31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0022 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0022  50S ribosomal protein L30P  100 
 
 
153 aa  315  2e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000081539  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0089  50S ribosomal protein L30P  64.71 
 
 
153 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0139632  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2232  50S ribosomal protein L30P  62.09 
 
 
153 aa  197  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17243  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0463  50S ribosomal protein L30P  60.13 
 
 
153 aa  189  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0553  50S ribosomal protein L30P  57.14 
 
 
154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.929713  normal  0.433723 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0102  50S ribosomal protein L30P  54.25 
 
 
153 aa  177  4e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.805904 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0585  50S ribosomal protein L30P  55.56 
 
 
153 aa  174  5e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1707  50S ribosomal protein L30P  54.25 
 
 
151 aa  170  7.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144024  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1405  50S ribosomal protein L30P  52.94 
 
 
154 aa  157  5e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1500  ribosomal protein L30P  46.71 
 
 
158 aa  151  4e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000706329  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0158  50S ribosomal protein L30P  50.72 
 
 
154 aa  135  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0191221  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1253  50S ribosomal protein L30P  50.72 
 
 
154 aa  135  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0343817  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0665  50S ribosomal protein L30P  50.72 
 
 
154 aa  135  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00686954 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1849  ribosomal protein L30P  40.65 
 
 
154 aa  127  8.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.685217 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2313  50S ribosomal protein L30P  43.87 
 
 
154 aa  124  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.156993  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2239  ribosomal protein L30P  42.95 
 
 
155 aa  122  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0231  ribosomal protein L30P  41.67 
 
 
155 aa  122  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2428  50S ribosomal protein L30P  40 
 
 
154 aa  121  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0235  50S ribosomal protein L30P  40.26 
 
 
156 aa  117  6e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0731  50S ribosomal protein L30P  45.65 
 
 
154 aa  115  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125981  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1307  50S ribosomal protein L30P  37.8 
 
 
177 aa  103  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.313332  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0778  50S ribosomal protein L30P  37.58 
 
 
179 aa  102  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1207  50S ribosomal protein L30P  35.15 
 
 
175 aa  94.4  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0314  50S ribosomal protein L30P  37.2 
 
 
176 aa  87.4  6e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1057  50S ribosomal protein L30P  33.73 
 
 
185 aa  85.1  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.022347  hitchhiker  0.0000000491432 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0112  50S ribosomal protein L30P  29.33 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000210294  unclonable  0.000000357235 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1757  ribosomal protein L30P  29.22 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.113984  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0400  50S ribosomal protein L30P  32.62 
 
 
155 aa  61.6  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0676264 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30488  Ribosomal protein L7, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  26.88 
 
 
239 aa  51.2  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.655179 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66370  60S large subunit ribosomal protein  28.22 
 
 
241 aa  47.4  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.78437  normal  0.0538769 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22774  predicted protein  25.47 
 
 
239 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>