More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0972 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  100 
 
 
537 aa  1078    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  53.75 
 
 
547 aa  585  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  49.43 
 
 
543 aa  495  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  48.3 
 
 
542 aa  491  1e-137  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  48.94 
 
 
543 aa  483  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  47.66 
 
 
551 aa  474  1e-132  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  46.05 
 
 
545 aa  474  1e-132  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  46.05 
 
 
542 aa  473  1e-132  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  46.54 
 
 
555 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  45.86 
 
 
542 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  45.47 
 
 
543 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  48.17 
 
 
543 aa  464  1e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  45.91 
 
 
559 aa  464  1e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  46.02 
 
 
558 aa  463  1e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  45.65 
 
 
563 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  44.51 
 
 
560 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  45.98 
 
 
539 aa  446  1.0000000000000001e-124  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  45.52 
 
 
530 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  47.3 
 
 
551 aa  443  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  47.49 
 
 
552 aa  444  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  45.77 
 
 
541 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  46.14 
 
 
551 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  45.98 
 
 
548 aa  432  1e-120  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  45.77 
 
 
529 aa  432  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  43.39 
 
 
557 aa  434  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  46.01 
 
 
500 aa  426  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  44.42 
 
 
553 aa  428  1e-118  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  46.69 
 
 
552 aa  424  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  43.33 
 
 
536 aa  424  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  45.3 
 
 
553 aa  423  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  43.96 
 
 
540 aa  420  1e-116  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  42.63 
 
 
570 aa  422  1e-116  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  41.9 
 
 
557 aa  417  9.999999999999999e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  43.03 
 
 
545 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  45.19 
 
 
547 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.49 
 
 
527 aa  414  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  43.92 
 
 
552 aa  412  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  45.59 
 
 
554 aa  414  1e-114  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  42.15 
 
 
554 aa  410  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  45.23 
 
 
549 aa  411  1e-113  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  43.8 
 
 
532 aa  409  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  45.98 
 
 
550 aa  411  1e-113  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  42.75 
 
 
559 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  42.53 
 
 
555 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  44.34 
 
 
558 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  40.54 
 
 
554 aa  401  9.999999999999999e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  43.08 
 
 
561 aa  401  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  40.99 
 
 
553 aa  396  1e-109  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  40.08 
 
 
558 aa  390  1e-107  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  42.05 
 
 
528 aa  387  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  42.47 
 
 
562 aa  385  1e-105  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  42.24 
 
 
554 aa  383  1e-105  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  42.67 
 
 
548 aa  382  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  42.66 
 
 
560 aa  384  1e-105  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  41.57 
 
 
558 aa  379  1e-104  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  41.76 
 
 
553 aa  374  1e-102  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  42.38 
 
 
535 aa  370  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  40 
 
 
546 aa  363  6e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  39.54 
 
 
519 aa  362  1e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  40.73 
 
 
525 aa  362  1e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  40.08 
 
 
525 aa  358  1.9999999999999998e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  38.49 
 
 
528 aa  344  2e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  37.88 
 
 
542 aa  322  7e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  35.98 
 
 
538 aa  320  5e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  35.19 
 
 
553 aa  313  5.999999999999999e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  35.83 
 
 
541 aa  309  8e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  33.03 
 
 
558 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  36.21 
 
 
548 aa  307  3e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  35.07 
 
 
527 aa  307  3e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
567 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  35.39 
 
 
535 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  35.08 
 
 
550 aa  304  3.0000000000000004e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  33.33 
 
 
559 aa  303  5.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  32.83 
 
 
570 aa  303  7.000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  34.26 
 
 
568 aa  303  8.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  33.46 
 
 
533 aa  300  5e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  35.36 
 
 
536 aa  300  5e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  34.65 
 
 
553 aa  298  2e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  34.65 
 
 
553 aa  298  2e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  34.3 
 
 
529 aa  297  3e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  34.38 
 
 
536 aa  295  2e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  32.09 
 
 
560 aa  292  1e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  32.14 
 
 
546 aa  288  1e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  37 
 
 
548 aa  288  2e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  33.66 
 
 
527 aa  286  5.999999999999999e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  33.02 
 
 
542 aa  286  7e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  33.9 
 
 
530 aa  286  9e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.316899 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  33.83 
 
 
551 aa  285  1.0000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  32.34 
 
 
577 aa  281  3e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  33.21 
 
 
552 aa  280  4e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  31.3 
 
 
539 aa  279  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.470693 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  33.46 
 
 
531 aa  270  4e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  31.71 
 
 
558 aa  270  5e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  33.4 
 
 
563 aa  270  7e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  33.33 
 
 
523 aa  261  2e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  32.45 
 
 
541 aa  256  5e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19801  predicted protein  31.74 
 
 
534 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289192  normal  0.0151262 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  31.74 
 
 
534 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  33.79 
 
 
527 aa  246  6.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  33.2 
 
 
526 aa  236  5.0000000000000005e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>