141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0753 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 		 594 aa  1210    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  37.56 
 
 		 607 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.38 
 
 		 640 aa  324  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.47 
 
 		 647 aa  117  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  24.35 
 
 		 598 aa  101  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  24.85 
 
 		 594 aa  92  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  24.24 
 
 		 596 aa  90.5  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  27.11 
 
 		 712 aa  87.8  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  24.59 
 
 		 565 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  29.71 
 
 		 613 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  26.8 
 
 		 703 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  25.34 
 
 		 688 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  31.84 
 
 		 594 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  22.11 
 
 		 659 aa  78.6  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  24.51 
 
 		 669 aa  78.6  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  29.23 
 
 		 695 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.91 
 
 		 566 aa  77.8  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  23.2 
 
 		 714 aa  75.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  23.39 
 
 		 619 aa  72.8  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  23.95 
 
 		 667 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  21.72 
 
 		 634 aa  70.5  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  24.89 
 
 		 623 aa  70.5  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0201  ATP-dependent endonuclease of the OLD family protein  24.01 
 
 		 558 aa  69.7  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  22.24 
 
 		 648 aa  70.1  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.65 
 
 		 615 aa  68.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  21.72 
 
 		 606 aa  69.3  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  22.48 
 
 		 661 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.42 
 
 		 674 aa  68.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1975  hypothetical protein  25.87 
 
 		 554 aa  68.2  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.650483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  27.69 
 
 		 728 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  28.22 
 
 		 758 aa  67.8  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  30.49 
 
 		 574 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  25.89 
 
 		 650 aa  67.4  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.24 
 
 		 689 aa  67  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  27.75 
 
 		 553 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2614  hypothetical protein  23.25 
 
 		 555 aa  66.6  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1594  hypothetical protein  23.25 
 
 		 555 aa  66.6  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2699  hypothetical protein  23.25 
 
 		 555 aa  66.6  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  22.68 
 
 		 598 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.4 
 
 		 626 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2270  hypothetical protein  29.45 
 
 		 553 aa  65.1  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  26.27 
 
 		 744 aa  65.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  23 
 
 		 598 aa  64.7  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  22.29 
 
 		 685 aa  64.7  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.28 
 
 		 639 aa  64.3  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  19.87 
 
 		 600 aa  63.9  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  30.72 
 
 		 596 aa  63.9  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1668  hypothetical protein  27.85 
 
 		 554 aa  63.5  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413918  normal  0.886793 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.24 
 
 		 677 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.24 
 
 		 677 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1393  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.17 
 
 		 552 aa  63.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2370  hypothetical protein  26.37 
 
 		 553 aa  63.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  25.3 
 
 		 543 aa  63.5  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  24.17 
 
 		 707 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1709  hypothetical protein  24.88 
 
 		 554 aa  63.5  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.137419  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  22.57 
 
 		 641 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0449  hypothetical protein  23.53 
 
 		 554 aa  62.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.380291  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00881  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  25.51 
 
 		 552 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2766  conserved hypothetical protein  25.51 
 
 		 552 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00887  hypothetical protein  25.51 
 
 		 552 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0980  hypothetical protein  25.51 
 
 		 552 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2720  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.51 
 
 		 552 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1038  hypothetical protein  25.51 
 
 		 552 aa  61.2  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0950  hypothetical protein  25.51 
 
 		 552 aa  61.2  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.714273  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2283  hypothetical protein  25.51 
 
 		 552 aa  61.2  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0243665  normal  0.014671 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2452  hypothetical protein  25.51 
 
 		 552 aa  61.2  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234891  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.38 
 
 		 637 aa  60.5  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0940  hypothetical protein  23.04 
 
 		 552 aa  60.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1057  conserved protein, nucleotide triphosphate hydrolase domain protein  23.04 
 
 		 552 aa  60.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1006  hypothetical protein  23.04 
 
 		 552 aa  60.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0974  conserved protein nucleotide triphosphate hydrolase domain  23.04 
 
 		 552 aa  60.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.120281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1037  hypothetical protein  23.04 
 
 		 552 aa  60.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  27.27 
 
 		 769 aa  60.1  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05915  hypothetical protein  24.1 
 
 		 544 aa  59.7  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  26.23 
 
 		 691 aa  59.7  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0640  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  22.97 
 
 		 601 aa  60.1  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  28.99 
 
 		 780 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  24.18 
 
 		 748 aa  59.3  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  23.62 
 
 		 604 aa  59.7  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.44 
 
 		 589 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  23.42 
 
 		 674 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  30.53 
 
 		 682 aa  58.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.91 
 
 		 793 aa  58.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.98 
 
 		 613 aa  58.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  24.1 
 
 		 544 aa  57.8  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  20.42 
 
 		 626 aa  56.6  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  27.98 
 
 		 773 aa  56.6  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  22.51 
 
 		 763 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  26.36 
 
 		 586 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  25.94 
 
 		 564 aa  55.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 645 aa  55.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  22.73 
 
 		 628 aa  55.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  29.03 
 
 		 773 aa  54.3  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  25.93 
 
 		 784 aa  54.3  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  31.77 
 
 		 564 aa  53.9  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.07 
 
 		 608 aa  53.5  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  25.15 
 
 		 645 aa  52.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1994  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.57 
 
 		 590 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.79 
 
 		 642 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  25.75 
 
 		 696 aa  52  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>