269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0808 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  100 
 
 
338 aa  681    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3639  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  65.49 
 
 
339 aa  456  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.739876  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1054  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  64.9 
 
 
339 aa  434  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  46.61 
 
 
345 aa  315  7e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0452  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  46.05 
 
 
310 aa  294  1e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1688  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  45.59 
 
 
341 aa  286  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.967324  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0841  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  40 
 
 
339 aa  233  5e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2082  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  38.15 
 
 
344 aa  218  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2102  methyltransferase MtaA/CmuA  36.9 
 
 
338 aa  217  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  35.74 
 
 
349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0077  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  35.82 
 
 
342 aa  208  9e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0838  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  35.52 
 
 
342 aa  206  6e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1825  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  35.22 
 
 
342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0419  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  30.92 
 
 
348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.919138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2786  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  31.1 
 
 
355 aa  189  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26140  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  33.23 
 
 
341 aa  179  7e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3585  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  29.25 
 
 
367 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.936166  normal  0.073488 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2069  methyltransferase MtaA/CmuA family  27.84 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.096371  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2100  methyltransferase MtaA/CmuA  29.38 
 
 
350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  27.91 
 
 
363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  30.64 
 
 
357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  27.62 
 
 
363 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  27.62 
 
 
363 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  26.86 
 
 
372 aa  132  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  30.12 
 
 
335 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1305  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  31.2 
 
 
337 aa  125  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.536887  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18310  uroporphyrinogen-III decarboxylase  28.03 
 
 
358 aa  119  7.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19560  uroporphyrinogen-III decarboxylase  27.22 
 
 
363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289502 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0731  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  28.94 
 
 
319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.20168  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1823  uroporphyrinogen decarboxylase  29.82 
 
 
287 aa  103  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.952283  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  28.9 
 
 
287 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0079  uroporphyrinogen decarboxylase  29.36 
 
 
287 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0659182  hitchhiker  0.00575431 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15330  methylamine-specific methylcobalamin coenzyme M methyltransferase  26.96 
 
 
448 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  27.03 
 
 
375 aa  98.2  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  24.56 
 
 
343 aa  95.9  9e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  27.3 
 
 
556 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19550  uroporphyrinogen-III decarboxylase  25.36 
 
 
373 aa  95.1  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.288142  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0023  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  27.94 
 
 
337 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  30.27 
 
 
354 aa  88.6  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0422  uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  27.35 
 
 
293 aa  86.3  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26160  hypothetical protein  28.51 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  27.55 
 
 
402 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  27.55 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0196  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  28.2 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.343296  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  27.75 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  26.32 
 
 
354 aa  80.1  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  27.95 
 
 
355 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  29.11 
 
 
355 aa  79.3  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  29.38 
 
 
355 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  29.3 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  27.58 
 
 
351 aa  77  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  27.47 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  25.47 
 
 
353 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02179  uroporphyrinogen decarboxylase  27.99 
 
 
354 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3713  uroporphyrinogen decarboxylase  28.96 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2887  uroporphyrinogen decarboxylase  26.67 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.242767  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  27.2 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  26.17 
 
 
364 aa  72.8  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  27.61 
 
 
359 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  26.67 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  25.82 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0957  uroporphyrinogen decarboxylase  23.63 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  27.37 
 
 
354 aa  70.1  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  28.02 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1430  uroporphyrinogen decarboxylase  21.15 
 
 
345 aa  69.3  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000852244  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  26.01 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  26.46 
 
 
355 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  26.46 
 
 
355 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3498  uroporphyrinogen decarboxylase  25.14 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  26.7 
 
 
355 aa  67.8  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  24.59 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  26.61 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1147  uroporphyrinogen decarboxylase  25.42 
 
 
350 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1216  uroporphyrinogen decarboxylase  25.71 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0600  uroporphyrinogen decarboxylase  28.27 
 
 
314 aa  67  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  27.55 
 
 
354 aa  67  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3920  uroporphyrinogen decarboxylase  25.7 
 
 
354 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  25.15 
 
 
339 aa  67  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  24.86 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3303  uroporphyrinogen decarboxylase  25.41 
 
 
364 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0163615  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  24.13 
 
 
352 aa  66.6  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3039  uroporphyrinogen decarboxylase  26.83 
 
 
360 aa  66.6  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0062  uroporphyrinogen decarboxylase  21.57 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.629057  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  26.76 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  24.07 
 
 
617 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0413  uroporphyrinogen decarboxylase  25.7 
 
 
354 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  25.98 
 
 
355 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  24.3 
 
 
351 aa  66.2  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4042  uroporphyrinogen decarboxylase  25.7 
 
 
354 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.984022 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  25.7 
 
 
354 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000118509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18361  uroporphyrinogen decarboxylase  26.2 
 
 
352 aa  65.9  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28197 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  24.37 
 
 
351 aa  65.9  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3174  uroporphyrinogen decarboxylase  25.14 
 
 
367 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  24.44 
 
 
351 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  23.1 
 
 
351 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3304  uroporphyrinogen decarboxylase  25.28 
 
 
364 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3342  uroporphyrinogen decarboxylase  24.33 
 
 
363 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  25.61 
 
 
357 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3406  uroporphyrinogen decarboxylase  25.14 
 
 
354 aa  65.1  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  24.66 
 
 
356 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>