More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0705 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  62.44 
 
 		 855 aa  1060    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  100 
 
 		 780 aa  1617    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  33.12 
 
 		 747 aa  427  1e-118  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  31.57 
 
 		 844 aa  376  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  32.18 
 
 		 743 aa  377  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  36.73 
 
 		 610 aa  365  1e-99  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  30.64 
 
 		 827 aa  365  2e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  30.39 
 
 		 837 aa  364  3e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  29.89 
 
 		 864 aa  364  3e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  32.42 
 
 		 702 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  29.42 
 
 		 863 aa  363  8e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  31.31 
 
 		 771 aa  362  1e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  30.28 
 
 		 843 aa  362  2e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  36.53 
 
 		 631 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  30.12 
 
 		 837 aa  353  1e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  32.4 
 
 		 744 aa  351  3e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  31.58 
 
 		 931 aa  349  9e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  31.29 
 
 		 931 aa  343  9e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  30.78 
 
 		 849 aa  341  2.9999999999999998e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  35.46 
 
 		 604 aa  338  2.9999999999999997e-91  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  34.26 
 
 		 602 aa  330  6e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  29.53 
 
 		 834 aa  327  7e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  29.94 
 
 		 942 aa  320  7e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  32.82 
 
 		 604 aa  317  4e-85  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  29.8 
 
 		 938 aa  317  5e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  29.4 
 
 		 935 aa  306  7e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  34.43 
 
 		 596 aa  306  8.000000000000001e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32265  predicted protein  30.75 
 
 		 863 aa  296  8e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142978  normal  0.982566 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8810  DNA topoisomerase  31.44 
 
 		 868 aa  293  1e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  28.41 
 
 		 812 aa  283  9e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  28.41 
 
 		 814 aa  273  1e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47417  predicted protein  32.79 
 
 		 1009 aa  270  5.9999999999999995e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143888  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  28.03 
 
 		 814 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  28.29 
 
 		 817 aa  264  6e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00400  DNA topoisomerase type I, putative  30.91 
 
 		 828 aa  262  2e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.772015  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33842  predicted protein  30.46 
 
 		 641 aa  261  3e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04555  DNA topoisomerase III (Eurofung)  30.87 
 
 		 629 aa  258  3e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.755081  normal  0.215917 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34564  DNA topoisomerase  30.3 
 
 		 616 aa  244  5e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  27.14 
 
 		 853 aa  243  1e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  27.7 
 
 		 691 aa  198  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  27.25 
 
 		 868 aa  197  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  25.8 
 
 		 697 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  27.29 
 
 		 868 aa  191  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  27.1 
 
 		 868 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02352  DNA topoisomerase I  27.35 
 
 		 886 aa  189  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.346512  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  27.1 
 
 		 868 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  26.07 
 
 		 693 aa  189  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  27.59 
 
 		 869 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  27.59 
 
 		 869 aa  187  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  27.59 
 
 		 869 aa  187  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  24.64 
 
 		 710 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  27.11 
 
 		 869 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  26.1 
 
 		 813 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0914  DNA topoisomerase I  25.79 
 
 		 868 aa  185  4.0000000000000006e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  24.47 
 
 		 859 aa  184  8.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3514  DNA topoisomerase I  26.82 
 
 		 869 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  27.09 
 
 		 870 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  24.54 
 
 		 743 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0497  DNA topoisomerase  28.7 
 
 		 686 aa  181  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.167665  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1322  DNA topoisomerase I  26.66 
 
 		 872 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425671  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  26.18 
 
 		 876 aa  181  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1906  DNA topoisomerase I  23.63 
 
 		 865 aa  180  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.176274  hitchhiker  0.000000000000101765 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  25.86 
 
 		 768 aa  180  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1498  DNA topoisomerase I  23.63 
 
 		 865 aa  179  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1857  DNA topoisomerase I  23.5 
 
 		 865 aa  179  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.2475e-18 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0393  DNA topoisomerase I  25.62 
 
 		 884 aa  179  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000925228  unclonable  0.0000000013775 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01250  DNA topoisomerase I  23.5 
 
 		 865 aa  178  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.856005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2375  DNA topoisomerase I  23.5 
 
 		 865 aa  178  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000189026  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01260  hypothetical protein  23.5 
 
 		 865 aa  178  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.742047  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1383  DNA topoisomerase I  23.5 
 
 		 865 aa  178  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2224  DNA topoisomerase I  26.83 
 
 		 898 aa  178  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.648811  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2699  DNA topoisomerase  26.01 
 
 		 831 aa  178  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0466  DNA topoisomerase III  26.89 
 
 		 670 aa  178  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2354  DNA topoisomerase I  23.5 
 
 		 865 aa  178  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.01053  unclonable  0.0000000472675 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1474  DNA topoisomerase I  23.5 
 
 		 865 aa  178  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00320061  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2705  DNA topoisomerase I  25.39 
 
 		 878 aa  177  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  25.71 
 
 		 841 aa  177  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  25.7 
 
 		 831 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  25.67 
 
 		 831 aa  177  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2342  DNA topoisomerase III  25.68 
 
 		 671 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01574  DNA topoisomerase I  26.45 
 
 		 876 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  26.21 
 
 		 693 aa  176  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1146  DNA topoisomerase I  25.58 
 
 		 879 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368466  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1164  DNA topoisomerase I  25.88 
 
 		 879 aa  175  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  25.96 
 
 		 711 aa  175  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  23.98 
 
 		 836 aa  174  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1923  DNA topoisomerase I  24.62 
 
 		 871 aa  174  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0924763  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2033  DNA topoisomerase I  24.62 
 
 		 871 aa  174  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2304  DNA topoisomerase I  24.74 
 
 		 871 aa  174  6.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.926517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1432  DNA topoisomerase I  23.63 
 
 		 865 aa  173  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0283977  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1660  DNA topoisomerase I  25.38 
 
 		 892 aa  173  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000915276  normal  0.794129 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2250  DNA topoisomerase I  26.62 
 
 		 880 aa  173  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1585  DNA topoisomerase I  25.25 
 
 		 894 aa  173  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.328544  normal  0.0409432 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1904  DNA topoisomerase I  23.63 
 
 		 865 aa  173  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  2.78185e-16 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1841  DNA topoisomerase I  23.63 
 
 		 865 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.253396  hitchhiker  0.0000000000877757 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2328  DNA topoisomerase I  26.39 
 
 		 895 aa  172  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.664503  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1660  DNA topoisomerase I  25.25 
 
 		 894 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.367793  unclonable  0.0000368554 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1729  DNA topoisomerase I  25.11 
 
 		 894 aa  172  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0724746 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0990  DNA topoisomerase III  25.3 
 
 		 671 aa  172  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.585612  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1614  DNA topoisomerase I  23.63 
 
 		 865 aa  172  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.848842  hitchhiker  0.000000000000466003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>