34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0013 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0013  30S ribosomal protein S4e  100 
 
 
236 aa  474  1e-133  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000026774  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0098  30S ribosomal protein S4e  63.25 
 
 
235 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00334877  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1716  30S ribosomal protein S4e  48.67 
 
 
233 aa  228  5e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.028053  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0222  Ribosomal protein S4E, central domain protein  41.85 
 
 
235 aa  181  6e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0722  30S ribosomal protein S4e  40.08 
 
 
244 aa  179  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0126662  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1396  30S ribosomal protein S4e  45.34 
 
 
244 aa  178  4.999999999999999e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0576  30S ribosomal protein S4e  41.25 
 
 
242 aa  177  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.255322  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1262  30S ribosomal protein S4e  38.4 
 
 
244 aa  176  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00343319  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0656  30S ribosomal protein S4e  37.97 
 
 
244 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0055669  decreased coverage  0.0000746935 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0167  30S ribosomal protein S4e  37.55 
 
 
244 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0000856142  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0454  30S ribosomal protein S4e  37.45 
 
 
241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0061334  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1509  Ribosomal protein S4E, central domain protein  39.66 
 
 
236 aa  172  5e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  7.86693e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2230  Ribosomal protein S4E, central domain protein  39.47 
 
 
233 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2241  30S ribosomal protein S4e  39.83 
 
 
241 aa  169  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000731595  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2437  30S ribosomal protein S4e  38.16 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0544  30S ribosomal protein S4e  36.96 
 
 
241 aa  160  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.211539  normal  0.284523 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2304  30S ribosomal protein S4e  39.13 
 
 
286 aa  156  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1840  Ribosomal protein S4E, central domain protein  36.18 
 
 
265 aa  150  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0560  30S ribosomal protein S4e  35.47 
 
 
238 aa  146  3e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00212032 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1730  30S ribosomal protein S4e  36.32 
 
 
238 aa  145  6e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.84836  decreased coverage  0.000360603 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0243  30S ribosomal protein S4e  35.17 
 
 
251 aa  143  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1550  30S ribosomal protein S4e  35.47 
 
 
238 aa  143  3e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.199736  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0093  30S ribosomal protein S4e  35.37 
 
 
239 aa  142  5e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.507041 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1832  30S ribosomal protein S4e  35.34 
 
 
237 aa  139  3e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1766  Ribosomal protein S4E, central domain protein  37.62 
 
 
239 aa  137  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0103  30S ribosomal protein S4e  35.29 
 
 
241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000259785  unclonable  0.000000558992 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0798  30S ribosomal protein S4e  35.68 
 
 
238 aa  135  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1747  30S ribosomal protein S4e  33.91 
 
 
237 aa  132  6e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.015598 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18526  Ribosomal protein S4, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  31.47 
 
 
253 aa  115  6e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163807  normal  0.488363 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04794  40S ribosomal protein S4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06840)  30 
 
 
261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17324  predicted protein  30.25 
 
 
261 aa  104  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34143  ribosomal protein S4  30 
 
 
262 aa  100  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79556  predicted protein  30 
 
 
262 aa  100  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.116079 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06200  conserved hypothetical protein  30.32 
 
 
263 aa  98.6  8e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>