More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1013 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 
385 aa  792    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  71.8 
 
 
385 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  61.58 
 
 
382 aa  508  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  60.26 
 
 
384 aa  500  1e-140  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  61.1 
 
 
388 aa  497  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  59.9 
 
 
382 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  58.7 
 
 
382 aa  486  1e-136  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  57.96 
 
 
382 aa  471  1e-132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  58.14 
 
 
384 aa  451  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.23 
 
 
389 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.59 
 
 
390 aa  442  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  53.93 
 
 
388 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.43 
 
 
387 aa  437  1e-121  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  53.4 
 
 
388 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.23 
 
 
391 aa  432  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  53.26 
 
 
389 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  51.18 
 
 
401 aa  424  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  50.26 
 
 
388 aa  421  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.85 
 
 
392 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  48.94 
 
 
390 aa  412  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  48.68 
 
 
388 aa  409  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.18 
 
 
390 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  49.34 
 
 
391 aa  401  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.65 
 
 
392 aa  393  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  50.66 
 
 
387 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  45.77 
 
 
386 aa  378  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  46.7 
 
 
389 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  43.19 
 
 
392 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  45.43 
 
 
390 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  44.91 
 
 
403 aa  365  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  44.65 
 
 
389 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  43.57 
 
 
391 aa  365  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2313  aminotransferase class I and II  43.98 
 
 
393 aa  362  9e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  44.65 
 
 
392 aa  360  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1415  aminotransferase  43.46 
 
 
397 aa  360  2e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  43.6 
 
 
402 aa  359  4e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  42.93 
 
 
393 aa  359  4e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  45.69 
 
 
388 aa  359  4e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  42.93 
 
 
400 aa  359  4e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  44.65 
 
 
396 aa  359  6e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  41.76 
 
 
395 aa  358  7e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1569  aminotransferase  43.19 
 
 
397 aa  358  9.999999999999999e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  39.79 
 
 
390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  44.76 
 
 
392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  42.55 
 
 
399 aa  354  1e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  42.3 
 
 
400 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0292  aminotransferase class I and II  41.36 
 
 
391 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  44.47 
 
 
392 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  44.33 
 
 
392 aa  352  4e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  44.33 
 
 
392 aa  352  4e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  44.33 
 
 
392 aa  352  4e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  44.33 
 
 
392 aa  352  4e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  44.06 
 
 
392 aa  351  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0598  aminotransferase  42.18 
 
 
394 aa  350  2e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  43.86 
 
 
394 aa  350  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  42.02 
 
 
409 aa  349  6e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  43.72 
 
 
406 aa  349  6e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  43.6 
 
 
394 aa  348  7e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  45.19 
 
 
395 aa  348  7e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  42.18 
 
 
393 aa  348  9e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  42.18 
 
 
393 aa  348  9e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  42.3 
 
 
392 aa  348  9e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  42.02 
 
 
412 aa  347  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1823  aminotransferase  41.88 
 
 
407 aa  347  2e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  40.84 
 
 
397 aa  347  3e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  42.3 
 
 
391 aa  346  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  43.34 
 
 
392 aa  346  4e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  41.76 
 
 
411 aa  346  5e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2748  aminotransferase  41.76 
 
 
412 aa  345  8.999999999999999e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  41.76 
 
 
412 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  41.76 
 
 
412 aa  345  1e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  41.76 
 
 
412 aa  345  1e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  41.76 
 
 
412 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  41.76 
 
 
412 aa  345  1e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1252  aminotransferase  41.49 
 
 
396 aa  344  1e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000164192  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  41.76 
 
 
412 aa  344  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.890867 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  41.76 
 
 
412 aa  345  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  41.76 
 
 
412 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  41.76 
 
 
412 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  41.76 
 
 
412 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  41.76 
 
 
412 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  41.76 
 
 
412 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1447  aminotransferase class I and II  41.13 
 
 
398 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000395976  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  40.05 
 
 
394 aa  341  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62400  aminotransferase  40.69 
 
 
411 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1411  aminotransferase class I and II  40.31 
 
 
394 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80446 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5431  aminotransferase  40.69 
 
 
411 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2945  aminotransferase class I and II  41.62 
 
 
425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0558031  hitchhiker  0.0087233 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2726  aminotransferase  40.96 
 
 
411 aa  336  2.9999999999999997e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1334  aminotransferase  40.96 
 
 
411 aa  336  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2866  aminotransferase  40.43 
 
 
413 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1446  aminotransferase  40.96 
 
 
411 aa  336  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  40.96 
 
 
402 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1394  aminotransferase class I and II  41.22 
 
 
408 aa  335  9e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  40.43 
 
 
407 aa  334  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1407  aminotransferase  39.89 
 
 
413 aa  334  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0957  aspartate aminotransferase  40 
 
 
404 aa  333  2e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000423208  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  40.69 
 
 
411 aa  334  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  40.16 
 
 
411 aa  334  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0840  aminotransferase  40.43 
 
 
402 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450019  normal  0.811052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>