More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0101 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0101  thioredoxin reductase  100 
 
 
306 aa  613  1e-175  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.386376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2898  thioredoxin reductase (NADPH)  54.9 
 
 
309 aa  330  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611748  hitchhiker  0.00113285 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  47.85 
 
 
323 aa  290  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  48.51 
 
 
340 aa  290  2e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  48.68 
 
 
304 aa  286  4e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  45.72 
 
 
304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  46.86 
 
 
321 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  46.86 
 
 
321 aa  280  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  46.86 
 
 
321 aa  280  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  46.86 
 
 
318 aa  280  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  46.86 
 
 
318 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  46.86 
 
 
318 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  46.86 
 
 
318 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  47.19 
 
 
318 aa  279  5e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  47.02 
 
 
311 aa  278  7e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  46.05 
 
 
306 aa  278  8e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  45.97 
 
 
317 aa  278  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  45.97 
 
 
317 aa  276  3e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  46.86 
 
 
318 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  45.21 
 
 
318 aa  275  8e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  47.39 
 
 
315 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  47.06 
 
 
318 aa  272  6e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  46.2 
 
 
318 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  45.07 
 
 
309 aa  269  4e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  46 
 
 
309 aa  268  5.9999999999999995e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  44.97 
 
 
396 aa  267  2e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  44.48 
 
 
306 aa  266  4e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  43.42 
 
 
311 aa  263  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  44.37 
 
 
311 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  44.37 
 
 
311 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  44.93 
 
 
409 aa  260  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  43.19 
 
 
304 aa  259  4e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  42.9 
 
 
310 aa  258  1e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  44.04 
 
 
308 aa  256  3e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  43.79 
 
 
312 aa  256  5e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  45.97 
 
 
308 aa  255  6e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  44.52 
 
 
308 aa  255  7e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  45.31 
 
 
312 aa  254  9e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  46.2 
 
 
320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  44.16 
 
 
317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  44.22 
 
 
310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  42.86 
 
 
306 aa  251  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  44.04 
 
 
311 aa  250  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  41.2 
 
 
306 aa  247  2e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  41.33 
 
 
306 aa  246  3e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.67 
 
 
427 aa  245  6e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  45.79 
 
 
316 aa  243  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  41 
 
 
334 aa  243  3e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1736  thioredoxin reductase  46.03 
 
 
307 aa  242  5e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000141023  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  42.58 
 
 
320 aa  242  6e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  47.84 
 
 
325 aa  241  9e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  44.44 
 
 
326 aa  241  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0860  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.5 
 
 
403 aa  239  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828046  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  44.44 
 
 
308 aa  238  8e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0785  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  44.98 
 
 
556 aa  238  8e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182954  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0211  thioredoxin reductase  42.43 
 
 
343 aa  238  1e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.07 
 
 
579 aa  236  4e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.46 
 
 
407 aa  234  9e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0743  thioredoxin reductase  44.12 
 
 
317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000408634  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  41.78 
 
 
312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  41.78 
 
 
312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.74 
 
 
305 aa  233  3e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  41.75 
 
 
334 aa  231  9e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0566  thioredoxin reductase  40.92 
 
 
313 aa  231  9e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.302989  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  43.85 
 
 
304 aa  231  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  42.39 
 
 
321 aa  230  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  43.04 
 
 
327 aa  230  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  42.43 
 
 
310 aa  229  4e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  42.38 
 
 
324 aa  228  7e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0553  thioredoxin reductase  44.41 
 
 
316 aa  228  8e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  43.09 
 
 
335 aa  228  8e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  43.61 
 
 
555 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  42.21 
 
 
318 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0210  AhpF family protein/thioredoxin reductase  42.86 
 
 
550 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.018  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  43.95 
 
 
361 aa  227  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  42.95 
 
 
333 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  42.02 
 
 
330 aa  225  7e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  42.95 
 
 
333 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  42.95 
 
 
333 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  40.2 
 
 
318 aa  225  9e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1340  thioredoxin reductase  45.49 
 
 
306 aa  225  9e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.125103  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  42.67 
 
 
345 aa  224  9e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  40.26 
 
 
310 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  42.16 
 
 
304 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  40.98 
 
 
310 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  42.9 
 
 
320 aa  223  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  43.65 
 
 
308 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0223  thioredoxin reductase  38.71 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0907  Thioredoxin-disulfide reductase  39.1 
 
 
547 aa  221  9.999999999999999e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000675051  normal  0.496773 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  38.03 
 
 
310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  41.56 
 
 
313 aa  219  3e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1869  thioredoxin reductase  40.19 
 
 
314 aa  220  3e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0723907  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  42.39 
 
 
336 aa  220  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  42.07 
 
 
331 aa  219  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  42.49 
 
 
324 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3874  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.1 
 
 
548 aa  219  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.697389  normal  0.0433305 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  42.02 
 
 
348 aa  219  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.26 
 
 
306 aa  218  7e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  39.55 
 
 
332 aa  218  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  40.46 
 
 
319 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>