256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0089 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0089  SirA-like protein  100 
 
 
73 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.741748  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1739  hypothetical protein  74.67 
 
 
75 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.626352 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  47.06 
 
 
79 aa  61.2  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  47.06 
 
 
79 aa  61.2  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  43.06 
 
 
78 aa  59.7  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04360  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  32.88 
 
 
73 aa  57.4  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145857 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0524  SirA family protein  40.28 
 
 
78 aa  55.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.842922 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  33.33 
 
 
77 aa  55.1  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  35.21 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  35.21 
 
 
75 aa  54.7  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  32.39 
 
 
83 aa  54.7  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  30.56 
 
 
76 aa  54.3  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  34.25 
 
 
86 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4046  SirA-like  36.76 
 
 
84 aa  53.9  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4189  SirA family protein  36.76 
 
 
84 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.388351  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2418  SirA family protein  36.76 
 
 
77 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.753437  hitchhiker  0.000838905 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4162  SirA family protein  36.76 
 
 
84 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0584  SirA family protein  42.25 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.255131  hitchhiker  0.00753187 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  36.99 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2868  hypothetical protein  33.82 
 
 
77 aa  53.5  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0140  SirA family protein  36.51 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1650  SirA family protein  35.29 
 
 
77 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  34.29 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2346  SirA family protein  35.29 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.416048  decreased coverage  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  31.88 
 
 
75 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  35.62 
 
 
82 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  35.29 
 
 
77 aa  52  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3117  hypothetical protein  32.43 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2600  hypothetical protein  32.43 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2715  SirA family protein  32.43 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000196179 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2228  SirA family protein  32.43 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0858  SirA family protein  33.82 
 
 
94 aa  51.6  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  33.33 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  33.33 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  37.88 
 
 
199 aa  51.2  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0383  SirA family protein  35.29 
 
 
78 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472232  normal  0.0141536 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  34.29 
 
 
70 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  33.82 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  33.82 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  32.39 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  30.14 
 
 
74 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  30.43 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  32.39 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  32.39 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  29.58 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  28.99 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  30.43 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  32.86 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1319  SirA family protein  34.29 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.514232  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  32.39 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  30.99 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  32.39 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1155  regulatory protein, MarR  31.88 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  29.58 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  32.39 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  32.39 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  28.99 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  37.14 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  31.88 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  32.39 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  29.58 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  32.39 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  32.39 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0830  SirA family protein  37.68 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.183754  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2271  hypothetical protein  32.88 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  27.78 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  29.58 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  29.17 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  29.41 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  36.23 
 
 
73 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  30.56 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  32.88 
 
 
75 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  33.8 
 
 
76 aa  47.8  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  30.43 
 
 
75 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  33.82 
 
 
74 aa  47.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  26.76 
 
 
75 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  33.82 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3809  hypothetical protein  28.77 
 
 
89 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0205  SirA family protein  29.17 
 
 
81 aa  47.4  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  28.99 
 
 
75 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  28.99 
 
 
75 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  32.86 
 
 
70 aa  47.4  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  28.99 
 
 
75 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3897  hypothetical protein  28.77 
 
 
89 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  28.99 
 
 
75 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  28.99 
 
 
75 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  32.86 
 
 
76 aa  47  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0642  hypothetical protein  28.77 
 
 
89 aa  47  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0393171 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  32.39 
 
 
81 aa  47  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1709  hypothetical protein  30.14 
 
 
77 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0828513 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  29.41 
 
 
80 aa  47  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  27.69 
 
 
75 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  28.17 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1154  hypothetical protein  30.14 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00380389  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2030  hypothetical protein  30.14 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3724  SirA-like  30.77 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2705  hypothetical protein  30.14 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.280893 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2165  hypothetical protein  30.14 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2123  hypothetical protein  30.14 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.574865  normal  0.265989 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  32.88 
 
 
75 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>