More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0141 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0918  signal recognition particle protein Srp54  75.4 
 
 		 443 aa  679    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0141  signal recognition particle protein Srp54  100 
 
 		 439 aa  887    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0369  signal recognition particle protein Srp54  65.91 
 
 		 444 aa  611  9.999999999999999e-175  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0544  signal recognition particle protein Srp54  60.5 
 
 		 440 aa  557  1e-157  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0717053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1964  signal recognition particle protein Srp54  62.13 
 
 		 443 aa  557  1e-157  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1474  signal recognition particle protein Srp54  59.73 
 
 		 446 aa  545  1e-154  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  decreased coverage  0.000118802 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3023  signal recognition particle protein Srp54  59.5 
 
 		 437 aa  536  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1877  signal recognition particle protein Srp54  58.77 
 
 		 441 aa  535  1e-151  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.189511 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1261  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  55.96 
 
 		 469 aa  486  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1802  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  54.4 
 
 		 464 aa  473  1e-132  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0496  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  53.64 
 
 		 464 aa  467  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.50914 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1226  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  54.4 
 
 		 468 aa  456  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0260  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  54.63 
 
 		 463 aa  456  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0865  signal recognition particle protein Srp54  51.12 
 
 		 450 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0440978  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1260  signal recognition particle protein Srp54  50.11 
 
 		 450 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1119  signal recognition particle protein Srp54  49.55 
 
 		 450 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.227466  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0799  signal recognition particle protein Srp54  49.55 
 
 		 450 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0025  signal recognition particle protein Srp54  49.78 
 
 		 450 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205386  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0917  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  49.2 
 
 		 449 aa  426  1e-118  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000000145882  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0531  GTP-binding signal recognition particle  45.84 
 
 		 442 aa  375  1e-103  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.18 
 
 		 446 aa  362  7.0000000000000005e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.941567  normal  0.290924 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0597  GTP-binding signal recognition particle  40.85 
 
 		 433 aa  347  3e-94  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000223356  hitchhiker  0.00000371893 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0296  GTP-binding signal recognition particle  40.18 
 
 		 449 aa  343  2.9999999999999997e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000583511  normal  0.0555503 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0502  GTP-binding signal recognition particle  41.22 
 
 		 431 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0747031  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1769  GTP-binding signal recognition particle  41.27 
 
 		 433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0023858 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1726  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.21 
 
 		 431 aa  330  2e-89  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.878395 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1519  GTP-binding signal recognition particle  39.91 
 
 		 433 aa  330  4e-89  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.262746  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1950  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  41.23 
 
 		 447 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910344  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26018  IISP family transporter: Signal recognition particle 54 kDa protein (SRP54)  39.42 
 
 		 513 aa  318  1e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  40.51 
 
 		 443 aa  316  7e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  40.4 
 
 		 521 aa  313  3.9999999999999997e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  41.09 
 
 		 448 aa  311  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  41.15 
 
 		 446 aa  310  2e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  39.82 
 
 		 476 aa  308  1.0000000000000001e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  42.21 
 
 		 435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13417  predicted protein  39.64 
 
 		 510 aa  306  5.0000000000000004e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  39.82 
 
 		 433 aa  306  7e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  39.36 
 
 		 433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  39.11 
 
 		 444 aa  301  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  39.49 
 
 		 479 aa  300  4e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  38.84 
 
 		 444 aa  299  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73416  Signal recognition particle 54 kDa protein  39.78 
 
 		 561 aa  299  7e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0128602 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.15 
 
 		 447 aa  299  8e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  38.11 
 
 		 447 aa  299  8e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  39.95 
 
 		 444 aa  298  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.7 
 
 		 507 aa  298  1e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  38.93 
 
 		 446 aa  296  4e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  38.71 
 
 		 450 aa  296  6e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  38.75 
 
 		 445 aa  296  6e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  39.01 
 
 		 446 aa  296  7e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.59 
 
 		 481 aa  295  9e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  39.29 
 
 		 520 aa  295  1e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  40.37 
 
 		 443 aa  294  2e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  37.78 
 
 		 449 aa  294  3e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.98 
 
 		 512 aa  293  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  38.8 
 
 		 450 aa  293  6e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  36.16 
 
 		 441 aa  291  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1725  signal recognition particle protein  40.45 
 
 		 518 aa  291  1e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.862121  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  37.56 
 
 		 442 aa  291  2e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  36.47 
 
 		 449 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  38.44 
 
 		 453 aa  290  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0645  signal recognition particle protein  39.42 
 
 		 434 aa  290  3e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.196271  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  38.3 
 
 		 449 aa  290  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1538  signal recognition particle protein  37.99 
 
 		 436 aa  290  3e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000016303  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0845  signal recognition particle protein  40.36 
 
 		 453 aa  290  4e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  38.48 
 
 		 449 aa  290  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  40.38 
 
 		 454 aa  290  4e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  40.38 
 
 		 454 aa  290  4e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08246  hypothetical protein similar to srpA gene product (Broad)  37.8 
 
 		 542 aa  289  6e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0951188 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  38.07 
 
 		 449 aa  289  7e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  38.07 
 
 		 449 aa  289  7e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  38.07 
 
 		 449 aa  289  7e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  38.07 
 
 		 449 aa  289  7e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.01 
 
 		 447 aa  289  7e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2836  signal recognition particle protein  38.2 
 
 		 447 aa  289  7e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.533211  decreased coverage  0.000777787 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  38.07 
 
 		 449 aa  289  7e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  39.27 
 
 		 444 aa  289  7e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  39.26 
 
 		 449 aa  289  8e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  37.84 
 
 		 449 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  37.84 
 
 		 449 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  38.19 
 
 		 455 aa  288  2e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  37.1 
 
 		 439 aa  287  2e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  39.15 
 
 		 469 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  38.17 
 
 		 446 aa  287  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1338  signal recognition particle protein  38.17 
 
 		 452 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  38.25 
 
 		 449 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  38.25 
 
 		 449 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.64 
 
 		 454 aa  287  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0181  signal recognition particle protein  38.8 
 
 		 491 aa  286  5.999999999999999e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.81 
 
 		 490 aa  286  5.999999999999999e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.34 
 
 		 449 aa  286  5.999999999999999e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  37.84 
 
 		 449 aa  286  7e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.21 
 
 		 491 aa  285  9e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03630  Signal recognition particle 54 kDa protein, putative  37.82 
 
 		 591 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.641738  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  37.27 
 
 		 463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  37.67 
 
 		 485 aa  285  2.0000000000000002e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4178  signal recognition particle protein  37.73 
 
 		 488 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf350  signal recognition particle  38.39 
 
 		 441 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.826641  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.1 
 
 		 443 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  38.84 
 
 		 453 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>