32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0594 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0594  hypothetical protein  100 
 
 
528 aa  1107    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000341283  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1607  CRISPR-associated protein, Cse1 family  50.76 
 
 
534 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.982851 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1380  hypothetical protein  42.94 
 
 
532 aa  413  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0528526  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2479  CRISPR-associated protein, Cse1 family  41.55 
 
 
539 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0957  hypothetical protein  40.19 
 
 
521 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2984  CRISPR-associated Cse1 family protein  39.64 
 
 
529 aa  352  1e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3137  Cse1 family CRISPR-associated protein  38.79 
 
 
518 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.199062  normal  0.768115 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3062  CRISPR-associated Cse1 family protein  38.03 
 
 
520 aa  336  7e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3254  crispr-associated protein, Cse1 family  38.4 
 
 
518 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.552745 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00866  CRISPR-associated protein, Cse1 family  39.11 
 
 
535 aa  334  2e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.046079  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0227  hypothetical protein  36.38 
 
 
564 aa  333  3e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4013  CRISPR-associated protein, Cse1 family  38.03 
 
 
520 aa  330  4e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.246071  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3547  CRISPR-associated Cse1 family protein  35.94 
 
 
534 aa  328  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.061728 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2888  CRISPR-associated Cse1 family protein  38.03 
 
 
520 aa  327  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.447574  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0427  CRISPR-associated protein, Cse1 family  35.96 
 
 
546 aa  320  3.9999999999999996e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00538764  normal  0.144998 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3071  crispr-associated protein, Cse1 family  35.89 
 
 
519 aa  306  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0864  hypothetical protein  33.39 
 
 
534 aa  295  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5414  CRISPR-associated protein, Cse1 family  37.4 
 
 
560 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3097  crispr-associated protein, Cse1 family  34.48 
 
 
511 aa  279  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000104629  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0398  CRISPR-associated protein, Cse1 family  35.78 
 
 
523 aa  276  7e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000236732  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3590  CRISPR-associated protein, Cse1 family  38.46 
 
 
511 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1813  CRISPR-associated Cse1 family protein  34.4 
 
 
529 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3315  CRISPR-associated Cse1 family protein  34.07 
 
 
529 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.439764  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0174  CRISPR-associated Cse1 family protein  31.92 
 
 
555 aa  270  7e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3153  CRISPR-associated protein Cse1 family  33.67 
 
 
511 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.670831 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3754  CRISPR-associated protein, Cse1 family  35.13 
 
 
508 aa  259  8e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0368406  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1385  hypothetical protein  28.38 
 
 
506 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2899  hypothetical protein  23.12 
 
 
502 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.550415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0928  CRISPR-associated protein, Cse1 family  22.89 
 
 
502 aa  93.6  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0952  hypothetical protein  22.89 
 
 
502 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0650  CRISPR-associated Cse1 family protein  24.47 
 
 
525 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1591  hypothetical protein  25.43 
 
 
488 aa  55.5  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.359365 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>