More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0953 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  100 
 
 
474 aa  973    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  42.74 
 
 
472 aa  385  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  41.74 
 
 
459 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  42.73 
 
 
466 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  40.87 
 
 
459 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  40.87 
 
 
459 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  41.09 
 
 
459 aa  368  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.73 
 
 
470 aa  365  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.04 
 
 
459 aa  363  3e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  40.22 
 
 
461 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  41.87 
 
 
470 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.65 
 
 
470 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  41.65 
 
 
470 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.65 
 
 
470 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.65 
 
 
470 aa  354  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  41.65 
 
 
470 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  41.65 
 
 
470 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.17 
 
 
464 aa  354  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.43 
 
 
470 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42 
 
 
457 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.43 
 
 
470 aa  352  7e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.86 
 
 
459 aa  349  6e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.43 
 
 
470 aa  348  9e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.74 
 
 
462 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.4 
 
 
475 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.74 
 
 
464 aa  340  5e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  38.79 
 
 
461 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.3 
 
 
460 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  40.97 
 
 
456 aa  336  5.999999999999999e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  39.17 
 
 
462 aa  331  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  40.52 
 
 
466 aa  330  4e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  37.53 
 
 
461 aa  330  4e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  39.7 
 
 
466 aa  327  3e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0269  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.31 
 
 
467 aa  327  4.0000000000000003e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000254872  hitchhiker  0.000000323322 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.31 
 
 
459 aa  324  2e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.23 
 
 
460 aa  323  4e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  39.74 
 
 
461 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.09 
 
 
461 aa  320  3e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.7 
 
 
460 aa  318  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.83 
 
 
460 aa  317  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  39.3 
 
 
466 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  39.3 
 
 
466 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.96 
 
 
468 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1013  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.58 
 
 
466 aa  310  4e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.35 
 
 
461 aa  309  5.9999999999999995e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  37.99 
 
 
483 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.36 
 
 
460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.36 
 
 
460 aa  308  2.0000000000000002e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.36 
 
 
460 aa  308  2.0000000000000002e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  37.15 
 
 
462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.07 
 
 
459 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.57 
 
 
459 aa  304  2.0000000000000002e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  38.66 
 
 
485 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  39.25 
 
 
459 aa  300  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  39.34 
 
 
454 aa  299  6e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  36.34 
 
 
460 aa  298  1e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  37.31 
 
 
457 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  37.45 
 
 
461 aa  296  4e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  37.98 
 
 
462 aa  296  6e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.03 
 
 
469 aa  295  1e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.04 
 
 
461 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  38.6 
 
 
453 aa  292  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  39.19 
 
 
495 aa  292  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  37.96 
 
 
457 aa  291  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  39.39 
 
 
471 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0352  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.4 
 
 
469 aa  290  4e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0490  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.13 
 
 
471 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.450377 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  37.58 
 
 
481 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  37.53 
 
 
480 aa  289  6e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  35.54 
 
 
456 aa  289  6e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.3 
 
 
495 aa  289  9e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.3 
 
 
495 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  34.42 
 
 
460 aa  287  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  36.88 
 
 
472 aa  287  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  36.66 
 
 
472 aa  287  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.99 
 
 
461 aa  286  7e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  37.97 
 
 
471 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.52 
 
 
486 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.23 
 
 
457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.97 
 
 
485 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.02 
 
 
469 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  38.43 
 
 
461 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  40.24 
 
 
473 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  37.42 
 
 
472 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  37.8 
 
 
452 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.8 
 
 
469 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.8 
 
 
469 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1219  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.45 
 
 
466 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.253497 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.22 
 
 
469 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.79 
 
 
494 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.8 
 
 
469 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  38.88 
 
 
476 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.89 
 
 
493 aa  283  5.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04382  D-lactate dehydrogenase  37.73 
 
 
461 aa  283  6.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2833  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.46 
 
 
484 aa  282  7.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1567  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.28 
 
 
474 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0682  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.93 
 
 
493 aa  282  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3935  FAD linked oxidase domain protein  36.28 
 
 
465 aa  282  1e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0193  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.14 
 
 
478 aa  282  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.966157  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2581  FAD linked oxidase  35.46 
 
 
497 aa  281  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.209325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>