More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0339 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  67.67 
 
 
432 aa  639  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  100 
 
 
433 aa  899  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  67.44 
 
 
433 aa  634  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  58.97 
 
 
429 aa  537  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  58.2 
 
 
429 aa  533  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  58.55 
 
 
423 aa  528  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  57.81 
 
 
430 aa  521  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  57.11 
 
 
428 aa  518  1e-145  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  54.73 
 
 
434 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  55.09 
 
 
435 aa  497  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  54.65 
 
 
433 aa  494  1e-138  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  54.27 
 
 
433 aa  492  1e-138  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  54.27 
 
 
435 aa  489  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  54.97 
 
 
434 aa  485  1e-136  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  52.64 
 
 
435 aa  486  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  52.09 
 
 
433 aa  481  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  55.9 
 
 
438 aa  481  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  53.81 
 
 
434 aa  484  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  52.2 
 
 
432 aa  484  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  53.23 
 
 
434 aa  481  1e-134  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  53.61 
 
 
432 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  51.96 
 
 
433 aa  479  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  53.13 
 
 
434 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  53.41 
 
 
435 aa  475  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  3.76262e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  53.16 
 
 
434 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  53.47 
 
 
439 aa  478  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  53.5 
 
 
433 aa  473  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  51.4 
 
 
432 aa  474  1e-132  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  50.93 
 
 
433 aa  471  1e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  52.42 
 
 
433 aa  468  1e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  50.93 
 
 
433 aa  469  1e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  52.94 
 
 
433 aa  470  1e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  52.69 
 
 
433 aa  466  1e-130  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  50.81 
 
 
434 aa  466  1e-130  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  51.76 
 
 
431 aa  462  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  54.88 
 
 
432 aa  463  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  50.58 
 
 
434 aa  464  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.65841e-12 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  50.35 
 
 
433 aa  461  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  52.57 
 
 
433 aa  463  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  49.3 
 
 
433 aa  461  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  51.5 
 
 
433 aa  460  1e-128  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58285e-15 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  49.88 
 
 
436 aa  461  1e-128  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  51.05 
 
 
434 aa  461  1e-128  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  50.7 
 
 
432 aa  461  1e-128  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  51.64 
 
 
435 aa  455  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  49.42 
 
 
439 aa  455  1e-127  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  50.23 
 
 
433 aa  455  1e-127  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  49.88 
 
 
439 aa  454  1e-127  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  50.47 
 
 
432 aa  457  1e-127  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  51.16 
 
 
435 aa  456  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  51.05 
 
 
432 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  49.42 
 
 
439 aa  455  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  51.27 
 
 
433 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  50.23 
 
 
432 aa  454  1e-126  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  53.35 
 
 
433 aa  453  1e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  50 
 
 
433 aa  454  1e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  50.47 
 
 
432 aa  451  1e-125  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  51.51 
 
 
441 aa  449  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  51.96 
 
 
433 aa  448  1e-125  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  51.64 
 
 
434 aa  451  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  53.13 
 
 
433 aa  446  1e-124  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  48.84 
 
 
433 aa  445  1e-124  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  50.47 
 
 
434 aa  446  1e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  48.83 
 
 
433 aa  442  1e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  50.58 
 
 
436 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  1.90319e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  51.53 
 
 
444 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  48.96 
 
 
436 aa  444  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  50 
 
 
423 aa  443  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  51.18 
 
 
446 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  50.35 
 
 
433 aa  440  1e-122  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  51.17 
 
 
445 aa  440  1e-122  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  51.28 
 
 
443 aa  438  1e-122  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  50.35 
 
 
430 aa  441  1e-122  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  2.41897e-05 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  50.12 
 
 
433 aa  437  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  50.11 
 
 
444 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  51.08 
 
 
444 aa  433  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  48.04 
 
 
430 aa  434  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  47.45 
 
 
436 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  53.72 
 
 
446 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  49.18 
 
 
433 aa  433  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  51.29 
 
 
444 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  47.53 
 
 
432 aa  428  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  46.95 
 
 
432 aa  426  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  52.28 
 
 
441 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  51.8 
 
 
441 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  47.65 
 
 
436 aa  422  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  51.8 
 
 
441 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  50.58 
 
 
440 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  50.82 
 
 
440 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  50.59 
 
 
437 aa  424  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  50.82 
 
 
440 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  50.81 
 
 
439 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2883  phenylacetate-CoA ligase  51.4 
 
 
427 aa  418  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  49.53 
 
 
439 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  50.58 
 
 
437 aa  416  1e-115  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2247  phenylacetate-CoA ligase  50.58 
 
 
437 aa  417  1e-115  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0997438  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  50.12 
 
 
432 aa  416  1e-115  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  50.58 
 
 
437 aa  417  1e-115  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4126  phenylacetate-CoA ligase  50.93 
 
 
440 aa  418  1e-115  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351473  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  50.58 
 
 
437 aa  416  1e-115  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>