141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0248 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3114  sterol-regulatory element-binding protein intramembrane protease  55.11 
 
 
598 aa  637    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.896096  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0248  peptidase M50  100 
 
 
584 aa  1172    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000540477  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0172  peptidase M50  36.27 
 
 
518 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3477  peptidase M50  29.4 
 
 
607 aa  249  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1973  peptidase M50  28.73 
 
 
603 aa  228  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.246801  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1508  peptidase M50  31.59 
 
 
612 aa  228  3e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1683  peptidase M50  30.24 
 
 
623 aa  206  7e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.200321  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1292  peptidase M50  28.96 
 
 
587 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.894825  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0314  peptidase M50  28.27 
 
 
512 aa  159  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1942  peptidase M50  30.56 
 
 
432 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.718786 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0964  peptidase M50  29.8 
 
 
459 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0503  peptidase M50  30.5 
 
 
443 aa  128  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1215  peptidase M50  32.5 
 
 
430 aa  124  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.285104  normal  0.0156035 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1487  hypothetical protein  30.13 
 
 
441 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000349158  normal  0.0156065 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0083  peptidase M50  27.37 
 
 
616 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0107  peptidase M50  24.32 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000498394 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0864  peptidase M50  26.24 
 
 
380 aa  72  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  23.23 
 
 
455 aa  71.2  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  23.84 
 
 
439 aa  70.5  0.00000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1066  peptidase M50  22.36 
 
 
364 aa  69.7  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  23.3 
 
 
451 aa  64.3  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1174  peptidase M50  22.73 
 
 
375 aa  64.3  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1169  peptidase M50  23.71 
 
 
375 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0781  peptidase M50  24.4 
 
 
375 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0263  zinc metallopeptidase RseP  21.88 
 
 
450 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0154737  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0245  zinc metallopeptidase RseP  21.88 
 
 
450 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00582579  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0261  zinc metallopeptidase RseP  21.88 
 
 
450 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.522145 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0248  zinc metallopeptidase RseP  21.88 
 
 
450 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0245  zinc metallopeptidase RseP  21.88 
 
 
450 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  25 
 
 
450 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0714  zinc metallopeptidase RseP  21.78 
 
 
450 aa  61.6  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000864253  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  24.68 
 
 
372 aa  60.5  0.00000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  21.4 
 
 
453 aa  60.1  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  24.14 
 
 
438 aa  59.7  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1506  peptidase M50  25.13 
 
 
375 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  23.41 
 
 
450 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  22.15 
 
 
450 aa  58.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0180  zinc metallopeptidase RseP  22.49 
 
 
450 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271457  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.14 
 
 
480 aa  57.4  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  23.83 
 
 
452 aa  57.4  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  23.3 
 
 
454 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2160  peptidase M50  25.34 
 
 
362 aa  56.2  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000514306 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.69 
 
 
450 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0169  zinc metallopeptidase RseP  22.78 
 
 
450 aa  55.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000438283  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  21.73 
 
 
450 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  24.9 
 
 
452 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  22.19 
 
 
450 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  24.27 
 
 
450 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  22.19 
 
 
450 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  22.19 
 
 
450 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  22.19 
 
 
450 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  22.19 
 
 
450 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  24.17 
 
 
451 aa  54.3  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  22.58 
 
 
450 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  22.19 
 
 
450 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  22.73 
 
 
450 aa  53.9  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.5 
 
 
383 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  20.12 
 
 
466 aa  53.5  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2973  zinc metallopeptidase RseP  25.59 
 
 
451 aa  53.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  20.4 
 
 
453 aa  53.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  22.83 
 
 
451 aa  53.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1534  protease ecfE  21.4 
 
 
454 aa  53.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000633641  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1279  putative membrane-associated zinc metallopeptidase  22.59 
 
 
456 aa  52.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.253686  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1020  zinc metallopeptidase RseP  20.7 
 
 
451 aa  52.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073944  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0845  peptidase M50  23.74 
 
 
418 aa  52.4  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.450162  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1073  zinc metallopeptidase RseP  20.7 
 
 
451 aa  52.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00125076  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  21.89 
 
 
450 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  23.57 
 
 
450 aa  52.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3353  zinc metallopeptidase RseP  24.92 
 
 
451 aa  52  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0274947  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  26.69 
 
 
383 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  23.14 
 
 
455 aa  51.6  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  26.94 
 
 
353 aa  51.6  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3158  zinc metallopeptidase RseP  22.87 
 
 
451 aa  51.6  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00293978  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0981  peptidase RseP  25.74 
 
 
443 aa  51.6  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.238067  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  24.32 
 
 
373 aa  51.2  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.81 
 
 
380 aa  51.2  0.00005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3428  zinc metallopeptidase RseP  20.38 
 
 
451 aa  51.2  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000803412  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  28.02 
 
 
383 aa  50.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  19.93 
 
 
428 aa  51.2  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000160258  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2710  putative membrane-associated zinc metalloprotease  20.21 
 
 
444 aa  50.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0608503  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  21.33 
 
 
494 aa  50.4  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  31 
 
 
490 aa  50.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  21.55 
 
 
455 aa  49.7  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  45 
 
 
338 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  44.07 
 
 
342 aa  50.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  22.22 
 
 
335 aa  49.7  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  48.28 
 
 
343 aa  49.3  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  42.37 
 
 
337 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  21.58 
 
 
456 aa  48.9  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  22.98 
 
 
446 aa  48.9  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1367  putative membrane-associated zinc metalloprotease  20.63 
 
 
444 aa  48.9  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0141782 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.44 
 
 
347 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  20.63 
 
 
461 aa  48.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0568  hypothetical protein  21.53 
 
 
450 aa  48.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  25.27 
 
 
377 aa  47.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0534  protease EcfE  21.93 
 
 
459 aa  48.1  0.0005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.196657  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  22.22 
 
 
335 aa  47.8  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4633  membrane-associated zinc metalloprotease  20.87 
 
 
488 aa  48.1  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  22.96 
 
 
469 aa  47.8  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  21.58 
 
 
452 aa  47.8  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>