60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0962 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
205 aa  401  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000434422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  50.24 
 
 
218 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  49.51 
 
 
208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  40.69 
 
 
215 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.05 
 
 
208 aa  176  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0036  lysine exporter protein LysE/YggA  42.57 
 
 
209 aa  176  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1638  lysine exporter protein LysE/YggA  46.5 
 
 
227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0680  lysine exporter protein LysE/YggA  41.75 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00731166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  36.97 
 
 
219 aa  128  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0336  lysine exporter protein LysE/YggA  33.99 
 
 
225 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0310124  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0309  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 
207 aa  104  7e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_271  transporter, LysE family  30.77 
 
 
207 aa  102  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0329  amino acid transporter LysE  29.74 
 
 
206 aa  100  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.6 
 
 
214 aa  94.7  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0663  lysine exporter protein LysE/YggA  31.31 
 
 
229 aa  92  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.92475  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2082  lysine exporter protein (LysE/YggA)  29.29 
 
 
246 aa  90.1  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0655  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.64 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0217  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.44 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0016043  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0646  lysine exporter protein LysE/YggA  27.64 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0323  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.25 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.147172  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0570  lysine exporter protein LysE/YggA  29.02 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0391767  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3051  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.73 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3244  LysE type translocator  24.38 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.549146  normal  0.0797961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1225  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.62 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0711  lysine exporter protein LysE/YggA  27.64 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206617  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1858  lysine exporter protein LysE/YggA  27 
 
 
204 aa  61.6  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1430  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.87 
 
 
207 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4824  lysine exporter protein LysE/YggA  25.4 
 
 
210 aa  52  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.322328  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1264  lysine exporter protein LysE/YggA  26.4 
 
 
204 aa  51.6  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49928  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2660  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.26 
 
 
191 aa  49.7  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000253226  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  26.87 
 
 
210 aa  48.9  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3067  lysine exporter protein LysE/YggA  25.88 
 
 
198 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000755929  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2018  lysine exporter protein LysE/YggA  26.5 
 
 
206 aa  48.1  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0708  lysine exporter protein LysE/YggA  27.95 
 
 
219 aa  48.1  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000114889 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0903  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.47 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2982  LysE family translocator protein  26 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2660  LysE family translocator  26 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.094148  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.61 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.300791  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  23.42 
 
 
211 aa  45.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.78 
 
 
211 aa  45.4  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0616  lysine exporter protein LysE/YggA  28.35 
 
 
210 aa  44.7  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  26.78 
 
 
229 aa  44.7  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  24.74 
 
 
222 aa  44.7  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2446  lysine exporter protein LysE/YggA  24.14 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1841  lysine exporter protein LysE/YggA  29.31 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000006365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0029  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.47 
 
 
214 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  30.7 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2833  amino acid transporter LysE  29.26 
 
 
208 aa  43.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318432  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 
206 aa  43.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0343  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25 
 
 
239 aa  42.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  25.62 
 
 
211 aa  42.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.99 
 
 
216 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4052  lysine exporter protein LysE/YggA  24.51 
 
 
240 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  26.78 
 
 
209 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  26.23 
 
 
212 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  27.66 
 
 
212 aa  41.6  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  26.23 
 
 
212 aa  41.6  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0757  LysE family translocator protein  25.24 
 
 
217 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305233  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2590  LysE family translocator protein  25.24 
 
 
217 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2023  LysE family translocator protein  25.24 
 
 
217 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>