More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0857 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  100 
 
 		 279 aa  578  1e-164  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  53.68 
 
 		 207 aa  204  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  43.16 
 
 		 205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  28.91 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2451  Rhomboid family protein  29.74 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0599  AN1-type Zinc finger protein  29.6 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.715069  normal  0.614872 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1128  Rhomboid family protein  31.77 
 
 		 319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  41.01 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2965  Rhomboid family protein  27.36 
 
 		 318 aa  102  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.58204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  34.34 
 
 		 273 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  41.73 
 
 		 278 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  37.5 
 
 		 264 aa  99.4  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  36.93 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  34.48 
 
 		 190 aa  96.7  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  34.46 
 
 		 273 aa  94  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0788  Rhomboid family protein  36.18 
 
 		 288 aa  92  9e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  39.44 
 
 		 224 aa  91.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  39.01 
 
 		 232 aa  91.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  37.41 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  33.58 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  37.66 
 
 		 264 aa  90.5  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  35.23 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6620  Rhomboid family protein  34.53 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000794004  hitchhiker  0.00987109 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  35.95 
 
 		 220 aa  85.9  6e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  35.9 
 
 		 209 aa  85.9  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  33.65 
 
 		 246 aa  85.9  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  33.12 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  31.98 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  27.73 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0132  rhomboid family protein  36.21 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  28.79 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  28.79 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  32.99 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  35.81 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  34.64 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  29.9 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2191  Rhomboid family protein  34.94 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  35.06 
 
 		 444 aa  81.6  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  30.15 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  33.73 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  33.54 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  36.36 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  29.35 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  33.55 
 
 		 360 aa  79  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  26.91 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  29.35 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  35.37 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0239  rhomboid family protein  37.58 
 
 		 190 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  30.22 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  31.65 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1130  integral membrane protein  33.85 
 
 		 196 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  0.0126937 
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  32.7 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  32.39 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  31.55 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  33.54 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1552  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000315131 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  31.03 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0209  rhomboid family protein  35.62 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  33.71 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5597  Rhomboid family protein  34.03 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  31.34 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1165  rhomboid family protein  29.76 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00020927  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  32.94 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  32.41 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0099  Rhomboid family protein  34 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.36939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  31.95 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1727  rhomboid family protein  32.64 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  32.96 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  36.73 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1026  hypothetical protein  32.32 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.877096  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  30.64 
 
 		 241 aa  72  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  30.87 
 
 		 232 aa  72  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  33.33 
 
 		 201 aa  71.6  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  33.12 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 541 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  31.15 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  33.09 
 
 		 231 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07080  putative transmembrane rhomboid family protein  31.33 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0210  rhomboid family protein  29.5 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  33.11 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1367  Rhomboid family protein  38.69 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.870184  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6787  Rhomboid family protein  35.56 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132625 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0016  hypothetical protein  31.48 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2337  rhomboid family protein  37.41 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.218198  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  34.06 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  26.77 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  26.77 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  33.99 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  33.99 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  29.61 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  33.99 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  33.99 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2146  Rhomboid family protein  29.9 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000095331  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0277  Rhomboid family protein  35.17 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499185  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  30.82 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  24.69 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3756  intramembrane serine protease GlpG  27.27 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>