40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0059 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0059  hypothetical protein  100 
 
 
444 aa  884    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.291896  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0060  hypothetical protein  49.9 
 
 
468 aa  372  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  40.65 
 
 
1118 aa  67.8  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  24.92 
 
 
1356 aa  61.6  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  26.92 
 
 
870 aa  60.5  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  38.66 
 
 
2573 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0714  hypothetical protein  82.14 
 
 
167 aa  59.7  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0513  hypothetical protein  85.19 
 
 
340 aa  57.8  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0649  hypothetical protein  82.76 
 
 
193 aa  57.8  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.011765  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0886  hypothetical protein  82.76 
 
 
208 aa  56.2  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2441  hypothetical protein  73.33 
 
 
193 aa  55.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  37.84 
 
 
3602 aa  53.5  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5066  hypothetical protein  38.71 
 
 
807 aa  53.5  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3754  hypothetical protein  42.03 
 
 
801 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.635488  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1273  PKD repeat-containing protein  73.08 
 
 
275 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  29.57 
 
 
314 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  43.28 
 
 
3191 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  33.88 
 
 
3324 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0886  hypothetical protein  43.94 
 
 
827 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  44.05 
 
 
826 aa  51.6  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  25.71 
 
 
819 aa  51.6  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  43.06 
 
 
1293 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  35.11 
 
 
1989 aa  50.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  33.66 
 
 
907 aa  49.7  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0938  hypothetical protein  35.71 
 
 
586 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000915423  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1502  NHL repeat containing protein  23.93 
 
 
765 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278329 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.79 
 
 
365 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  24.44 
 
 
335 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2003  Ig-like protein  60.71 
 
 
462 aa  47  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0653567  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  37.89 
 
 
983 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2599  hypothetical protein  29.55 
 
 
726 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  29.94 
 
 
1667 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.5 
 
 
311 aa  44.3  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1129  hypothetical protein  31.65 
 
 
224 aa  44.3  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  40 
 
 
775 aa  43.9  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  31.72 
 
 
387 aa  44.3  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0625  hypothetical protein  25.95 
 
 
376 aa  43.9  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.578108  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  24.82 
 
 
1094 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03680  conserved repeat protein  32.31 
 
 
693 aa  43.5  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.158433  normal  0.0107502 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.92 
 
 
752 aa  43.5  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>