More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0144 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
354 aa  722    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  59.21 
 
 
367 aa  413  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  49.15 
 
 
360 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  44.19 
 
 
368 aa  311  1e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0622  DNA-directed DNA polymerase  44.86 
 
 
365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  42.74 
 
 
425 aa  279  5e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  41.59 
 
 
393 aa  276  4e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  42.18 
 
 
364 aa  263  2e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  41.81 
 
 
426 aa  263  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0560  DNA polymerase IV  41.48 
 
 
365 aa  258  9e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  41.06 
 
 
481 aa  257  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  41.64 
 
 
410 aa  255  8e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3296  DNA-directed DNA polymerase  38.65 
 
 
399 aa  255  8e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2353  DNA-directed DNA polymerase  39.42 
 
 
413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48043  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  40.7 
 
 
466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3159  DNA-directed DNA polymerase  38.56 
 
 
431 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.382923  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1964  DNA-directed DNA polymerase  38.38 
 
 
425 aa  252  7e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.560205  normal  0.0220335 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2649  DNA-directed DNA polymerase  38.92 
 
 
403 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  40.94 
 
 
412 aa  250  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  39.53 
 
 
378 aa  249  4e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  39.53 
 
 
378 aa  249  4e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  38.53 
 
 
364 aa  248  1e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  39.47 
 
 
420 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  40.73 
 
 
399 aa  247  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  38.53 
 
 
359 aa  247  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  39.18 
 
 
402 aa  246  6e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  38.53 
 
 
367 aa  246  6e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5287  DNA-directed DNA polymerase  37.3 
 
 
437 aa  245  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  41.18 
 
 
384 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  40.11 
 
 
386 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1323  DNA-directed DNA polymerase  37.53 
 
 
416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3696  DNA-directed DNA polymerase  38.3 
 
 
422 aa  243  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0931583  normal  0.897611 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  39.03 
 
 
389 aa  242  6e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0937  DNA-directed DNA polymerase  38.74 
 
 
436 aa  242  7.999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1234  DNA-directed DNA polymerase  38.92 
 
 
396 aa  241  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0949  DNA-directed DNA polymerase  37.88 
 
 
385 aa  241  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.868276  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  40.56 
 
 
415 aa  241  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  38.35 
 
 
372 aa  239  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  39.58 
 
 
410 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2123  UMUC-like DNA-repair protein  39.17 
 
 
387 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48636  hitchhiker  0.00329078 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  37.82 
 
 
391 aa  238  2e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2071  DNA-directed DNA polymerase  37.78 
 
 
348 aa  237  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  35.84 
 
 
369 aa  237  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1647  DNA-directed DNA polymerase  36.05 
 
 
432 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  37.61 
 
 
409 aa  236  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  38.35 
 
 
356 aa  236  3e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  38.16 
 
 
392 aa  237  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  40 
 
 
359 aa  237  3e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  37.65 
 
 
374 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3545  UMUC-like DNA-repair protein  37.78 
 
 
393 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5871  DNA-directed DNA polymerase  37.02 
 
 
381 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.937041  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37100  DNA polymerase IV  38.44 
 
 
353 aa  235  9e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  40.3 
 
 
385 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  37.9 
 
 
409 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  38.08 
 
 
385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  38.35 
 
 
390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  39.15 
 
 
355 aa  233  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  38.27 
 
 
834 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1128  DNA polymerase IV  37.54 
 
 
429 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456598  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  37.94 
 
 
369 aa  233  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  39.07 
 
 
430 aa  233  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  38.6 
 
 
390 aa  232  6e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  37.01 
 
 
356 aa  231  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3394  DNA polymerase IV  38.55 
 
 
364 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320161  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2179  DNA polymerase IV  37.29 
 
 
405 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288104  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  37.03 
 
 
371 aa  230  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1555  DNA-directed DNA polymerase  39.05 
 
 
422 aa  229  4e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.558973  normal  0.0210398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  37.28 
 
 
406 aa  228  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4587  DNA polymerase IV  39.36 
 
 
349 aa  228  9e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.099232  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  37.2 
 
 
419 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52310  DNA polymerase IV  39.36 
 
 
349 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.88026 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  38.71 
 
 
408 aa  227  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  36.52 
 
 
407 aa  227  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5448  DNA polymerase IV  37.18 
 
 
379 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3123  DNA-directed DNA polymerase  36.66 
 
 
384 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2067  DNA-directed DNA polymerase  37.4 
 
 
388 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0860005  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  35.69 
 
 
369 aa  227  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  39.66 
 
 
408 aa  227  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2675  DNA polymerase IV  37.05 
 
 
406 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1727  DNA polymerase IV  37.05 
 
 
404 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2619  DNA polymerase IV  37.05 
 
 
403 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  37.78 
 
 
425 aa  227  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2052  DNA polymerase IV  37.54 
 
 
407 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217696  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  36.21 
 
 
385 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2236  DNA polymerase IV  37.05 
 
 
400 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.783166  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2751  DNA polymerase IV  37.05 
 
 
404 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1508  DNA polymerase IV  37.05 
 
 
400 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408147  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3083  DNA polymerase IV  37.05 
 
 
400 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  39.12 
 
 
385 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  39.59 
 
 
422 aa  226  7e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  38.53 
 
 
345 aa  225  9e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2776  DNA-directed DNA polymerase  37.32 
 
 
417 aa  224  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285612  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  37.69 
 
 
419 aa  225  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  36.99 
 
 
383 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  36.99 
 
 
361 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  36.99 
 
 
408 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  36.92 
 
 
378 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  38.55 
 
 
424 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2466  UMUC domain protein DNA-repair protein  36.62 
 
 
476 aa  224  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.666562  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  36.26 
 
 
395 aa  224  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>