More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0941 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1088  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  67.98 
 
 
490 aa  698    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0941  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
483 aa  997    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.4752  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1660  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  55.6 
 
 
476 aa  533  1e-150  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0719  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  54.08 
 
 
491 aa  511  1e-144  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1434  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  52.14 
 
 
489 aa  502  1e-141  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.87603  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2676  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  53.65 
 
 
491 aa  500  1e-140  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2160  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  51.59 
 
 
500 aa  499  1e-140  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0308636  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1831  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  52.14 
 
 
484 aa  499  1e-140  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.221701  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1120  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  52.69 
 
 
489 aa  496  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1287  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  49.89 
 
 
483 aa  479  1e-134  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000579108  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1207  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  49.78 
 
 
481 aa  474  1e-132  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.40758  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2181  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  50.11 
 
 
489 aa  468  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1313  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  49.67 
 
 
482 aa  451  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.258751 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  51.58 
 
 
652 aa  443  1e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  48 
 
 
649 aa  403  1e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  48.44 
 
 
649 aa  404  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  48.44 
 
 
649 aa  404  1e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  48.44 
 
 
649 aa  403  1e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  47.09 
 
 
606 aa  385  1e-105  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0356  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  45.74 
 
 
543 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1251  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  35.35 
 
 
503 aa  293  6e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2272  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  36.44 
 
 
498 aa  291  1e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.512273  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1536  tRNA-guanine transglycosylase  34.29 
 
 
507 aa  289  7e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000216588 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1072  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  36.51 
 
 
494 aa  286  8e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0033  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  36.42 
 
 
495 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2149  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  36.76 
 
 
495 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0024  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  35.85 
 
 
522 aa  274  3e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0030  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  36.64 
 
 
494 aa  274  3e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00267485 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3185  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  30.67 
 
 
344 aa  150  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1615  queuine tRNA-ribosyltransferase  30.33 
 
 
376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.214462  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0191  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.01 
 
 
384 aa  139  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0167  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.09 
 
 
377 aa  138  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1416  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.06 
 
 
367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000679599  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.9 
 
 
382 aa  136  7.000000000000001e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.77 
 
 
371 aa  136  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.68 
 
 
370 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.65 
 
 
368 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.53 
 
 
375 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.37 
 
 
368 aa  134  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.01 
 
 
388 aa  133  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.83 
 
 
372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.12 
 
 
380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.18 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.89 
 
 
368 aa  131  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  30.66 
 
 
368 aa  131  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00525  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.89 
 
 
381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.87 
 
 
370 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.73 
 
 
382 aa  130  5.0000000000000004e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.5 
 
 
367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.35 
 
 
381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.56 
 
 
373 aa  128  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0944  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.73 
 
 
378 aa  127  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.45 
 
 
370 aa  127  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.5 
 
 
379 aa  126  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.13 
 
 
369 aa  126  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1410  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.65 
 
 
362 aa  126  9e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.54 
 
 
374 aa  126  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.7 
 
 
370 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2352  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.35 
 
 
391 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.04 
 
 
370 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.99 
 
 
371 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.93 
 
 
371 aa  126  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.99 
 
 
371 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.647195 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.35 
 
 
381 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1495  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.86 
 
 
376 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.3 
 
 
372 aa  125  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.69 
 
 
395 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.17 
 
 
373 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.61 
 
 
373 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.22 
 
 
380 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2346  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.98 
 
 
376 aa  124  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.395355  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2804  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.06 
 
 
376 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.87 
 
 
387 aa  124  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.145582 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00354  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.07 
 
 
375 aa  123  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.07 
 
 
375 aa  123  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.07 
 
 
375 aa  123  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  27.07 
 
 
375 aa  123  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.07 
 
 
375 aa  123  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.07 
 
 
375 aa  123  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.54 
 
 
387 aa  123  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.07 
 
 
375 aa  123  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.07 
 
 
375 aa  123  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.07 
 
 
375 aa  123  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.03 
 
 
380 aa  123  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.03 
 
 
380 aa  123  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0444  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.8 
 
 
375 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0464  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.8 
 
 
375 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.992026  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.8 
 
 
375 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  26.06 
 
 
371 aa  123  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0451  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.8 
 
 
375 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0945287  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.24 
 
 
379 aa  123  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.24 
 
 
379 aa  123  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.29 
 
 
355 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.59 
 
 
381 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.8 
 
 
375 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.52 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.37 
 
 
373 aa  122  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.17 
 
 
374 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.17 
 
 
374 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.39 
 
 
369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>