More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0628 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1641  diaminopimelate decarboxylase  77.09 
 
 		 420 aa  682    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0628  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 420 aa  856    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4876  diaminopimelate decarboxylase  67.55 
 
 		 416 aa  599  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000066198  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0302  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  59.9 
 
 		 419 aa  499  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00760  diaminopimelate decarboxylase  56.03 
 
 		 445 aa  499  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3249  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  58.44 
 
 		 421 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28180  diaminopimelate decarboxylase  55.37 
 
 		 432 aa  471  1e-132  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000200142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1225  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  54.61 
 
 		 413 aa  461  9.999999999999999e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2859  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  55.69 
 
 		 421 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000208534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1355  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  55.53 
 
 		 421 aa  457  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.146910000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1405  diaminopimelate decarboxylase  54.63 
 
 		 419 aa  448  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000283018  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2135  diaminopimelate decarboxylase  54.52 
 
 		 418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329469  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0514  Diaminopimelate decarboxylase  51.55 
 
 		 434 aa  429  1e-119  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534186 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0299  diaminopimelate decarboxylase  52.43 
 
 		 417 aa  427  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000126182  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0523  diaminopimelate decarboxylase  33.42 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  30.88 
 
 		 429 aa  206  9e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  32.42 
 
 		 430 aa  203  6e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0634  diaminopimelate decarboxylase  30.27 
 
 		 433 aa  194  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  32.27 
 
 		 430 aa  193  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1409  diaminopimelate decarboxylase  30.79 
 
 		 406 aa  189  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2159  diaminopimelate decarboxylase  30.73 
 
 		 407 aa  189  7e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2136  diaminopimelate decarboxylase  30.33 
 
 		 398 aa  183  5.0000000000000004e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.509779  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  30.85 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0745  diaminopimelate decarboxylase  32.62 
 
 		 440 aa  180  4e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.300133  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1595  diaminopimelate decarboxylase  29.61 
 
 		 425 aa  180  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2967  diaminopimelate decarboxylase  29.3 
 
 		 409 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2534  diaminopimelate decarboxylase  31.14 
 
 		 416 aa  173  6.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1422  diaminopimelate decarboxylase  31.85 
 
 		 441 aa  172  7.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000179827  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1411  diaminopimelate decarboxylase  34.94 
 
 		 386 aa  172  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0507581  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1275  diaminopimelate decarboxylase  34.68 
 
 		 386 aa  170  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162613  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1364  diaminopimelate decarboxylase  31.09 
 
 		 434 aa  170  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.844058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  34.08 
 
 		 420 aa  169  8e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0681  diaminopimelate decarboxylase  30.66 
 
 		 421 aa  169  9e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.238588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2664  diaminopimelate decarboxylase  28.75 
 
 		 434 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.287942  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3289  diaminopimelate decarboxylase  27.94 
 
 		 410 aa  167  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.721852 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  32.74 
 
 		 416 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  31.44 
 
 		 412 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0227  diaminopimelate decarboxylase  28.05 
 
 		 424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690316  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  32.67 
 
 		 399 aa  164  3e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  33.17 
 
 		 402 aa  163  6e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  30.92 
 
 		 418 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1043  diaminopimelate decarboxylase  33.33 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0359  diaminopimelate decarboxylase  33.17 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.604138  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  31.36 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2086  diaminopimelate decarboxylase  29.46 
 
 		 447 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000557843  normal  0.888186 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1010  diaminopimelate decarboxylase  29.68 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.905477 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1588  diaminopimelate decarboxylase  30.84 
 
 		 410 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220702 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  30.07 
 
 		 418 aa  160  5e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1651  diaminopimelate decarboxylase  32.5 
 
 		 402 aa  160  6e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000231454  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  31.5 
 
 		 419 aa  159  6e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  30.75 
 
 		 423 aa  159  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  31.92 
 
 		 434 aa  159  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08531  diaminopimelate decarboxylase  27.57 
 
 		 406 aa  159  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2077  diaminopimelate decarboxylase  30.14 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0728152 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0207  diaminopimelate decarboxylase  31.39 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0515  diaminopimelate decarboxylase  31.97 
 
 		 436 aa  158  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.843079  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  30.54 
 
 		 419 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3663  diaminopimelate decarboxylase  30.24 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.555835  normal  0.514134 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1362  diaminopimelate decarboxylase  33.89 
 
 		 401 aa  157  4e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.884156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3158  diaminopimelate decarboxylase  27.76 
 
 		 420 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.856232  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3024  diaminopimelate decarboxylase  27.53 
 
 		 420 aa  156  7e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02686  diaminopimelate decarboxylase, PLP-binding  27.53 
 
 		 420 aa  156  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0852  diaminopimelate decarboxylase  27.53 
 
 		 420 aa  156  8e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2986  diaminopimelate decarboxylase  27.76 
 
 		 420 aa  156  8e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0454398 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0877  diaminopimelate decarboxylase  27.53 
 
 		 420 aa  156  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2985  diaminopimelate decarboxylase  27.53 
 
 		 420 aa  156  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02647  hypothetical protein  27.53 
 
 		 420 aa  156  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0468  diaminopimelate decarboxylase  30.62 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4107  diaminopimelate decarboxylase  27.96 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.475873  hitchhiker  0.000027959 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  29.83 
 
 		 425 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1645  diaminopimelate decarboxylase  29.15 
 
 		 416 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  31.14 
 
 		 412 aa  155  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1775  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  29.74 
 
 		 859 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  32.66 
 
 		 401 aa  154  4e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1774  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  29.6 
 
 		 859 aa  153  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  32.67 
 
 		 407 aa  153  5.9999999999999996e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3940  diaminopimelate decarboxylase  29.48 
 
 		 461 aa  152  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0447  diaminopimelate decarboxylase  32.03 
 
 		 436 aa  153  7e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.7159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0425  diaminopimelate decarboxylase  31.86 
 
 		 393 aa  152  7e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2425  diaminopimelate decarboxylase  29.06 
 
 		 461 aa  152  8e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.131973  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1914  diaminopimelate decarboxylase  28.22 
 
 		 438 aa  152  8.999999999999999e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0732  diaminopimelate decarboxylase  30.62 
 
 		 443 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0790  diaminopimelate decarboxylase  27.21 
 
 		 385 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.867864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  30.13 
 
 		 878 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_475  diaminopimelate decarboxylase  29.55 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2242  diaminopimelate decarboxylase  28.4 
 
 		 439 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0241935  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0209  diaminopimelate decarboxylase  27.96 
 
 		 412 aa  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158356  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1348  diaminopimelate decarboxylase  29.5 
 
 		 416 aa  150  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000478718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1553  diaminopimelate decarboxylase  28.68 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144272  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1109  diaminopimelate decarboxylase  27.54 
 
 		 418 aa  150  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0406  diaminopimelate decarboxylase  28.26 
 
 		 445 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809401  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0534  diaminopimelate decarboxylase  29.07 
 
 		 434 aa  150  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0382  diaminopimelate decarboxylase  28.82 
 
 		 439 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1818  diaminopimelate decarboxylase  28.61 
 
 		 431 aa  150  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0661432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1648  diaminopimelate decarboxylase  29.46 
 
 		 417 aa  149  7e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420158  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  30.57 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0510  diaminopimelate decarboxylase  29.07 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1141  diaminopimelate decarboxylase  27.32 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3836  diaminopimelate decarboxylase  28.6 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3040  diaminopimelate decarboxylase  31.54 
 
 		 421 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>