More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0049 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1139  NDP-N-acetyl-D-galactosaminuronic acid dehydrogenase  75.16 
 
 
475 aa  746    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1832  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  70.97 
 
 
476 aa  673    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.213554  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0823  nucleotide sugar dehydrogenase  68.84 
 
 
493 aa  648    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.473043  normal  0.732846 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0049  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  100 
 
 
476 aa  970    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2029  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  76.69 
 
 
472 aa  756    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1606  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  69.89 
 
 
477 aa  675    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2140  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  64 
 
 
476 aa  630  1e-179  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.493986 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1238  nucleotide sugar dehydrogenase  35.43 
 
 
437 aa  229  7e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.836268  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0961  nucleotide sugar dehydrogenase  36.34 
 
 
435 aa  223  7e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2117  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.75 
 
 
444 aa  219  7e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.95445  decreased coverage  0.00397041 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0636  nucleotide sugar dehydrogenase  34.8 
 
 
439 aa  219  8.999999999999998e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0575  nucleotide sugar dehydrogenase  36.97 
 
 
432 aa  219  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3256  nucleotide sugar dehydrogenase  35.46 
 
 
437 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4714  nucleotide sugar dehydrogenase  33.41 
 
 
450 aa  216  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1733  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.41 
 
 
427 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.720088 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0178  nucleotide sugar dehydrogenase  30.19 
 
 
427 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4103  nucleotide sugar dehydrogenase  34.62 
 
 
441 aa  211  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0870  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.98 
 
 
427 aa  211  3e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.710609  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0240  nucleotide sugar dehydrogenase  35.07 
 
 
453 aa  210  5e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.836377  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2304  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.24 
 
 
457 aa  209  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2529  nucleotide sugar dehydrogenase  31.14 
 
 
418 aa  207  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000174279 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1584  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.15 
 
 
427 aa  207  4e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260621  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1766  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.82 
 
 
445 aa  206  8e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000194311 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3116  nucleotide sugar dehydrogenase  31.54 
 
 
424 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000525581  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0359  nucleotide sugar dehydrogenase  35.51 
 
 
439 aa  204  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5249  nucleotide sugar dehydrogenase  35.08 
 
 
446 aa  204  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0496  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.33 
 
 
449 aa  202  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0335  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.57 
 
 
434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0353  nucleotide sugar dehydrogenase  32.57 
 
 
434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2474  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.58 
 
 
449 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323827  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0705  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.92 
 
 
438 aa  200  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000613921  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1478  NDP-N-acetyl-D-galactosaminuronic acid dehydrogenase  31.1 
 
 
404 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0138857  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3083  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.69 
 
 
435 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2833  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  34.38 
 
 
448 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1854  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  32.74 
 
 
408 aa  197  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0701839  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1384  nucleotide sugar dehydrogenase  32.39 
 
 
448 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1709  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.83 
 
 
449 aa  197  3e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.676622  normal  0.0907516 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1480  nucleotide sugar dehydrogenase  32.81 
 
 
448 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.4016  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0162  nucleotide sugar dehydrogenase  33.41 
 
 
420 aa  196  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.454835  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5120  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  32.27 
 
 
427 aa  196  9e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5512  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  32.27 
 
 
427 aa  196  9e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5362  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  32.27 
 
 
427 aa  196  9e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  31.03 
 
 
424 aa  196  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0320263  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4967  N-acylmannosamine 1-dehydrogenase (UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase); capsular polysaccharide synthesis enzyme  32.35 
 
 
427 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0376  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.64 
 
 
420 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2396  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.53 
 
 
435 aa  193  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0484  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.3 
 
 
438 aa  192  7e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1530  nucleotide sugar dehydrogenase  31.73 
 
 
449 aa  192  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6488  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.21 
 
 
419 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5563  NDP-N-acetyl-D-galactosaminuronic acid dehydrogenase  33.03 
 
 
427 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3696  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  31.53 
 
 
418 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1553  nucleotide sugar dehydrogenase  32.45 
 
 
440 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4504  nucleotide sugar dehydrogenase  32.81 
 
 
451 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.377712  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1675  nucleotide sugar dehydrogenase  34.3 
 
 
440 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160013  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1952  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase dimerisation  31.36 
 
 
460 aa  191  2.9999999999999997e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.868357 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4292  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.73 
 
 
440 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3939  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.9 
 
 
505 aa  191  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809757  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1016  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  30.93 
 
 
423 aa  191  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.61367  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0023  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.34 
 
 
432 aa  190  5e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576582  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4949  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.66 
 
 
427 aa  189  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.094226  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0149  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.82 
 
 
420 aa  189  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0154  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.82 
 
 
420 aa  189  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1339  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.48 
 
 
434 aa  189  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4278  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.66 
 
 
441 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26760  nucleotide sugar dehydrogenase  33.25 
 
 
416 aa  187  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4451  nucleotide sugar dehydrogenase  34.29 
 
 
441 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3871  nucleotide sugar dehydrogenase  29.93 
 
 
407 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1309  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.04 
 
 
450 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0281238  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1063  nucleotide sugar dehydrogenase  30.51 
 
 
433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4429  nucleotide sugar dehydrogenase  34.07 
 
 
440 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3852  nucleotide sugar dehydrogenase  30.59 
 
 
453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199691  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2529  putative UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  31.25 
 
 
439 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2167  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.02 
 
 
442 aa  183  6e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.959713  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3870  nucleotide sugar dehydrogenase  33.16 
 
 
442 aa  183  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4419  nucleotide sugar dehydrogenase  32.66 
 
 
440 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1299  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.22 
 
 
441 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.165052  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2174  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.6 
 
 
439 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0720947  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1757  nucleotide sugar dehydrogenase  32.6 
 
 
437 aa  181  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2164  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  31.35 
 
 
471 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1229  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  31.97 
 
 
442 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.425997  normal  0.200381 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1051  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  28.75 
 
 
560 aa  179  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0085  nucleotide sugar dehydrogenase  31.32 
 
 
431 aa  178  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.896059 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0442  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  30.07 
 
 
413 aa  178  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4134  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  30.52 
 
 
420 aa  178  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1688  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  31.74 
 
 
418 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.833152  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6019  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  30.36 
 
 
414 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.892071  normal  0.334278 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4151  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  30.52 
 
 
420 aa  177  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1796  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.85 
 
 
431 aa  177  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.101485  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7640  nucleotide sugar dehydrogenase  33.6 
 
 
418 aa  177  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4298  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  30.28 
 
 
420 aa  176  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03665  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronic acid dehydrogenase  30.28 
 
 
420 aa  176  8e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4189  nucleotide sugar dehydrogenase  30.28 
 
 
420 aa  176  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5220  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  30.28 
 
 
420 aa  176  8e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.248678  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4216  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  30.28 
 
 
420 aa  176  8e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03614  hypothetical protein  30.28 
 
 
420 aa  176  8e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4004  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  30.28 
 
 
420 aa  176  8e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3827  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.38 
 
 
438 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.10325  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6764  nucleotide sugar dehydrogenase  32.24 
 
 
456 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0817646  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0487  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  31.21 
 
 
447 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2807  nucleotide sugar dehydrogenase  30.57 
 
 
428 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>