21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0087 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2290    97.24 
 
 
689 bp  1215    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1800    96.19 
 
 
682 bp  1140    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1668    97.22 
 
 
683 bp  1203    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1400    100 
 
 
689 bp  1366    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1253    97.66 
 
 
683 bp  1227    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.2115  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1021    95.93 
 
 
664 bp  1102    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1018    96.05 
 
 
683 bp  1140    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0975    97.36 
 
 
683 bp  1211    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.632925  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0087    100 
 
 
689 bp  1366    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0410    98.24 
 
 
683 bp  1259    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3169  hypothetical protein  85.6 
 
 
555 bp  402  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000436228 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0043  hypothetical protein  87.5 
 
 
339 bp  309  6e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000166615  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3161  hypothetical protein  86.19 
 
 
420 bp  305  9e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.446465  hitchhiker  0.00206023 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1329  hypothetical protein  85.91 
 
 
420 bp  297  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.243034  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1325  hypothetical protein  85.91 
 
 
420 bp  297  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00014986  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0042  hypothetical protein  86.14 
 
 
381 bp  244  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000215832  normal  0.0470147 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1328  hypothetical protein  88.52 
 
 
228 bp  224  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.104234  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1324  hypothetical protein  88.52 
 
 
228 bp  224  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000817472  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3162  hypothetical protein  88.04 
 
 
228 bp  216  5.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00204659 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3170  hypothetical protein  87.62 
 
 
126 bp  105  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000334822 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1613    85.71 
 
 
321 bp  48.1  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>