101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0003 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0003  50S ribosomal protein L23P  100 
 
 
82 aa  169  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000337619  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0108  50S ribosomal protein L23P  70.73 
 
 
82 aa  127  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1830  50S ribosomal protein L23P  50 
 
 
85 aa  82.4  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.649517 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0444  50S ribosomal protein L23P  47.5 
 
 
82 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0443463  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0534  50S ribosomal protein L23P  44.58 
 
 
83 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.646212  normal  0.481774 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2220  ribosomal protein L23  46.84 
 
 
84 aa  78.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0212  ribosomal protein L23  48.1 
 
 
84 aa  75.1  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0566  50S ribosomal protein L23P  46.25 
 
 
82 aa  72  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0431079  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0083  50S ribosomal protein L23P  41.25 
 
 
82 aa  68.9  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.657611  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2447  50S ribosomal protein L23P  48.19 
 
 
84 aa  69.3  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2251  50S ribosomal protein L23P  40 
 
 
82 aa  67.4  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000000299035  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2294  50S ribosomal protein L23P  43.9 
 
 
87 aa  66.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0228  ribosomal protein L25/L23  42.86 
 
 
90 aa  65.5  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1726  ribosomal protein L25/L23  37.5 
 
 
82 aa  60.8  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0805  50S ribosomal protein L23P  39.51 
 
 
86 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.720418  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1519  ribosomal protein L23  38.16 
 
 
87 aa  55.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000262554  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0807  50S ribosomal protein L25/L23  38.96 
 
 
88 aa  52  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.563432 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  50.88 
 
 
93 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1585  50S ribosomal protein L23P  37.33 
 
 
81 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2048  50S ribosomal protein L23P  36.25 
 
 
82 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.700766 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  41.54 
 
 
95 aa  50.8  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00350  ribosomal protein, putative  37.5 
 
 
154 aa  50.8  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16602  Ribosomal protein L23a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  33.75 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  41.43 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08856  60S ribosomal protein L23 (AFU_orthologue; AFUA_5G05630)  38.27 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  37.33 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0859  50S ribosomal protein L23P  31.71 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.455359  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0793  50S ribosomal protein L23P  31.71 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.110307  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0031  50S ribosomal protein L23P  31.71 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1125  50S ribosomal protein L23P  31.71 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0815  50S ribosomal protein L23P  35 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  32.53 
 
 
94 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  36 
 
 
100 aa  47.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0195  50S ribosomal protein L23  41.51 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  37.33 
 
 
107 aa  47  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  35.63 
 
 
97 aa  47  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  36 
 
 
103 aa  47  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  34.67 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1798  50S ribosomal protein L23P  34.67 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.217622  normal  0.590833 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0093  50S ribosomal protein L23P  35 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000249681  unclonable  0.000000335999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  34.67 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  42 
 
 
96 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  34.67 
 
 
103 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  42.31 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  40 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0315  ribosomal protein L25/L23  40 
 
 
86 aa  44.7  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.997937  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  42 
 
 
95 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  34.48 
 
 
105 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  37.66 
 
 
95 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  45.45 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  44 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  46 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  46 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61259  predicted protein  36.36 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  41.82 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  42.55 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  38.3 
 
 
101 aa  43.9  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  37.35 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4345  Ribosomal protein L25/L23  30.68 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000178584  normal  0.183841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6612  50S ribosomal protein L23  34.15 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0107  50S ribosomal protein L23  40 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000207631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  44 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  46.94 
 
 
91 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0112  50S ribosomal protein L23  40 
 
 
96 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000886787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0112  50S ribosomal protein L23  40 
 
 
96 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000031737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0108  50S ribosomal protein L23  40 
 
 
96 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.29551e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0106  50S ribosomal protein L23  40 
 
 
96 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000563087  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  40 
 
 
96 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000156815  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  31.18 
 
 
99 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 
99 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1481  50S ribosomal protein L23  41.82 
 
 
98 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000124124  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  36.36 
 
 
98 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  40 
 
 
96 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000263853  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0133  50S ribosomal protein L23  40 
 
 
96 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5193  50S ribosomal protein L23  40 
 
 
96 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000262494  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0124  50S ribosomal protein L23  40 
 
 
96 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.40944e-62 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  35 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  37.18 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  37.18 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0604  Ribosomal protein L25/L23  37.04 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  35.37 
 
 
100 aa  41.2  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  41.82 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  38.27 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  44 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  42.55 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0194  Ribosomal protein L25/L23  33.8 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  35.06 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  46 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  46 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3665  ribosomal protein L25/L23  50 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  32.26 
 
 
99 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  37.5 
 
 
103 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3160  50S ribosomal protein L23  41.51 
 
 
95 aa  40.8  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  37.5 
 
 
103 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3756  Ribosomal protein L25/L23  32.93 
 
 
101 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  37.04 
 
 
98 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  33.33 
 
 
100 aa  40  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>