232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0091 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0091  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 
53 aa  114  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  77.36 
 
 
496 aa  99  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  58 
 
 
492 aa  71.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  53.33 
 
 
229 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3194  rubredoxin  50.94 
 
 
52 aa  58.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2173  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
415 aa  58.2  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.953962  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1308  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
444 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1245  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.56 
 
 
284 aa  56.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0468502  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0146  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.83 
 
 
52 aa  56.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.497635  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2048  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.17 
 
 
52 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59994e-22 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2480  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.83 
 
 
52 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0272  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.94 
 
 
53 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000689971  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.11 
 
 
227 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0270  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.94 
 
 
53 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460906  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1149  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
444 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.751699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4424  rubrerythrin  54.76 
 
 
237 aa  53.9  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3171  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.19 
 
 
52 aa  53.9  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000167353  normal  0.561512 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2175  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
52 aa  53.9  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81123  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4853  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.55 
 
 
445 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0852064 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4666  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42 
 
 
444 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00796628  normal  0.983667 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0203  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.02 
 
 
52 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2515  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.19 
 
 
53 aa  53.5  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310481  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0972  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.94 
 
 
476 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.425779 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4719  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54 
 
 
60 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.378789 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3188  rubredoxin  55.32 
 
 
52 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  44.68 
 
 
589 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3930  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.94 
 
 
53 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186647 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3344  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.19 
 
 
52 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000210348  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2748  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.78 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2533  rubrerythrin  51.06 
 
 
237 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0037  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.22 
 
 
455 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0757  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
469 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2210  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.62 
 
 
480 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6897  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.08 
 
 
56 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1744  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52 
 
 
60 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4403  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.17 
 
 
55 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.162271 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1443  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.19 
 
 
52 aa  51.2  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0605  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.45 
 
 
54 aa  51.6  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0064851  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2184  rubrerythrin  51.06 
 
 
243 aa  51.2  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1352  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.17 
 
 
59 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.726116 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3592  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.32 
 
 
55 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2653  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.19 
 
 
53 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48490  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.19 
 
 
55 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.552989  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5315  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
55 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5224  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
55 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.573132 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0091  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.94 
 
 
54 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94635  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5363  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
55 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223368 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1052  rubredoxin  51.06 
 
 
52 aa  50.4  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0144051  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1125  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.06 
 
 
53 aa  50.4  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.228048  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0620  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.17 
 
 
52 aa  50.8  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.343902  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0782  rubredoxin  46.94 
 
 
53 aa  50.4  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3222  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.08 
 
 
52 aa  50.4  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.798538  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0630  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  43.75 
 
 
591 aa  50.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123449  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0253  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.98 
 
 
52 aa  50.4  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1284  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.08 
 
 
53 aa  50.1  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000469047  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1253  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.19 
 
 
54 aa  50.1  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698268  hitchhiker  0.00824609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13279  rubredoxin rubB  55.56 
 
 
60 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.610704  normal  0.724934 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1190  putative rubredoxin protein  55.32 
 
 
54 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28841  rubredoxin:rubrerythrin:rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.94 
 
 
235 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1630  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.06 
 
 
54 aa  49.7  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1649  rubrerythrin  48.94 
 
 
238 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.429351 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1538  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.81 
 
 
237 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.029752 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1200  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.32 
 
 
54 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.196829  normal  0.959645 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0562  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.89 
 
 
195 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.146358 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3357  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.06 
 
 
52 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0466  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.94 
 
 
52 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0158  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.92 
 
 
55 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1511  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.81 
 
 
237 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5371  rubredoxin/rubredoxin reductase  44.68 
 
 
461 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0869  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.28 
 
 
52 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000308024  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1492  hypothetical protein  53.06 
 
 
58 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1491  hypothetical protein  53.06 
 
 
58 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2164  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.06 
 
 
52 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001294  rubredoxin-NAD(+) reductase  48.84 
 
 
477 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.956005  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0768  rubredoxin  44.9 
 
 
53 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2935  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.02 
 
 
53 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0677  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.06 
 
 
53 aa  48.9  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000269222  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3672  rubredoxin  53.33 
 
 
57 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459184  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2316  rubredoxin  45.83 
 
 
56 aa  48.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0788  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.94 
 
 
56 aa  48.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22490  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.98 
 
 
53 aa  48.1  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000285186  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1254  rubredoxin  43.14 
 
 
56 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2234  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
221 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000004842  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2626  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0197  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.83 
 
 
55 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.492346 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0101  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.92 
 
 
52 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000330254  hitchhiker  1.93244e-16 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0680  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.92 
 
 
56 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0177  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.15 
 
 
58 aa  47.4  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3286  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.94 
 
 
63 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552771  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70640  rubredoxin 1  48.94 
 
 
55 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0282  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
73 aa  47.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00279479  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2295  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.94 
 
 
51 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000169241  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6128  rubredoxin 1  48.94 
 
 
55 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0916  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
100 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.537464  normal  0.0622882 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0973  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.94 
 
 
52 aa  47.4  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000469593  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0014  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.28 
 
 
52 aa  47  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.25088  normal  0.171003 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0916  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.15 
 
 
59 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602722 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0175  hypothetical protein  49.02 
 
 
51 aa  47  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3080  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.68 
 
 
54 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.3234  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1978  rubredoxin-like  45.83 
 
 
76 aa  46.2  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000953598  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>