More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0768 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0768  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
383 aa  781    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 
582 aa  219  6e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 
456 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 
371 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 
763 aa  212  9e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  40.62 
 
 
1046 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  45.38 
 
 
729 aa  202  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2120  multisensor signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 
682 aa  191  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.34 
 
 
568 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
646 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 
687 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0950  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 
396 aa  177  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0679  sensory transduction histidine kinase  38.82 
 
 
445 aa  176  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.502245 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  41.63 
 
 
576 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 
765 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 
1352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 
911 aa  173  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0380  histidine kinase  42.49 
 
 
235 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0756156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  39.83 
 
 
565 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  35.9 
 
 
503 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
770 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  34.58 
 
 
773 aa  171  3e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.22 
 
 
823 aa  170  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  39.22 
 
 
508 aa  170  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  37.99 
 
 
525 aa  169  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
436 aa  167  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.257658  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
774 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1100  PAS  32.71 
 
 
576 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897667  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
513 aa  166  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3284  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
856 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0250894  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2558  histidine kinase  35.52 
 
 
397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  hitchhiker  0.000338162 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
775 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  37.96 
 
 
783 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
523 aa  163  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  37.96 
 
 
783 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  32.94 
 
 
599 aa  163  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
389 aa  162  7e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 
784 aa  162  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  37.08 
 
 
464 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0742  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
862 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 
779 aa  161  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  36.17 
 
 
603 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  34.9 
 
 
1346 aa  160  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  36.67 
 
 
288 aa  160  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
546 aa  159  6e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.35 
 
 
765 aa  159  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 
1267 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
773 aa  159  8e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
600 aa  159  9e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
769 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  34.03 
 
 
774 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
502 aa  159  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 
1310 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.25 
 
 
754 aa  158  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
653 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.56 
 
 
968 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3600  histidine kinase  33.33 
 
 
548 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.94225  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
798 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  38.5 
 
 
461 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1564  histidine kinase  35.95 
 
 
531 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
772 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  38.05 
 
 
461 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 
1271 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  38.05 
 
 
461 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
490 aa  156  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4896  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 
842 aa  156  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
587 aa  156  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4432  ATPase domain-containing protein  35.18 
 
 
846 aa  156  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.645763 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 
898 aa  156  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
617 aa  156  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
775 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  34.66 
 
 
771 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
769 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  34.66 
 
 
771 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  35.57 
 
 
853 aa  155  8e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.21 
 
 
571 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 
1274 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
769 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0877  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
548 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.991624  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36.33 
 
 
1053 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 
1143 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 
1363 aa  155  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
620 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
844 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  35.09 
 
 
790 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 
1160 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2163  histidine kinase  37.39 
 
 
845 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.74 
 
 
657 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2225  histidine kinase  37.39 
 
 
845 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0086849  normal  0.197777 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3246  histidine kinase  35.18 
 
 
826 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
627 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1166  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 
507 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 
857 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485802  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
717 aa  154  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 
1069 aa  153  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 
1145 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 
940 aa  153  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
778 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 
1155 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 
995 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>