More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0303 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  100 
 
 
396 aa  810    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  53.54 
 
 
396 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  45.84 
 
 
381 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  34.79 
 
 
365 aa  192  6e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  31.71 
 
 
390 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  34.34 
 
 
408 aa  177  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  32.23 
 
 
390 aa  177  4e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  32.23 
 
 
390 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  31.59 
 
 
390 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  33.24 
 
 
406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  33.43 
 
 
391 aa  172  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  29.4 
 
 
395 aa  153  5e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  30.93 
 
 
386 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  31.57 
 
 
407 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  29.82 
 
 
391 aa  137  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  30 
 
 
399 aa  137  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  33.24 
 
 
398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  26.33 
 
 
386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  28.88 
 
 
378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  30.48 
 
 
402 aa  131  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  25.6 
 
 
392 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  29.64 
 
 
341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  32.31 
 
 
363 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  25.53 
 
 
385 aa  126  7e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  27.13 
 
 
396 aa  126  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  30.64 
 
 
399 aa  125  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  25.82 
 
 
391 aa  122  8e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  26.6 
 
 
392 aa  122  9e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  29.35 
 
 
360 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  30.66 
 
 
397 aa  119  9e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  27.53 
 
 
398 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  26.81 
 
 
387 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  29.86 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  31.2 
 
 
416 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  28.69 
 
 
382 aa  112  9e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  27.61 
 
 
375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  29.88 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  29.02 
 
 
376 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  32.12 
 
 
380 aa  107  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  27.58 
 
 
376 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  32.25 
 
 
424 aa  106  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25.74 
 
 
384 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  28.57 
 
 
394 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  30.89 
 
 
388 aa  103  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  27.71 
 
 
406 aa  103  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 
394 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  29.89 
 
 
360 aa  100  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  26.72 
 
 
405 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  27.6 
 
 
400 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  26.73 
 
 
457 aa  100  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  28.94 
 
 
407 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  27.78 
 
 
418 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  27.14 
 
 
384 aa  99  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  28.95 
 
 
421 aa  97.8  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  29.66 
 
 
380 aa  97.8  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  28.17 
 
 
380 aa  97.1  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 
399 aa  97.1  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  29.57 
 
 
425 aa  96.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  25.19 
 
 
406 aa  95.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  24.94 
 
 
455 aa  94.4  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  26.18 
 
 
405 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  25.94 
 
 
405 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  28.88 
 
 
394 aa  94  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  28.65 
 
 
379 aa  94  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 
432 aa  93.6  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  28.76 
 
 
419 aa  92.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  28.77 
 
 
361 aa  92  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0349456 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  28.25 
 
 
379 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  27.53 
 
 
406 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  29.26 
 
 
435 aa  90.9  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  26.57 
 
 
400 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 
385 aa  91.3  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  25.83 
 
 
393 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  27.35 
 
 
361 aa  90.5  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.32 
 
 
446 aa  90.5  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  28.25 
 
 
380 aa  90.5  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  28.08 
 
 
408 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  27.53 
 
 
423 aa  89.7  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2172  geranylgeranyl reductase  28.81 
 
 
353 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.328813  decreased coverage  0.000000000712182 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2544  geranylgeranyl reductase family protein  28.81 
 
 
353 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  26.4 
 
 
406 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  24.43 
 
 
414 aa  88.2  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  24.35 
 
 
348 aa  87.4  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  28.25 
 
 
368 aa  87.4  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 
380 aa  87  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.69 
 
 
446 aa  86.7  7e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  23.94 
 
 
452 aa  86.3  9e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  30.13 
 
 
385 aa  86.3  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  27.88 
 
 
430 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  27.15 
 
 
387 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  29.68 
 
 
389 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  25.96 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  29.85 
 
 
445 aa  84.7  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.44 
 
 
446 aa  84.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  27.81 
 
 
418 aa  84  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  27.01 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  25.32 
 
 
393 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  28.22 
 
 
431 aa  83.2  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  28.49 
 
 
398 aa  83.2  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  27.89 
 
 
378 aa  82.8  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>