More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0884 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  100 
 
 
2552 aa  5108    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  52.14 
 
 
1351 aa  857    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0383  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.14 
 
 
1726 aa  315  4.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.32 
 
 
835 aa  307  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000302047  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3548  APHP domain-containing protein  34.33 
 
 
1613 aa  295  8e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.107963  normal  0.0158906 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3524  peptidase S8 and S53  35.54 
 
 
1748 aa  281  9e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.87 
 
 
1328 aa  280  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.3 
 
 
1016 aa  276  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3479  KP-43 peptidase  33.88 
 
 
697 aa  273  4e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.94 
 
 
1231 aa  248  6.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.06 
 
 
1234 aa  248  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  0.0000368528 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  34.24 
 
 
1223 aa  241  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4157  S-layer domain protein  38.85 
 
 
1204 aa  239  7e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151258 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3219  fibronectin type III domain-containing protein  31.62 
 
 
2030 aa  233  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.341316  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  47.86 
 
 
551 aa  228  8e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  48.11 
 
 
679 aa  223  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  48.48 
 
 
752 aa  223  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  47.1 
 
 
675 aa  219  7e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  45.72 
 
 
3295 aa  218  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  45.98 
 
 
713 aa  215  7e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  45.04 
 
 
859 aa  215  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  47.33 
 
 
1682 aa  214  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  48.16 
 
 
1361 aa  214  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  47.81 
 
 
2554 aa  214  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 
1356 aa  213  4e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  48.39 
 
 
581 aa  213  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  43.09 
 
 
561 aa  213  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  46.97 
 
 
685 aa  212  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  36.12 
 
 
910 aa  211  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  46.43 
 
 
791 aa  211  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  47.83 
 
 
669 aa  211  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  48.19 
 
 
2036 aa  211  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  49.01 
 
 
1732 aa  209  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  47.83 
 
 
1862 aa  210  4e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  47.47 
 
 
658 aa  209  7e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  49 
 
 
530 aa  209  7e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0085  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.49 
 
 
866 aa  208  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  46.96 
 
 
2000 aa  208  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  46.56 
 
 
2272 aa  207  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  46.37 
 
 
1882 aa  207  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  45.21 
 
 
735 aa  207  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  45.78 
 
 
1094 aa  206  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  47.57 
 
 
1842 aa  206  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  39.94 
 
 
978 aa  206  7e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  35.75 
 
 
940 aa  205  8e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  45.34 
 
 
575 aa  205  9e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  45.82 
 
 
1667 aa  205  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  45.97 
 
 
1241 aa  204  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  45.16 
 
 
1120 aa  204  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  45.34 
 
 
2122 aa  203  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  46.88 
 
 
528 aa  203  3.9999999999999996e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  46.18 
 
 
1300 aa  202  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  45.78 
 
 
547 aa  201  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  45.56 
 
 
861 aa  197  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  40 
 
 
1236 aa  197  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  42.97 
 
 
1969 aa  196  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  44.44 
 
 
615 aa  196  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  44.24 
 
 
930 aa  195  9e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  40.79 
 
 
963 aa  194  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  45.6 
 
 
460 aa  187  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  38.44 
 
 
1282 aa  181  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4417  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.97 
 
 
2182 aa  182  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  40.4 
 
 
1528 aa  180  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  31.8 
 
 
771 aa  178  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  42.51 
 
 
719 aa  172  9e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.24 
 
 
1773 aa  170  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  41.53 
 
 
958 aa  170  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  43.73 
 
 
1667 aa  169  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  41.7 
 
 
845 aa  167  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  42.27 
 
 
941 aa  167  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  40.6 
 
 
838 aa  167  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4418  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.63 
 
 
2171 aa  167  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.8 
 
 
1783 aa  166  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  42.4 
 
 
840 aa  165  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  41.83 
 
 
870 aa  164  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  41.39 
 
 
930 aa  164  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  41.9 
 
 
938 aa  164  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  43.88 
 
 
1095 aa  164  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  40.25 
 
 
786 aa  160  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  39.77 
 
 
777 aa  157  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  37.94 
 
 
823 aa  157  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  43.32 
 
 
802 aa  157  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  26.61 
 
 
3586 aa  155  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  40.07 
 
 
971 aa  155  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.57 
 
 
1797 aa  154  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  44.04 
 
 
819 aa  153  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  30.38 
 
 
3562 aa  153  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  46.24 
 
 
560 aa  149  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  26.77 
 
 
5559 aa  148  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  27.39 
 
 
3734 aa  149  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  39.21 
 
 
1387 aa  149  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  26.67 
 
 
5561 aa  148  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  26.77 
 
 
5559 aa  148  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  41.47 
 
 
1783 aa  147  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  37.55 
 
 
439 aa  147  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  41.4 
 
 
869 aa  145  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  26.82 
 
 
5561 aa  145  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  46.15 
 
 
644 aa  144  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  47.85 
 
 
184 aa  144  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  26.43 
 
 
5561 aa  144  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>