292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0001 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0001  50S ribosomal protein L3P  100 
 
 		 337 aa  689    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0115454  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0110  50S ribosomal protein L3P  66.77 
 
 		 337 aa  486  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2253  50S ribosomal protein L3P  56.76 
 
 		 337 aa  396  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.0000000000233811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0532  50S ribosomal protein L3P  55.79 
 
 		 337 aa  397  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0442  50S ribosomal protein L3P  56.38 
 
 		 337 aa  393  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00631361  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0564  50S ribosomal protein L3P  56.68 
 
 		 337 aa  375  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.415651  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0081  50S ribosomal protein L3P  53.31 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.123311 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1728  50S ribosomal protein L3P  53.55 
 
 		 335 aa  340  2e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2292  50S ribosomal protein L3P  48.08 
 
 		 338 aa  335  5e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1521  ribosomal protein L3  48.84 
 
 		 340 aa  333  3e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000186989  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1828  50S ribosomal protein L3P  47.79 
 
 		 338 aa  332  6e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.752407 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2218  ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 339 aa  332  6e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0857  50S ribosomal protein L3P  47.76 
 
 		 334 aa  331  1e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603922  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2449  50S ribosomal protein L3P  47.49 
 
 		 338 aa  327  1.0000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0210  ribosomal protein L3  48.39 
 
 		 340 aa  325  6e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0033  50S ribosomal protein L3P  47.46 
 
 		 334 aa  322  4e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.555828  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0791  50S ribosomal protein L3P  47.16 
 
 		 334 aa  322  5e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1127  50S ribosomal protein L3P  47.16 
 
 		 334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0807  50S ribosomal protein L3P  45.67 
 
 		 333 aa  315  6e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0091  50S ribosomal protein L3P  42.2 
 
 		 341 aa  262  6.999999999999999e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000432349  hitchhiker  0.00000658147 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0230  50S ribosomal protein L3P  43.58 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1583  50S ribosomal protein L3P  42.18 
 
 		 338 aa  255  7e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1778  ribosomal protein L3  40.17 
 
 		 351 aa  249  4e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.890936  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0317  50S ribosomal protein L3P  41.79 
 
 		 347 aa  249  6e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1796  50S ribosomal protein L3P  40.12 
 
 		 342 aa  245  9e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.483338  normal  0.601736 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0809  50S ribosomal protein L3P  39.46 
 
 		 331 aa  240  2e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5331 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2046  50S ribosomal protein L3P  40.06 
 
 		 338 aa  235  8e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0813  50S ribosomal protein L3P  40 
 
 		 338 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23838  Ribosomal protein L3, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  33.52 
 
 		 386 aa  192  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06202  60S ribosomal protein L3 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV31]  33.43 
 
 		 392 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.123441  normal  0.683069 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02240  large subunit ribosomal protein L3, putative  31.03 
 
 		 390 aa  177  3e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13361  predicted protein  32.84 
 
 		 389 aa  176  7e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88844  60S large subunit ribosomal protein L3.e  32.34 
 
 		 389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000473174 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0873  ribosomal protein L3  27.17 
 
 		 212 aa  68.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339067  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  28.03 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000509154  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  26.07 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  24.73 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  25.18 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  27.07 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  25.94 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  26.32 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0756  50S ribosomal protein L3  25.18 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385888  normal  0.0180173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6721  50S ribosomal protein L3  23.34 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  26.69 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  25.45 
 
 		 214 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  29.37 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  28.06 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  30.23 
 
 		 218 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0059  50S ribosomal protein L3  26.32 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000158228  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0842  ribosomal protein L3  29.79 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  24.24 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000015584  hitchhiker  0.00000758128 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  26.16 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf444  50S ribosomal protein L3  26.6 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  33.61 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  33.61 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  33.61 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  33.61 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  33.61 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  33.61 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  33.61 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  33.61 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2818  50S ribosomal protein L3  24.55 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.469348 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  24.11 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  30.23 
 
 		 213 aa  55.5  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3751  50S ribosomal protein L3  27.07 
 
 		 209 aa  55.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000163503  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  31.78 
 
 		 216 aa  55.5  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  29.82 
 
 		 211 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  27.57 
 
 		 210 aa  55.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  31.5 
 
 		 208 aa  55.8  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0719  ribosomal protein L3  31.3 
 
 		 212 aa  55.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000525785  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  30.83 
 
 		 205 aa  55.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0433  50S ribosomal protein L3  25.27 
 
 		 210 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000241052  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03171  50S ribosomal protein L3  25.56 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00105587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0393  ribosomal protein L3  25.56 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000156822  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  28.99 
 
 		 212 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  31.01 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3514  50S ribosomal protein L3  25.56 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000214725  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3822  50S ribosomal protein L3  25.94 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000994751  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  23.68 
 
 		 209 aa  55.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3615  50S ribosomal protein L3  25.56 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000666979  hitchhiker  0.00609107 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2324  ribosomal protein L3  26.52 
 
 		 215 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000235705  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  27.76 
 
 		 216 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4643  50S ribosomal protein L3  25.56 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000124545  normal  0.0362623 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0393  50S ribosomal protein L3  25.56 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309233  hitchhiker  0.00746366 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3803  50S ribosomal protein L3  25.56 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000338592  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3705  50S ribosomal protein L3  25.56 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030519  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4001  50S ribosomal protein L3  25.94 
 
 		 209 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000133554  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03122  hypothetical protein  25.56 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000891003  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  25.36 
 
 		 210 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  32.77 
 
 		 210 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  26.92 
 
 		 238 aa  54.3  0.000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.499549999999999e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  32.77 
 
 		 210 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  32.77 
 
 		 213 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0494  50S ribosomal protein L3  25.63 
 
 		 215 aa  54.3  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000368377  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  26.32 
 
 		 209 aa  54.3  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0489  50S ribosomal protein L3  26.69 
 
 		 212 aa  53.9  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000109318  normal  0.010086 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  28 
 
 		 210 aa  53.9  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  24.01 
 
 		 214 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_6632  Putative mitochondrial ribosomal protein L3  28.8 
 
 		 211 aa  53.9  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0234782  hitchhiker  0.000000645255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4343  50S ribosomal protein L3  28.68 
 
 		 206 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239943  normal  0.123527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>