253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0939 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
385 aa  798    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  58.7 
 
 
385 aa  482  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0513  FAD dependent oxidoreductase  40.93 
 
 
385 aa  256  4e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.349245  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  30.69 
 
 
390 aa  156  6e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  29.18 
 
 
390 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  28.91 
 
 
390 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  25.94 
 
 
390 aa  140  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  28.49 
 
 
406 aa  130  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  28.26 
 
 
408 aa  126  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  26.32 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  27.86 
 
 
407 aa  116  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  26.59 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  27.43 
 
 
386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.44 
 
 
395 aa  112  8.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  26.87 
 
 
387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  28.06 
 
 
396 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  27.73 
 
 
391 aa  108  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  26.67 
 
 
416 aa  103  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  26.4 
 
 
375 aa  95.9  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  26.29 
 
 
399 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  25.63 
 
 
382 aa  89.7  7e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  27.52 
 
 
398 aa  89.7  8e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  25.76 
 
 
393 aa  89  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  27.09 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  27.37 
 
 
396 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  26.59 
 
 
365 aa  82  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 
402 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  23.16 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  21.61 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  24.69 
 
 
414 aa  78.2  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  23.03 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  24.37 
 
 
432 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  24.25 
 
 
402 aa  76.6  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1057  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain protein  23.87 
 
 
426 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  24.21 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  26.87 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  23.28 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  23.82 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  22.7 
 
 
428 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  22.99 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  24.6 
 
 
363 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  26.23 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  22.41 
 
 
428 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  22.41 
 
 
428 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  22.28 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  28.05 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  25 
 
 
431 aa  66.2  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  23.7 
 
 
423 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  24.22 
 
 
423 aa  64.7  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  21.78 
 
 
428 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  21.78 
 
 
428 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  21.78 
 
 
428 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  21.78 
 
 
428 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  23.85 
 
 
405 aa  63.2  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  21.78 
 
 
428 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  21.81 
 
 
428 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0047  putative oxidoreductase FixC  20.63 
 
 
428 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1653  FAD-binding monooxygenase  24.1 
 
 
404 aa  61.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  24.12 
 
 
430 aa  60.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  25.29 
 
 
400 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  24.25 
 
 
401 aa  60.5  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0045  putative oxidoreductase FixC  21.49 
 
 
428 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820288  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  23.86 
 
 
434 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  21.97 
 
 
375 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  25.14 
 
 
430 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  23.43 
 
 
423 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  25.33 
 
 
445 aa  58.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  21.5 
 
 
411 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  22.95 
 
 
424 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  24.11 
 
 
426 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  25.38 
 
 
373 aa  57.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  24.79 
 
 
425 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  23.21 
 
 
370 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  21.66 
 
 
378 aa  58.2  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  23.12 
 
 
455 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0590  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.75 
 
 
407 aa  57.4  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00186747  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  22.65 
 
 
403 aa  57  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  23.04 
 
 
409 aa  57  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  24.02 
 
 
453 aa  56.6  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0129  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 
436 aa  56.6  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  25.63 
 
 
431 aa  55.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  23.9 
 
 
373 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3575  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  23.32 
 
 
435 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120471  normal  0.145615 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  25.71 
 
 
384 aa  55.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  21.74 
 
 
410 aa  55.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  23.86 
 
 
438 aa  55.1  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  26.8 
 
 
375 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  22.69 
 
 
376 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  25.26 
 
 
431 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  24.12 
 
 
387 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  22.75 
 
 
457 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1058  HI0933 family protein  21.22 
 
 
425 aa  54.7  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  26.49 
 
 
405 aa  54.7  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0479  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  22.51 
 
 
425 aa  54.7  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000230935  decreased coverage  0.000263259 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  21.47 
 
 
392 aa  53.9  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0333  FAD dependent oxidoreductase  24.89 
 
 
401 aa  53.9  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.882916  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  25.75 
 
 
380 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  23.82 
 
 
413 aa  54.3  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  24.7 
 
 
362 aa  53.9  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  24 
 
 
420 aa  53.9  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>