More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0811 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0811  methanol corrinoid protein  100 
 
 
254 aa  511  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3637  methanol corrinoid protein  62.75 
 
 
255 aa  332  3e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0813  methanol corrinoid protein  60.47 
 
 
256 aa  330  1e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1063  methanol corrinoid protein  62.75 
 
 
258 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0740  methanol corrinoid protein  62.25 
 
 
258 aa  325  3e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3584  methylthiol:coenzyme M methyltransferase  39.58 
 
 
275 aa  171  9e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812541  normal  0.0358178 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  35.03 
 
 
210 aa  132  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  37.76 
 
 
804 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  34.52 
 
 
210 aa  129  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  34.38 
 
 
210 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  34 
 
 
800 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  34.5 
 
 
210 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4325  methyltransferase cognate corrinoid protein  33.81 
 
 
214 aa  125  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  36.65 
 
 
804 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  33.82 
 
 
839 aa  124  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  35.87 
 
 
804 aa  122  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  33 
 
 
774 aa  121  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  37.24 
 
 
804 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0024  methyltransferase cognate corrinoid protein  35.82 
 
 
220 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1368  trimethylamine corrinoid protein  36.45 
 
 
216 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000818926  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1503  dimethylamine corrinoid protein  35.68 
 
 
217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.153126  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0840  monomethylamine corrinoid protein  37.97 
 
 
217 aa  120  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.960899  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  32.71 
 
 
212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  34.2 
 
 
807 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0847  monomethylamine corrinoid protein  37.43 
 
 
217 aa  119  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  32.85 
 
 
768 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  31.5 
 
 
209 aa  116  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  33.51 
 
 
210 aa  116  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2310  trimethylamine corrinoid protein  36.95 
 
 
216 aa  115  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00299987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  33.49 
 
 
806 aa  115  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0845  monomethylamine corrinoid protein  35.06 
 
 
217 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  31.4 
 
 
768 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  32.47 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  35.71 
 
 
811 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  35.2 
 
 
813 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  32 
 
 
818 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3634  monomethylamine corrinoid protein  36.05 
 
 
217 aa  113  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  33.5 
 
 
804 aa  112  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0842  monomethylamine corrinoid protein  35.5 
 
 
217 aa  112  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  36.27 
 
 
251 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  31.61 
 
 
802 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0707  methionine synthase  33.17 
 
 
232 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.784551  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  35.53 
 
 
214 aa  111  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  32.86 
 
 
841 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  30.45 
 
 
1136 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  30 
 
 
213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  32.43 
 
 
1223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  31.47 
 
 
781 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  29.41 
 
 
793 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  31.68 
 
 
804 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1526  B12-dependent methionine synthase  29.39 
 
 
1232 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0797  methionine synthase  32.66 
 
 
232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.310628  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2122  putative dimethylamine corrinoid protein  32.66 
 
 
232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.154357  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  30 
 
 
841 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.75 
 
 
1132 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.75 
 
 
1132 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.75 
 
 
1133 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.75 
 
 
1133 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.75 
 
 
1132 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.75 
 
 
1132 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.75 
 
 
1132 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1776  methionine synthase  32.16 
 
 
232 aa  108  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  35.08 
 
 
801 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  31.34 
 
 
1182 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  32.56 
 
 
219 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  32.75 
 
 
1132 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1073  methionine synthase  32.28 
 
 
259 aa  106  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234469  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  33.33 
 
 
1169 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  31.34 
 
 
1182 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.78 
 
 
1132 aa  105  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.63 
 
 
219 aa  105  7e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  31.28 
 
 
1132 aa  105  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.5 
 
 
216 aa  105  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.885246  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  34.31 
 
 
803 aa  105  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2832  B12-dependent methionine synthase  27.56 
 
 
1271 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.192266 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  32.31 
 
 
1132 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.63 
 
 
219 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  36.31 
 
 
791 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0418  cobalamin-dependent methionine synthase, B12-binding  33.5 
 
 
220 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  29.67 
 
 
780 aa  103  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  31.55 
 
 
1176 aa  103  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3199  Methionine synthase B12-binding module cap domain protein  31.82 
 
 
212 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1470  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  30.15 
 
 
232 aa  102  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  31.41 
 
 
1178 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  28.57 
 
 
1136 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  29.55 
 
 
218 aa  101  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2550  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  31.16 
 
 
235 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3735  B12-dependent methionine synthase  29.19 
 
 
1286 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.391435  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1501  dimethylamine corrinoid protein  32.16 
 
 
208 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000126339  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  27.97 
 
 
1168 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  30.89 
 
 
1208 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1115  B12-dependent methionine synthase  30.6 
 
 
1241 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.41 
 
 
1208 aa  99.4  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2436  methionine synthase  30.85 
 
 
885 aa  99.8  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0619597  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1206  cobalamin B12-binding  30.1 
 
 
224 aa  99  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136661  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  32.8 
 
 
801 aa  99  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  31.75 
 
 
1191 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  30.81 
 
 
1215 aa  98.2  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0234  B12-dependent methionine synthase  29.38 
 
 
1237 aa  97.4  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.545849  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  33.53 
 
 
1191 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>