More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0413 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  100 
 
 
309 aa  619  1e-176  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  68.65 
 
 
311 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  67.65 
 
 
309 aa  401  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  68.18 
 
 
308 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  66.78 
 
 
308 aa  391  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  66.02 
 
 
309 aa  384  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  64.71 
 
 
309 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  66.23 
 
 
309 aa  382  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  64.47 
 
 
308 aa  382  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  65.15 
 
 
308 aa  381  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  62.9 
 
 
311 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  64.63 
 
 
317 aa  381  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  66.12 
 
 
309 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  65.26 
 
 
308 aa  380  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  63.28 
 
 
308 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  65.69 
 
 
314 aa  374  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  61.09 
 
 
317 aa  374  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  64.92 
 
 
310 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  63.04 
 
 
310 aa  371  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  62.09 
 
 
318 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  64.52 
 
 
311 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  62.88 
 
 
312 aa  371  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  63.19 
 
 
310 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  62.79 
 
 
312 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  63.64 
 
 
308 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  62.21 
 
 
308 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  62.99 
 
 
310 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  60.26 
 
 
320 aa  365  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  64.24 
 
 
311 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  62.01 
 
 
309 aa  366  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  56.68 
 
 
311 aa  363  2e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  62.58 
 
 
309 aa  363  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  60 
 
 
309 aa  362  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  61.76 
 
 
311 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  61.44 
 
 
311 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  61.24 
 
 
316 aa  360  2e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  63.88 
 
 
316 aa  360  2e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  59.67 
 
 
309 aa  359  4e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  60.59 
 
 
330 aa  358  8e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  60 
 
 
320 aa  357  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  59.02 
 
 
309 aa  356  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  61.41 
 
 
316 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  63.23 
 
 
309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  57.76 
 
 
304 aa  355  5e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2647  cysteine synthase A  62.95 
 
 
310 aa  355  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100926  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  57.24 
 
 
304 aa  355  5.999999999999999e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  61.59 
 
 
310 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  64.36 
 
 
309 aa  355  7.999999999999999e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  62.75 
 
 
311 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  61.06 
 
 
309 aa  353  2e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  56.31 
 
 
311 aa  353  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  64.03 
 
 
309 aa  353  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  64.52 
 
 
309 aa  353  2.9999999999999997e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  58.67 
 
 
320 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  60.07 
 
 
310 aa  352  5e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  63.02 
 
 
327 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  60.13 
 
 
327 aa  352  7e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  59.74 
 
 
320 aa  351  8e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  61.66 
 
 
309 aa  351  1e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  60.71 
 
 
329 aa  351  1e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  60.46 
 
 
320 aa  350  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  58.44 
 
 
339 aa  348  5e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  61.56 
 
 
328 aa  348  6e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  60.13 
 
 
327 aa  348  7e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  59.28 
 
 
320 aa  348  8e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  58.84 
 
 
317 aa  348  1e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  61.84 
 
 
309 aa  347  1e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  60.52 
 
 
320 aa  347  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  59.09 
 
 
320 aa  347  2e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  57.98 
 
 
328 aa  346  3e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  59.61 
 
 
319 aa  345  4e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  58.96 
 
 
311 aa  345  5e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  57.98 
 
 
308 aa  345  6e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  57.65 
 
 
311 aa  344  8.999999999999999e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  58.12 
 
 
322 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  58.63 
 
 
327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  58.82 
 
 
324 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  60.39 
 
 
320 aa  342  5e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  56.31 
 
 
310 aa  342  5e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  60.78 
 
 
323 aa  342  5e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  60.78 
 
 
319 aa  340  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  59.42 
 
 
321 aa  338  5e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  59.8 
 
 
322 aa  338  5.9999999999999996e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  59.15 
 
 
325 aa  338  7e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  60.06 
 
 
331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  61.97 
 
 
306 aa  336  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  56.07 
 
 
311 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0241  cysteine synthase  57.57 
 
 
315 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  58.12 
 
 
313 aa  335  5e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  56.72 
 
 
311 aa  335  5.999999999999999e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  59.08 
 
 
311 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  58.82 
 
 
326 aa  334  9e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  58.82 
 
 
326 aa  334  9e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  58.88 
 
 
310 aa  334  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  54.28 
 
 
304 aa  334  1e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  60.26 
 
 
320 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  58.88 
 
 
309 aa  333  3e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1893  cysteine synthase A  62.54 
 
 
327 aa  332  4e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.480284  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  60.26 
 
 
320 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  58.36 
 
 
311 aa  331  8e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>