43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0027 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0027  cytidylate kinase  100 
 
 
175 aa  350  8e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000301148  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0083  cytidylate kinase  61.14 
 
 
180 aa  216  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396405  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2227  cytidylate kinase  56.96 
 
 
178 aa  175  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0107  cytidylate kinase  54.49 
 
 
177 aa  171  5.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.233857  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0558  cytidylate kinase  50.87 
 
 
182 aa  166  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.818814  normal  0.184695 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0468  cytidylate kinase  53.8 
 
 
176 aa  164  9e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0270  cytidylate kinase  47.19 
 
 
191 aa  160  7e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1734  cytidylate kinase  47.98 
 
 
192 aa  159  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165208 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2255  cytidylate kinase  45.93 
 
 
191 aa  155  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1495  cytidylate kinase  45.76 
 
 
179 aa  153  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0590  cytidylate kinase  46.24 
 
 
181 aa  153  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1703  cytidylate kinase  50 
 
 
172 aa  150  7e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.784294  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1813  cytidylate kinase  43.93 
 
 
192 aa  148  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147241  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1649  cytidylate kinase  47.8 
 
 
178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.73903  normal  0.997406 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0979  cytidylate kinase  49.06 
 
 
178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0265  cytidylate kinase  47.8 
 
 
178 aa  144  6e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1499  cytidylate kinase  49.04 
 
 
174 aa  141  5e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2321  cytidylate kinase  48.73 
 
 
192 aa  136  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1127  cytidylate kinase  41.77 
 
 
178 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.402231  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1729  cytidylate kinase  37.79 
 
 
184 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000578527 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1945  cytidylate kinase  35.8 
 
 
203 aa  111  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1364  cytidylate kinase  37.82 
 
 
184 aa  110  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.790143  normal  0.0224769 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1751  cytidylate kinase  36.36 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  37.21 
 
 
184 aa  107  6e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0898  cytidylate kinase  40.65 
 
 
181 aa  107  6e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.136521  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  38.85 
 
 
180 aa  104  5e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1254  cytidylate kinase  33.33 
 
 
204 aa  102  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  34.3 
 
 
187 aa  101  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0399  cytidylate kinase  37.21 
 
 
184 aa  100  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185017  normal  0.222549 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0849  cytidylate kinase  33.14 
 
 
180 aa  87.8  7e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1087  cytidylate kinase  35.53 
 
 
187 aa  85.1  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3839  cytidylate kinase-like protein  28.65 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.206028  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1859  hypothetical protein  31.68 
 
 
327 aa  72  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546809  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1866  hypothetical protein  31.87 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.546086  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0405  cytidylate kinase  27.93 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0813  hypothetical protein  26.53 
 
 
188 aa  44.3  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00430101  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2380  adenylate kinase  41.82 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000961521  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  29.63 
 
 
204 aa  43.9  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0311  hypothetical protein  44.44 
 
 
183 aa  42.4  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.677562  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  46.34 
 
 
191 aa  42.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1932  adenylate kinase  47.92 
 
 
214 aa  41.2  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0527  hypothetical protein  42.22 
 
 
183 aa  41.2  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.986919  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2080  cytidylate kinase/ribosomal protein S1  41.03 
 
 
811 aa  41.2  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>