114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0858 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0204  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  64.02 
 
 
806 aa  1103    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00731411  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0434  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  62.53 
 
 
806 aa  1071    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0690  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  48.99 
 
 
787 aa  784    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.676741  normal  0.475894 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0858  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  100 
 
 
802 aa  1649    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000764937  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0292  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  47.68 
 
 
805 aa  798    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0805  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  49.25 
 
 
778 aa  740    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.471946  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0311  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  46.89 
 
 
779 aa  742    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.435383  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0475  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  44.13 
 
 
768 aa  675    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.908557  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1174  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  45.97 
 
 
786 aa  728    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0227  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  47.7 
 
 
778 aa  746    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1373  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  48.37 
 
 
786 aa  768    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.619711  normal  0.51907 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1673  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  47.49 
 
 
778 aa  739    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0105  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  43.11 
 
 
766 aa  659    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3780  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  24.38 
 
 
674 aa  66.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.288316  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1272  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  25.26 
 
 
628 aa  65.5  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142133  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1203  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  22.99 
 
 
674 aa  60.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1461  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  23.24 
 
 
656 aa  56.2  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000668721  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0842  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  24.07 
 
 
629 aa  56.2  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.183197  normal  0.106762 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2822  electron transport complex, C subunit  29.23 
 
 
495 aa  55.8  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1494  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  29.23 
 
 
503 aa  54.7  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2875  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  23.63 
 
 
626 aa  54.7  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.843098  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0884  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  23.81 
 
 
653 aa  54.7  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17634  normal  0.977834 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1270  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  24.62 
 
 
673 aa  53.5  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00748773  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0072  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  24.16 
 
 
635 aa  53.9  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1133  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  21.31 
 
 
629 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394682  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0934  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  24.5 
 
 
627 aa  51.6  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.502316  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4590  ferredoxin:4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.71 
 
 
212 aa  51.2  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2041  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.89 
 
 
165 aa  50.8  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000212693  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4302  ferredoxin  33.82 
 
 
212 aa  50.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0232293  decreased coverage  0.00591576 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0483  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.03 
 
 
144 aa  49.7  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1918  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  29.47 
 
 
673 aa  49.7  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2323  electron transport complex protein RnfC  33.33 
 
 
737 aa  49.3  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3525  carbon monoxide dehydrogenase  24.46 
 
 
624 aa  48.5  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0335  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  21.19 
 
 
642 aa  48.9  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2233  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  21.35 
 
 
629 aa  48.9  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0882  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.12 
 
 
635 aa  48.9  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04490  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  20.3 
 
 
632 aa  48.9  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0263  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfC  23.19 
 
 
437 aa  48.5  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1427  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  25 
 
 
639 aa  48.5  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2017  electron transport complex protein RnfC  31.17 
 
 
558 aa  48.1  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2023  electron transport complex protein RnfC  31.52 
 
 
747 aa  48.1  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  30.39 
 
 
162 aa  47.8  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3934  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.93 
 
 
220 aa  47.8  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2798  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  22.33 
 
 
672 aa  47.8  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1384  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  29.07 
 
 
453 aa  47  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000311988  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1832  electron transport complex protein RnfC  34.34 
 
 
880 aa  47.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0828396 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1171  bifunctional acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha/beta  27.5 
 
 
763 aa  47  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3218  NADH dehydrogenase subunit I  30.39 
 
 
163 aa  47  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2355  electron transport complex protein RnfC  35.96 
 
 
825 aa  47.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2862  dihydropyrimidine dehydrogenase  31.58 
 
 
439 aa  47  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0341  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.16 
 
 
471 aa  47  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00798095 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1972  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  21.43 
 
 
655 aa  46.2  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000154748  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1865  electron transport complex protein RnfC  34.74 
 
 
731 aa  46.6  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2967  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  35.05 
 
 
890 aa  46.6  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.390488  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0688  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  33.73 
 
 
605 aa  46.2  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0508448  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0390  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  24.53 
 
 
494 aa  46.2  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.573606  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0898  NADH dehydrogenase subunit I  29.41 
 
 
163 aa  46.2  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404509  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1896  electron transport complex protein RnfC  31.82 
 
 
698 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.813056  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2327  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  21.07 
 
 
621 aa  47  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00453727  normal  0.0261188 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3184  bifunctional acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha/beta  24.88 
 
 
736 aa  46.6  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2252  electron transport complex protein RnfC  31.46 
 
 
659 aa  46.2  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00637467  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2008  electron transport complex protein RnfC  31.82 
 
 
698 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0699  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  24.55 
 
 
442 aa  45.8  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  31.46 
 
 
169 aa  45.8  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2197  electron transport complex protein RnfC  32.88 
 
 
788 aa  45.8  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3333  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  28.74 
 
 
410 aa  46.2  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0308305  hitchhiker  0.000758619 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4020  dihydropyrimidine dehydrogenase  30.68 
 
 
435 aa  45.8  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3194  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  30.53 
 
 
519 aa  45.8  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0106168  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  27.45 
 
 
162 aa  46.2  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14260  predicted protein  29.41 
 
 
163 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1723  NADH dehydrogenase subunit I  28.43 
 
 
163 aa  45.8  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341479  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  27.96 
 
 
224 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1081  hypothetical protein  37.29 
 
 
205 aa  45.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2536  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  25.76 
 
 
446 aa  45.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.892294  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  29.25 
 
 
164 aa  45.8  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  27.45 
 
 
162 aa  45.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  32.93 
 
 
163 aa  45.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1663  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  36.76 
 
 
436 aa  45.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  30.69 
 
 
162 aa  45.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2566  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  21.98 
 
 
663 aa  45.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1371  hydrogenase large subunit domain protein  36.67 
 
 
508 aa  45.1  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000870686  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0967  dihydropyrimidine dehydrogenase  29.33 
 
 
442 aa  45.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.584052  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1077  NADH dehydrogenase subunit I  27.45 
 
 
162 aa  45.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1011  NADH dehydrogenase subunit I  27.45 
 
 
162 aa  45.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210818  normal  0.566427 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1269  NADH dehydrogenase subunit I  27.45 
 
 
163 aa  45.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142775  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1206  NADH dehydrogenase subunit I  27.45 
 
 
162 aa  45.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1361  NADH dehydrogenase subunit I  27.45 
 
 
163 aa  45.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182164  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0514  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  30.39 
 
 
423 aa  45.1  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.62 
 
 
169 aa  45.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02966  electron transport complex protein RnfC  36.21 
 
 
912 aa  44.7  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0610  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  32.22 
 
 
440 aa  45.1  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0321334  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3449  dihydropyrimidine dehydrogenase  34.62 
 
 
437 aa  45.1  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591903  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2895  electron transport complex protein RnfC  28.4 
 
 
523 aa  44.7  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.473495  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1030  NADH dehydrogenase subunit I  30 
 
 
163 aa  44.7  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1592  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  28.67 
 
 
494 aa  44.7  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.220062  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2051  NADH dehydrogenase subunit I  27.45 
 
 
162 aa  44.7  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100158  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3675  putative heterodisulfide reductase, C subunit  31.25 
 
 
195 aa  44.7  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.141926 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7456  hypothetical protein  27.52 
 
 
261 aa  44.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0412051  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  28.41 
 
 
163 aa  44.3  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.180184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01599  electron transport complex protein RnfC  31.82 
 
 
740 aa  44.3  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0105357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>