
 		 314 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  31.46 
 
 		 368 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  28.87 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  30.43 
 
 		 332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3805  periplasmic solute binding protein  28.3 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0163421  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  30.87 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  28.99 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  27.82 
 
 		 326 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  30.03 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.87 
 
 		 514 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  30.53 
 
 		 316 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  30.53 
 
 		 316 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  30.18 
 
 		 316 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  29.82 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  30.18 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  30.18 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  27.46 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  29.82 
 
 		 316 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  29.05 
 
 		 313 aa  123  5e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  29.59 
 
 		 323 aa  122  6e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  28.04 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  25.88 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  27.37 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  26.62 
 
 		 339 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  30.34 
 
 		 316 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  29.28 
 
 		 365 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.08 
 
 		 349 aa  118  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  28.06 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 		 308 aa  116  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0057  periplasmic solute binding protein  25.08 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  30.92 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  27.97 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  28.14 
 
 		 333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  27.73 
 
 		 304 aa  112  6e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  27.27 
 
 		 322 aa  112  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  26.91 
 
 		 304 aa  112  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  29.96 
 
 		 321 aa  112  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.15 
 
 		 320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  28.27 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  26.39 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  28.9 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  29.44 
 
 		 346 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  28 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  25.29 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  27.69 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  27.46 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  26.39 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  27.31 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  29.96 
 
 		 294 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  27.76 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 		 295 aa  106  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>