23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_R0015 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_R0015  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.233572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0022  tRNA-Ala  95.12 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.836279  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0051  tRNA-Ala  95.12 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0020  tRNA-Ala  95.12 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0039  tRNA-Ala  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0028  tRNA-Ala  91.49 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0048  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143033  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0045  tRNA-Ala  89.8 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0050  tRNA-Ala  89.8 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0035  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.746107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0003  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1719  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778292  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1466  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000000857792  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.34848  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0004  tRNA-Ala  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.554141  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0046  tRNA-Ala  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0022  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0007    100 
 
 		 203 bp  46.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.47571 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0008  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.456159 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0439  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000182942  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0029  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0010  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0059  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0347498 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>