30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0720 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0720  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  704    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0102669  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0053  hypothetical protein  36.87 
 
 
363 aa  230  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0959  hypothetical protein  35.94 
 
 
368 aa  230  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.107791  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1117  hypothetical protein  36.58 
 
 
357 aa  219  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2021  hypothetical protein  35.8 
 
 
347 aa  217  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0834  protein of unknown function DUF354  33.43 
 
 
361 aa  197  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0488411  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3746  hypothetical protein  36.07 
 
 
370 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3286  protein of unknown function DUF354  35.48 
 
 
355 aa  192  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.401712  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2496  protein of unknown function DUF354  30.73 
 
 
381 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1140  protein of unknown function DUF354  33.71 
 
 
369 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0197  hypothetical protein  34.2 
 
 
374 aa  177  3e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00000153043  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0489  protein of unknown function DUF354  31.27 
 
 
355 aa  171  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0433  protein of unknown function DUF354  30.53 
 
 
401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2023  protein of unknown function DUF354  29.17 
 
 
379 aa  150  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0244531  normal  0.923484 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0677  protein of unknown function DUF354  30.2 
 
 
363 aa  149  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4579  protein of unknown function DUF354  28.53 
 
 
374 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.242869  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3429  protein of unknown function DUF354  27.73 
 
 
383 aa  144  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5262  protein of unknown function DUF354  28.9 
 
 
369 aa  142  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3016  protein of unknown function DUF354  25.64 
 
 
367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1755  hypothetical protein  22.42 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1090  hypothetical protein  27.48 
 
 
350 aa  54.3  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.399019  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1136  hypothetical protein  23.72 
 
 
329 aa  53.9  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.345385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1073  protein of unknown function DUF354  23.49 
 
 
349 aa  53.5  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.266744  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0372  hypothetical protein  26.56 
 
 
333 aa  53.5  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.153205 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0093  hypothetical protein  26.9 
 
 
350 aa  52.4  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0978162 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1550  hypothetical protein  22.89 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.590415  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2863  hypothetical protein  23.86 
 
 
377 aa  49.7  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3188  protein of unknown function DUF354  23.15 
 
 
349 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1339  hypothetical protein  23.1 
 
 
335 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00496321  normal  0.353078 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1667  hypothetical protein  22.22 
 
 
337 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.251893  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>