More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0096 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  100 
 
 
411 aa  849    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2609  mRNA 3-end processing factor  59.7 
 
 
397 aa  501  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1893  beta-lactamase domain protein  43.51 
 
 
411 aa  333  4e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411885  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0378  beta-lactamase domain protein  41.49 
 
 
411 aa  323  3e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.834555  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1313  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40 
 
 
432 aa  317  3e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1796  beta-lactamase domain protein  41.09 
 
 
414 aa  315  9e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.99 
 
 
410 aa  312  6.999999999999999e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3402  beta-lactamase domain protein  39.86 
 
 
429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  40.5 
 
 
432 aa  292  7e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  38.05 
 
 
433 aa  273  6e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  38.05 
 
 
433 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  37.59 
 
 
433 aa  266  4e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  36.66 
 
 
433 aa  263  6e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  35.78 
 
 
422 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  35.36 
 
 
421 aa  251  2e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 
428 aa  242  7e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1600  beta-lactamase domain-containing protein  32.7 
 
 
421 aa  241  2e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0760665 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1989  beta-lactamase domain-containing protein  36.53 
 
 
422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.881158  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1548  beta-lactamase domain-containing protein  34.75 
 
 
425 aa  234  3e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00297769  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  34.58 
 
 
425 aa  230  3e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  35.6 
 
 
426 aa  224  2e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  32.64 
 
 
428 aa  219  7e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  33.57 
 
 
422 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  33.8 
 
 
422 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  33.8 
 
 
422 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0558  beta-lactamase domain-containing protein  34.86 
 
 
430 aa  215  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00303127 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  34.91 
 
 
635 aa  207  3e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  33.7 
 
 
639 aa  206  8e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  32.97 
 
 
635 aa  205  9e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  32.94 
 
 
421 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 
639 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  32.81 
 
 
629 aa  199  9e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  33.19 
 
 
630 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  32.31 
 
 
635 aa  196  7e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  31.19 
 
 
642 aa  196  7e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  32.25 
 
 
647 aa  196  7e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  31.49 
 
 
636 aa  195  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  31.76 
 
 
630 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  32.53 
 
 
635 aa  190  4e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  32.53 
 
 
635 aa  189  7e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  31.44 
 
 
635 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  30.53 
 
 
637 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  30.82 
 
 
635 aa  188  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  31.08 
 
 
821 aa  187  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  32.75 
 
 
635 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  30.13 
 
 
640 aa  182  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  32.03 
 
 
634 aa  181  2e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  29.78 
 
 
641 aa  179  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  30.04 
 
 
644 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  32.46 
 
 
640 aa  178  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  29.31 
 
 
644 aa  176  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  29.33 
 
 
641 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  32.1 
 
 
646 aa  173  5.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  30.67 
 
 
636 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  32.6 
 
 
634 aa  172  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 
465 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 
636 aa  159  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1910  beta-lactamase domain protein  28.92 
 
 
652 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000293974  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  28.36 
 
 
462 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.3 
 
 
467 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.32 
 
 
465 aa  155  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  28.32 
 
 
460 aa  155  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  28.93 
 
 
468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  30.79 
 
 
452 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  27.13 
 
 
468 aa  151  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
830 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  29.87 
 
 
468 aa  150  5e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  28.41 
 
 
455 aa  150  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 
464 aa  150  6e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  28.48 
 
 
634 aa  149  8e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.32 
 
 
455 aa  146  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  28.54 
 
 
454 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3227  beta-lactamase domain-containing protein  28.54 
 
 
454 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500383  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.06 
 
 
471 aa  145  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2692  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.21 
 
 
450 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0719706  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  30.18 
 
 
457 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  28.81 
 
 
470 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  28.01 
 
 
452 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  26.75 
 
 
453 aa  143  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2554  beta-lactamase domain protein  28.64 
 
 
667 aa  143  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000946841  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 
461 aa  143  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  28.04 
 
 
454 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  28.98 
 
 
465 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  27.39 
 
 
467 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  27.84 
 
 
465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.98 
 
 
464 aa  140  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  29.28 
 
 
468 aa  140  4.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 
454 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  28.81 
 
 
455 aa  139  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  28.54 
 
 
464 aa  139  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.29 
 
 
452 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.51 
 
 
543 aa  139  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  27.39 
 
 
462 aa  139  7e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  26.76 
 
 
476 aa  139  7e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  27.56 
 
 
454 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  27.93 
 
 
467 aa  139  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  28.3 
 
 
452 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  28.82 
 
 
460 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  29.01 
 
 
452 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  27.57 
 
 
460 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>