More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0425 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3721  sodium:proline symporter (proline permease)  65.85 
 
 		 553 aa  706    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0425  Na+/solute symporter  100 
 
 		 530 aa  1053    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0468  Na+/solute symporter  63.12 
 
 		 528 aa  626  1e-178  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280127  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  57.41 
 
 		 533 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1706  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  60.27 
 
 		 533 aa  596  1e-169  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0975  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  60.84 
 
 		 533 aa  595  1e-169  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0971  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  60.65 
 
 		 533 aa  597  1e-169  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1134  Na+/solute symporter  56.61 
 
 		 527 aa  558  1e-157  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  52.9 
 
 		 537 aa  555  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2326  Na+/solute symporter  53.88 
 
 		 520 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1847  Na+/solute symporter  53.88 
 
 		 543 aa  527  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0049  Na+/solute symporter  52.6 
 
 		 543 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0037  Na+/solute symporter  52.21 
 
 		 543 aa  512  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0034  Na+/solute symporter  52.18 
 
 		 543 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.404882  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1337  sodium/proline symporter (proline permease)  51.81 
 
 		 531 aa  501  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1063  hypothetical protein  53.83 
 
 		 526 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.771513 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0408  Na+/proline symporter-like protein  78.08 
 
 		 377 aa  291  3e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.76 
 
 		 504 aa  189  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  26.12 
 
 		 492 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  26.48 
 
 		 492 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  26.15 
 
 		 492 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  26.35 
 
 		 487 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  26.2 
 
 		 492 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  26.2 
 
 		 493 aa  177  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  26.2 
 
 		 493 aa  177  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  26.2 
 
 		 493 aa  177  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  26.2 
 
 		 492 aa  177  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  26.54 
 
 		 492 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  29.62 
 
 		 508 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1759  Na+ symporter  29.85 
 
 		 531 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  26.35 
 
 		 492 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  27.55 
 
 		 492 aa  169  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  30.32 
 
 		 498 aa  169  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  30.46 
 
 		 518 aa  168  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  27.55 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  27.55 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  27.55 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  27.36 
 
 		 492 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  27.36 
 
 		 492 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.89 
 
 		 489 aa  167  4e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  26.33 
 
 		 489 aa  166  8e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  27.17 
 
 		 492 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  29.4 
 
 		 496 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  27.41 
 
 		 492 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  25.8 
 
 		 489 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  27.49 
 
 		 492 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  27.53 
 
 		 495 aa  164  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  27.56 
 
 		 488 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  27.92 
 
 		 492 aa  163  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  26.64 
 
 		 485 aa  160  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  28.57 
 
 		 496 aa  159  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2279  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.29 
 
 		 504 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.257788  hitchhiker  0.0000218485 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  27.05 
 
 		 492 aa  158  3e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  26.87 
 
 		 484 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  28.07 
 
 		 506 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  27.7 
 
 		 506 aa  156  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  27.43 
 
 		 511 aa  156  9e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  27.05 
 
 		 492 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  26.67 
 
 		 492 aa  154  5e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  26.37 
 
 		 493 aa  153  8e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  27.92 
 
 		 482 aa  152  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  27.49 
 
 		 499 aa  151  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  26.94 
 
 		 484 aa  151  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3408  sodium/proline symporter  28.27 
 
 		 497 aa  150  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.704891  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4063  sodium/proline symporter  28.27 
 
 		 497 aa  150  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  29.69 
 
 		 498 aa  150  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  27.32 
 
 		 497 aa  150  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  27.24 
 
 		 498 aa  150  7e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  27.06 
 
 		 502 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  26.72 
 
 		 493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  26.52 
 
 		 486 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  26.55 
 
 		 482 aa  147  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  28.03 
 
 		 511 aa  147  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  27.97 
 
 		 512 aa  147  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  27.97 
 
 		 512 aa  147  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  27.44 
 
 		 489 aa  146  9e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01675  proline/sodium symporter  25.67 
 
 		 504 aa  144  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.068924  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  27.19 
 
 		 483 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  27.23 
 
 		 489 aa  144  5e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  26.93 
 
 		 483 aa  143  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4147  sodium/proline symporter  28.11 
 
 		 497 aa  143  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  27.19 
 
 		 483 aa  143  8e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  27.96 
 
 		 493 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  27.23 
 
 		 489 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  26.79 
 
 		 494 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  27.05 
 
 		 488 aa  141  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1860  sodium/proline symporter  29.47 
 
 		 496 aa  140  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0914218  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  28.27 
 
 		 483 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0817  proline permease  30.77 
 
 		 498 aa  139  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0507  Na+/solute symporter  27.58 
 
 		 519 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  28.27 
 
 		 483 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  27.45 
 
 		 492 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  28.27 
 
 		 483 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  26.77 
 
 		 483 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0612  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.16 
 
 		 503 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000214976  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  28.27 
 
 		 483 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5016  proline permease  27.58 
 
 		 495 aa  139  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  27.07 
 
 		 483 aa  139  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0068  Na+/solute symporter  28.89 
 
 		 512 aa  138  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1248  Sodium/proline symporter  28.57 
 
 		 496 aa  139  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>