267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0075 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0075  major facilitator transporter  100 
 
 		 343 aa  682    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.884221  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0813  class H tetracycline resistance efflux protein  57.35 
 
 		 449 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1355  major facilitator superfamily MFS_1  40.44 
 
 		 400 aa  237  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.358064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 407 aa  161  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 391 aa  149  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 		 439 aa  143  4e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  34.09 
 
 		 417 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  31.23 
 
 		 408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  33.12 
 
 		 414 aa  126  6e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  31.17 
 
 		 414 aa  126  7e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 411 aa  122  8e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  29.81 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 411 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 434 aa  120  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 416 aa  119  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 386 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3044  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  28.66 
 
 		 411 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  30 
 
 		 428 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  29.81 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  31.8 
 
 		 387 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 421 aa  110  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29931  multidrug ABC transporter  30.45 
 
 		 435 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.910726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 425 aa  109  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  30.17 
 
 		 396 aa  107  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 426 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 453 aa  106  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 405 aa  106  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  29.45 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  29.86 
 
 		 397 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 427 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 398 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 412 aa  102  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 419 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 416 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18861  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  29.08 
 
 		 422 aa  99.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.899402  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 398 aa  99.4  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0530  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 415 aa  99.8  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308388  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 398 aa  99.4  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 398 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 		 423 aa  98.6  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 421 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 406 aa  97.8  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  33.65 
 
 		 424 aa  97.8  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 424 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 444 aa  96.7  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3727  cold shock protein  26.03 
 
 		 413 aa  96.3  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.664331 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  25.4 
 
 		 401 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1788  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  28.76 
 
 		 422 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19051  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  28.43 
 
 		 423 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 421 aa  94  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  27.43 
 
 		 396 aa  94  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  27.43 
 
 		 424 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  27.43 
 
 		 424 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  24.65 
 
 		 422 aa  93.2  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  27.43 
 
 		 399 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  30.41 
 
 		 419 aa  92.8  8e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 		 428 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 426 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 		 396 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 430 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 419 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  26.64 
 
 		 428 aa  91.3  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0731  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 399 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 405 aa  89.7  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1657  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 413 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.992815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 413 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0278  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 399 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1716  major facilitator superfamily transporter  26.81 
 
 		 413 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0762  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 399 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 412 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  26.21 
 
 		 417 aa  87.8  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0682  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 397 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0657  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 397 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 413 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1706  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.20478  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  24.34 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  22.71 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2776  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.978343 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 406 aa  82.8  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0047  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  25.26 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18861  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  28.1 
 
 		 416 aa  79.3  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.779737  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2662  major facilitator superfamily permease  32.94 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  23.13 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  29.17 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>